New junction evidence | |||||||||||
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CAGTTCGACCAGGATCAGCAGTTCGCCATTCTTGTTGCACACGCCTTGAATGAACTTGGCCGACTCTTCGTTACCCACGTTCGGCGCGGTTTCGATTTCGGACTGGCGCAGGTAAACCACTTCGGCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTCGGCGCACCCGG > NC_002947/4922871‑4923167 | cAGTTCGCCCAGGATCAGCAGTTCGCCATTCTTGTTGCACACGCCTTGAAGGAACTTGGCCGACTCTTCGTTACCCACGTTCGGCGCGGTGTCGATTTCGGACTGGCGCAGGTAAACCACTTCGGCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGAC < 1:209753‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGACCAGGATCAGCAGTTCGCCATTCTTGTTGCACACGCCTTGAATGAACTTGGCCGACTCTTCGTTACCCTCGTTCGGCGCGGTTTCGATTTCGGACTGGCGCAGGTAAACCACTTCGGCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGAC < 1:127878‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATCAGCAGTTCGCCATTCTTGTTGCACACGCCTTGAATGAACTTGGCCGACTCTTCGTTACCCACGTTCGGCGCGGTTTCGATTTCGGACTGGCGCAGGTAAACCACTTCGGCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGACCActtgc < 1:1785493/150‑1 (MQ=255) 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ggCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGCCGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGcc < 1:1475048/150‑1 (MQ=255) gacACGCTGTCGACCGGGATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACGTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGccc > 2:1554093/3‑150 (MQ=255) ccACGCTGTCGACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCa < 1:193139/150‑1 (MQ=255) gACCAGAATGCCGACCACTTGCTTgtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccga < 2:734018‑M2/77‑54 (MQ=255) gACCAGAATGCCGACCACTTGCTTgtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccga > 1:734018‑M2/1‑24 (MQ=255) gACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCGCAGCACGTAGcc > 2:697123/1‑149 (MQ=255) gACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCt < 2:913472/150‑1 (MQ=255) aCCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTtcggt < 1:1240592/68‑1 (MQ=255) aCCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTtcggt > 2:1240592/1‑68 (MQ=255) aCCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTc > 1:1597775/1‑150 (MQ=255) aCCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTc > 1:1738780/1‑150 (MQ=255) aCCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTc > 1:630461/1‑150 (MQ=255) tGCCGACCACTTGCTTgtcggcattctggtcgacagcgtggccggagtggtttacctgcgccagtcc < 1:1046658‑M2/67‑52 (MQ=255) tGCCGACCACTTGCTTgtcggcattctggtcgacagcgtggccggagtggtttacctgcgccagtcc > 2:1046658‑M2/1‑16 (MQ=255) ccGACacgcatttggtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccgaaatcgaaaccgcgccgaacgtgggtaacgaagagtcggccaagttcattcaaggcgtgtgcaacaagaatggcgaactgctga < 1:1514548‑M1/150‑146 (MQ=255) ccGACaagcaagtggtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccgaaatcgaaaccgcgccgaacgtgggtaacgaagagtcggccaagttcattcaaggcgtgtgcaacaagaatggcgaactgctga > 1:1706956‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTCGGCGCAccc > 2:1610956/1‑150 (MQ=255) cGACaagcaagtggtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccgaaatcgaaaccgcgccgaacgtgggtaacgaagagtcggccaagttcattcaaggcgtgtgcaacaagaatggcgaactgctgat > 1:187857‑M1/1‑4 (MQ=255) cGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTCGGCGCACCCg > 2:1533331/1‑150 (MQ=255) gACaagcaagtggtcggcattctggtcgacagcgtggccgaagtggtttacctgcgccagtccgaaatcgaaaccgcgccgaacgtgggtaacgaagagtcggccaagttcattaaaggcgtgtgcaacaagaatggcgaactgctgatc > 1:1762151‑M1/1‑3 (MQ=255) | CAGTTCGACCAGGATCAGCAGTTCGCCATTCTTGTTGCACACGCCTTGAATGAACTTGGCCGACTCTTCGTTACCCACGTTCGGCGCGGTTTCGATTTCGGACTGGCGCAGGTAAACCACTTCGGCCACGCTGTCGACCAGAATGCCGACCACTTGCTTGTCGGCTTCGATGATGACGATACGGGTGTTGTCGGTCACTTCGGTCGGCATCAGGCCAAAACGCTGACGCGTGTCGATCACCGTCACCACGTTGCCGCGCAAGTTGATGATGCCCAGCACGTAGCTCGGCGCACCCGG > NC_002947/4922871‑4923167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |