New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2755123 | 56 (0.750) | 4 (0.060) | 7/240 | NT | 6.8% | coding (1406/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
? | NC_002947 | = 2755134 | 56 (0.790) | coding (1417/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
CCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTG > NC_002947/2754977‑2755271 | ccTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GAc > 1:688283/1‑150 (MQ=255) ggCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTAAAAAGAACGTGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCgg < 1:1553239/150‑1 (MQ=37) gCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCggg < 1:1527717/150‑1 (MQ=255) gCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCggg > 2:80795/1‑150 (MQ=255) ccATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGt > 2:226309/1‑150 (MQ=255) cATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTTCCCGCGACGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTc > 1:158956/1‑150 (MQ=255) cATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTcgaccccggt > 2:1290034‑M1/1‑140 (MQ=255) cagcagCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGagggc < 2:697274‑M2/150‑6 (MQ=255) gcagcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGagggcaa > 1:227624‑M2/1‑143 (MQ=255) agcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGa < 2:189653/150‑1 (MQ=255) agcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGa > 1:609517/1‑150 (MQ=255) cgcCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTCgggcaaagat > 1:1298447‑M2/1‑140 (MQ=255) aCGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGACGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTGcc > 1:640938/1‑150 (MQ=255) ggTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTCgggcaaagatcggcag > 1:1290034‑M2/1‑134 (MQ=255) ggTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCAc < 1:929231/150‑1 (MQ=255) ggTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCAc < 1:226309/150‑1 (MQ=255) tGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATgg > 1:1615431/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAc > 2:97638/1‑150 (MQ=255) ggcgAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTg < 2:1538845/150‑1 (MQ=255) cGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATg > 2:1107598/1‑150 (MQ=255) ccATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCt < 1:607661/150‑1 (MQ=255) cATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTCTGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCGAGATGCTCCCCCCTATCGCCTTTACCGTGGTCCTGGCCCtc > 2:800044/1‑149 (MQ=25) aTGAGGTGTGTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGt > 2:1269007/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTCgggcaaagatc > 1:612728‑M2/1‑101 (MQ=255) gAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTCgggcaaagatc < 2:612728‑M2/112‑12 (MQ=255) ttGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCga < 1:491545/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCgatgat < 1:1115672/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GAcc < 2:1585829/75‑1 (MQ=255) cgcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GAcc > 1:1585829/1‑75 (MQ=255) gcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCgg > 1:766622/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGTTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTg < 1:577045/109‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGTTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTg > 2:577045/1‑109 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGgc > 1:1340130/1‑127 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGgc < 2:1340130/127‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAc > 2:393967/1‑147 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAc < 1:393967/147‑1 (MQ=255) cGCCGGCCGCGGATCGATGGGCAGTGGACCACCATGGTGGGGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGTGGGATGTTCCCCCCTATGGCCCAGTCCTGGACCATGGTCCTGTTTGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcgttc < 1:800044/150‑1 (MQ=255) cggccgCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcgttcgtt < 2:609517/150‑1 (MQ=255) aTGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTAGGCGCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTg < 1:1453037/150‑1 (MQ=255) gggCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGcc > 2:691900/1‑150 (MQ=255) aGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt < 2:83959/150‑1 (MQ=255) gTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGtt > 1:551241/1‑150 (MQ=255) ttGATCACCATGGTGGTGTACCTGACCATCTTTGTCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCCCCCCATGGCCTCCCCCGTGGTCACTGCCCTGTTGTGCGTGATGATCCTTTCGGTCATGTTCTTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTc < 2:875732/150‑1 (MQ=255) tcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTcgaccccggtcaggg > 1:1002446‑M1/1‑31 (MQ=255) tcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTcgaccccggtcaggg < 2:1002446‑M1/46‑16 (MQ=255) tcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCg > 2:462663/1‑150 (MQ=255) catGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCgg > 2:1896263/1‑150 (MQ=255) atGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGc > 1:1428720/1‑150 (MQ=255) atGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGc > 1:891050/1‑150 (MQ=255) tggtgTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTAGTCACCGGCAAgg < 2:551241/150‑1 (MQ=255) ggtgTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGt < 2:891050/150‑1 (MQ=255) gtgtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTc > 1:1084544/1‑150 (MQ=255) gtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCaa < 2:1615431/150‑1 (MQ=255) gtACCTGCCGATCTTCGCTTG‑GGTCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCaa < 1:97638/150‑1 (MQ=38) tACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAag < 1:845311/150‑1 (MQ=255) tACCTGCCGATCTTTGCCCC‑GACCGGGATACAGCATAAGATGTTCTTGCCTGTGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAag < 1:1866558/150‑1 (MQ=255) cTGCCGATCTTTGCCCTgaccggggtcgagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctcatggaaccgttcgccgcgggtcagcatgcgacc > 1:1290034‑M1/1‑17 (MQ=255) cTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAg < 2:1595372/141‑1 (MQ=255) cTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAg > 1:1595372/1‑141 (MQ=255) cTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaa > 1:1819100/1‑150 (MQ=255) cTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTAGAGGGCAAGATGTTACACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCAATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaa > 2:832143/1‑150 (MQ=255) tGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag < 1:704820/150‑1 (MQ=255) tGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag > 1:1306885/1‑150 (MQ=255) tGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag > 2:704820/1‑150 (MQ=255) gCCGATCTTCTCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaaga < 1:80795/150‑1 (MQ=255) ccGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGAAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCCaggaagag > 2:1177581/1‑150 (MQ=255) gATCTTTGCCCTgaccggggtcgagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctc > 1:612728‑M1/1‑12 (MQ=255) gATCTTTGCCCTgaccggggtcgagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctc < 2:612728‑M1/112‑101 (MQ=255) gATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagagga > 2:1442014/1‑150 (MQ=255) aTCTTTGCCCTgaccggggtcgagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctcatggaaccgttcgccgcgggtcagcatgcgaccgtggcg > 1:1298447‑M1/1‑11 (MQ=255) tCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagaggaag < 1:1899407/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTcgaccccggtcagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctcatggaaccgttcgccgcgggtcagcatgcgaccgtggcgctgc > 1:227624‑M1/1‑7 (MQ=255) tGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGAGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCt > 2:1442756/1‑150 (MQ=255) gCCCTcgaccccggtcagggcaaagatcggcaggtacaccaccatgatgatcaactgcccatagatcagcggccggcgtgcttcgcgggcagcggcaaacacctcatggaaccgttcgccgcgggtcagcatgcgaccgtggcgctgctg < 2:697274‑M1/150‑146 (MQ=255) cccT‑GACCGGGGTCGagggcaaagatcggcaggtacaccaccatga > 1:1002446‑M2/1‑15 (MQ=255) cccT‑GACCGGGGTCGagggcaaagatcggcaggtacaccaccatga < 2:1002446‑M2/46‑32 (MQ=255) ccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGt > 1:1311416/1‑150 (MQ=255) ccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCATTTACCCTGGCCATGGCTTTGTCGGGAGTGATGATCCGTTCGGTTGCGTTCGTTTCTTCTTGCAGTGCCCTGTTGGTCACTGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGt < 2:688283/150‑1 (MQ=255) ccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCATATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTCTCGGTCACGTTCATTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACAGGCAAGGTCAAGAGAGAGGAAGGcccgtg > 1:317975/1‑146 (MQ=255) cT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTg > 2:1587552/1‑150 (MQ=255) cT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAACGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGGCCTGTTCGGCACCGGCCAGCCCCAGCCAGAGGCAGGCCCggcg > 2:938644/1‑148 (MQ=255) | CCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTG > NC_002947/2754977‑2755271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |