| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2676223 | 66 (0.880) | 4 (0.060) | 4/242 | NT | 5.9% | intergenic (‑46/‑192) | PP_2344/PP_2345 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2676254 | 65 (0.910) | intergenic (‑77/‑161) | PP_2344/PP_2345 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
ACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAGGACTGCTGGTTAATC > NC_002947/2676074‑2676370 | aCCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCA < 1:775433‑M1/150‑1 (MQ=255)aCCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCA < 1:775200‑M1/150‑1 (MQ=255)aCCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCA < 2:58900‑M1/150‑1 (MQ=255) cGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTAc < 2:1610408/150‑1 (MQ=255) cGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCGCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCCGCCTTGTGCTGCCAGAGGCCAtttc < 2:1709284/150‑3 (MQ=255) cGACAGCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTAc > 2:1269494/1‑150 (MQ=255) aCATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTCGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGCCGGGCGCGCGTGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCGGCCTTGTGCTGAGAGGGGCCATTACAg > 1:177833/1‑150 (MQ=255) cATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGa < 1:1369487/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCCTGCAGGCCAAGGTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGTTGGCGCTCATGGAGGGTCTCTTGGGCATAGGATGAGGCTTGTGATGCGAGGGGCGATTATAGAt > 2:889888/1‑150 (MQ=255) cGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATaa > 1:131936/1‑150 (MQ=255) gccgccTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAaca > 2:359427/1‑150 (MQ=255) gccGGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATACGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAacacac < 1:1440884/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTCGCGGGTGTGTCGCAGGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTCGTATCAAATCGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGt < 1:1553432/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGt < 1:359427/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGt > 2:792240/1‑150 (MQ=255) ccACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACa < 2:503597/131‑1 (MQ=255) ccACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACa > 1:503597/1‑131 (MQ=255) cACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTgg < 1:792240/150‑1 (MQ=255) cGCACGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCt < 1:1269494/150‑1 (MQ=255) cgGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATtg > 2:1354415‑M2/1‑148 (MQ=255) cgGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGAGGAGTATTTGATCTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCTGATCTGCGCGGTGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATtg > 1:988316‑M2/1‑148 (MQ=255) gATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATtggc > 2:181164‑M2/1‑146 (MQ=255) gATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATtggc > 2:646655‑M2/1‑146 (MQ=255) gtCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGAGTTTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCttt < 1:1060763/150‑1 (MQ=255) tCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTgg > 2:645721/1‑134 (MQ=255) tCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTgg < 1:645721/134‑1 (MQ=255) tCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTc < 1:1880210/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATaa < 2:1316624/117‑1 (MQ=255) gCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATaa > 1:1316624/1‑117 (MQ=255) cAANGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGACTTGTGAATGAATGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCgca > 2:1204276/1‑150 (MQ=255) aaGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCgcag < 1:1018148/150‑1 (MQ=255) aaGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCgcag < 2:1468004/150‑1 (MQ=255) cACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGcaca > 2:542693/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCCTTGAAGGGGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCGATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAgg < 2:778524/150‑1 (MQ=255) ccggccTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCa < 2:1129788/150‑1 (MQ=255) gggccTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCAc < 2:1111883/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTg > 2:657397/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCAc < 2:3324/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTg < 1:608122/150‑1 (MQ=255) gTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTggg > 1:1696856/1‑150 (MQ=255) ggCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAACACACGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAg > 2:211607/1‑150 (MQ=255) ggggTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGCAGCCTGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCg > 1:19153/1‑150 (MQ=255) gggTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCgg > 1:1629870/1‑150 (MQ=255) gggTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAAGAGGGCGCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCgg < 1:1552493/150‑1 (MQ=255) gggTATTTGATGTGGATGGCGCGCATGGCGGGTCGCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTAGTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCgg < 2:266380/150‑1 (MQ=255) 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gATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCAatacagccacctacaggtgtgttatctg > 2:1861339‑M1/1‑58 (MQ=255) gATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCAatacagccacctacaggtgtgttatctg < 1:1861339‑M1/86‑29 (MQ=255) ggCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTgc < 1:414173/150‑1 (MQ=255) cATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATc < 1:755883/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTgg < 1:295175/116‑1 (MQ=255) aTGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTgg > 2:295175/1‑116 (MQ=255) 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ACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATGGCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACC‑TTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAGGACTGCTGGTTAATC > NC_002947/2676074‑2676370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |