| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 3634872 | 100 (1.370) | coding (1227/2481 nt) | PP_3202 | transporter | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
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ccGGTGCTGCTCTCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATc < 1:376465/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTCTCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGc > 2:1865389/1‑150 (MQ=255) tgctCTCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcg > 1:1579110/1‑150 (MQ=255) ctctCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTgg < 2:196725/126‑1 (MQ=255) ctctCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTgg > 1:196725/1‑126 (MQ=255) tctcCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctg > 2:1814099/1‑150 (MQ=255) tctcCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctg < 2:1795473/150‑1 (MQ=255) tcCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctgcg > 2:1692062/1‑150 (MQ=255) ccTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctgcgc < 2:38300/150‑1 (MQ=255) cTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGc < 1:854039/138‑1 (MQ=255) cTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctgc > 2:883000/1‑147 (MQ=255) cTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTcgctgc < 1:883000/147‑1 (MQ=255) tACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGgcccacgtaggagagcagcaccggcagcagaatcaggttggtgaagatcagcaccgccacgcccaggctggcgataacggccaggtcctggat < 1:153337‑M2/150‑94 (MQ=255) tACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGgcccacgtaggagagcagcaccggcagcagaatcaggttggtgaagatcagcaccgccacgcccaggctggcgataacggccaggtcctggat < 1:1596125‑M2/150‑94 (MQ=255) aCGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGAGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGa > 2:9360/1‑150 (MQ=255) cGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGAt > 1:653515/1‑150 (MQ=255) cGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGAt < 1:1115931/150‑1 (MQ=255) tGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGATgg > 1:832061/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGATgg < 1:1108183/150‑1 (MQ=255) ggcctcggcctcttcggcgcgcaggctgcgccgcgccgcacgggcactgacgcccacgtaggagagcagcaccggcagcagaatcaggttggtgaagatcagcaccgccacgcccaggctggcgataacggccaggtcctggatcacctg > 2:1408111‑M1/1‑3 (MQ=255) gCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGATGGCTg > 1:93287/1‑150 (MQ=255) | TGCTCTGTGATGCGGTCGGTTTTGCCGTGCTCATGATCATTCAGATACAGGTGATCCAGGACCTGGCCGTTATCGCCAGCCTGGGCGTGGCGGTGCTGATCTTCACCAACCTGATTCTGCTGCCGGTGCTGCTCTCCTACGTGGGCGTCAGTGCCCGTGCGGCGCGGCGCAGCCTGCGCGCCGAAGAGGCCGAGGCCAGCGGGGCGGGCAAGCATGCGGTGTGGCGCTTCCTCGACCTGTTCACCCGCCGACGCTGGGCGGCGGCGTGCATCGCCGTCGCTGCGCTGATGGCTG > NC_002947/3634679‑3634972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |