New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3797037 = | 85 (1.140) | 5 (0.070) | 5/242 | NT | 6.2% | coding (1000/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3797067 = | 70 (0.990) | coding (970/1449 nt) | vdh | vanillin dehydrogenase |
CACCGGGCCGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGC > NC_002947/3796888‑3797186 | cggtgcctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcgg > 2:1423988‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgcctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggtgatccgcaagccagcacctcggtgctcggct < 1:455971‑M1/3‑1 (MQ=255) tgcctacttcaaccaggggcagatctgcatgtccaccgagcgccttgtggtggacagctgtattgccgacgctttcgtcgacaagctggcggtgaagatcgccgggctgcgtgcaggggatccgcaagccagcacctcggtgctcggctc < 2:432645‑M1/4‑1 (MQ=255) cGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCGTCTAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCTCCCTTGTCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgcagg > 2:1841523/1‑150 (MQ=255) gAAGGACTCCTCGCGGTACAGGAGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGACGCCGATGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggc > 1:415503/1‑150 (MQ=255) aaGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggcc < 1:1371754/150‑1 (MQ=255) aaGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggcc > 1:1620651/1‑150 (MQ=255) aGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggccg > 1:570773/1‑150 (MQ=255) gACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCACTCGCCGGCcgct > 2:69114/1‑150 (MQ=255) tcctcGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggcc > 2:1492972/1‑144 (MQ=255) tcctcGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCgccggcc < 1:1492972/144‑1 (MQ=255) ccgcgGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCcgctgcgctg > 2:1320629/2‑150 (MQ=255) cgcgGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGa < 2:615366/150‑1 (MQ=255) 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gcgcCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCg > 1:768901/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCg < 1:897898/150‑1 (MQ=255) gcgcCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGACg < 2:1426479/150‑1 (MQ=255) cgcCCTTGGCCAGGGCATCTTCGATCAGTGCCCTGATGCCATCGCCGGCTGCTGCGCTGCCCACCGAGCCGAGCATCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACCCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCgg < 1:784777/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCaa > 2:1368356/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCACTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATa < 1:69114/150‑1 (MQ=255) cACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGGGAAAAGCCCTGGTGGGCTGGCTTGAGGATCACCTTCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCt < 1:1077874/150‑1 (MQ=255) gCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTcc < 2:741204/150‑1 (MQ=255) cATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCCCGGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTcca < 1:782193/150‑1 (MQ=255) gtcgATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCcaccac > 2:597951/1‑150 (MQ=255) gATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAg > 2:1149904/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGgcgc < 1:1134882/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCt > 2:682987/1‑150 (MQ=255) ccTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCgg > 2:726893/1‑150 (MQ=255) ttGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTg < 1:1149904/150‑1 (MQ=255) ttGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTg < 1:682987/150‑1 (MQ=255) cgcTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATg > 2:1431498/1‑150 (MQ=255) GCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGc > 1:597951‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACAGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGc > 2:1737788‑M1/1‑150 (MQ=255) | CACCGGGCCGAAGGACTCCTCGCGGTACAGGCGCATGCTGGCATCGACGTTGTCGAGCAAGGTCGGTTGCAGGATGCTGCCTTCCAGCTGGCCGCCGCTGACCAGGCGCGCGCCCTTGGCCACGGCATCGTCGATCAGTGCCTTGATGCGCTCGCCGGCCGCTGCGCTGACCAGCGAGCCGAGCACCGAGGTGCTGGCTTGCGGATCACCTGCACGCAGCCCGGCGATCTTCACCGCCAGCTTGTCGACGAAAGCGTCGGCAATACAGCTGTCCACCACAAGGCGCTCGGTGGACATGC > NC_002947/3796888‑3797186 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |