New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5672886 | 58 (0.780) | 6 (0.080) | 6/250 | NT | 8.6% | coding (78/1881 nt) | rhlE‑II | ATP‑dependent RNA helicase |
? | NC_002947 | = 5672919 | 70 (0.950) | coding (111/1881 nt) | rhlE‑II | ATP‑dependent RNA helicase |
ACCGATGCCCGTCGCGCCAGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGCCACGG > NC_002947/5672743‑5673035 | aCCGATGCCCGTCGCGCCAGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCaa > 1:1603087/1‑150 (MQ=255) cgCCCGTCGCGCCAGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACCGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGCCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCg < 2:1412164/149‑1 (MQ=255) cccGTCGCGCCAGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCggg < 2:1675785/150‑1 (MQ=255) aGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCccgcc > 1:468546/1‑150 (MQ=255) gAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTCTCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGtt > 2:718548/1‑150 (MQ=255) gAACACCCCAACGGGCCCATCCCACACGAGAACAGGCCTGCCCATGTCCTCTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGGCCGCTTTATCTAGGCTGCTGGCTACACACAGCCGTCCACCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGtt < 2:852269/150‑1 (MQ=255) aCATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGc < 2:1577243/150‑1 (MQ=255) aTCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCaa < 1:584076/150‑1 (MQ=255) tCCCAACGGGCCCAGCCCACATTAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCgtgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacg < 1:1531799‑M1/150‑35 (MQ=255) tCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAg > 2:1595446‑M2/1‑149 (MQ=255) ccAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGCGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGc > 1:396748/1‑150 (MQ=255) cAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGcc > 1:867005/1‑150 (MQ=255) cccagcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCttgcaacacggcgggaatagcccgatgttgaacgggggtcggct < 2:1268562‑M1/150‑45 (MQ=255) ccagcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACTGGCTGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTg > 1:1755941/1‑150 (MQ=255) cagcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGACTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCgtgcaacacggcgggaatagcccgctgttgca > 1:1337077‑M1/1‑104 (MQ=255) cagcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGACTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCgtgcaacacggcgggaatagcccgctgttgca < 2:1337077‑M1/136‑33 (MQ=255) agcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTATCCGAGTCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGAt < 1:1870853/150‑1 (MQ=255) gcccaCACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCGCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATg < 2:468546/150‑1 (MQ=255) cacaCGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGtt < 1:352927/150‑1 (MQ=255) acacGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCttgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacggg > 2:611015‑M1/1‑98 (MQ=255) acacGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCttgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacggg < 1:611015‑M1/134‑37 (MQ=255) acacGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCgt < 2:1430504/124‑1 (MQ=255) acacGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCgt > 1:1430504/1‑124 (MQ=255) acacGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCCGGCTACAGCCTACTGCCGCCTCTTCGACAGCGTGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCAACCTGATGGGTg > 1:697311/1‑150 (MQ=255) acGAGAACTGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCCCGGTATATCGCACGGTTTGCTGCACGGTTGCTAGGCGTCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGcc < 1:223855/150‑1 (MQ=255) acGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGcc > 1:1423938/1‑150 (MQ=255) gATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCacagacag > 1:452506/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGA‑CCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGt < 1:1526895/150‑1 (MQ=255) tCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGcaca > 1:1302999/1‑143 (MQ=255) tCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGcaca < 2:1302999/143‑1 (MQ=255) aTGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAgg < 1:760052‑M2/113‑3 (MQ=255) aTGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAgg > 2:760052‑M2/1‑111 (MQ=255) gTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGAGCCCTGGTGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTaa > 1:328253/1‑150 (MQ=255) cTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAAc < 2:452506/150‑1 (MQ=255) tttGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATgg < 1:753878/121‑1 (MQ=255) tttGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATgg > 2:753878/1‑121 (MQ=255) tttGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAAcc > 2:588934/1‑150 (MQ=255) tttGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAAcc > 2:1041762/1‑150 (MQ=255) cTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACcggcg > 2:480885/1‑150 (MQ=255) cTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACcggcg < 1:1684503/150‑1 (MQ=255) cccTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCt > 2:766818/1‑150 (MQ=255) ccTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCtt > 1:937079/1‑150 (MQ=255) cTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCttt > 2:1386493/1‑150 (MQ=255) tcCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCGCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCg > 1:619400/1‑150 (MQ=255) gAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGAtt > 1:1072945/1‑150 (MQ=255) tctTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGa > 1:1056381/1‑150 (MQ=255) tctTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGa > 2:491813/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCTTTCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCacagacag < 2:1037895/105‑1 (MQ=255) tCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCacagacag > 1:1037895/1‑105 (MQ=255) gcgcTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTCATGGTTGAATCACAGACAGGTACGGGTGCAATGGTCTTCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTgg > 2:449333/1‑149 (MQ=255) cGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCccggc < 2:396748/150‑1 (MQ=255) cGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCcaggc > 1:1505250/1‑150 (MQ=255) gAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACACCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCccggcc > 1:801053/1‑150 (MQ=255) aGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGACGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCccggccg > 1:897872/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCggccggccc > 2:25837/1‑149 (MQ=255) cGGGCTACACCCAGCCGTCCCCCGTGCAATAGCGGGCTATTACCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATc < 1:1380190/150‑1 (MQ=255) ggCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATccc > 2:699786/1‑150 (MQ=255) tACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGAc > 2:100455/1‑150 (MQ=255) tACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGAc > 1:1216305/1‑150 (MQ=255) acCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACaaa > 1:781660/1‑150 (MQ=255) cccAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAAt < 1:1127256/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATtctc < 2:724288/115‑1 (MQ=255) ccAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATtctc > 1:724288/1‑115 (MQ=255) aGCCGACCCCCGTTCAACATCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacatgggcgatcctgttctcgtgtgggctggg < 2:1268562‑M2/150‑107 (MQ=255) gCCGACCCCCGGGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGAAGGGCCGCGCCCTGATGGTGGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAATTcaca < 2:593437/150‑1 (MQ=255) ccGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTAGCCGTTTCCATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAg > 1:593437/1‑150 (MQ=255) cGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGc < 1:1139352/39‑1 (MQ=255) cGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGc > 2:1139352/1‑39 (MQ=255) cccccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGcc < 1:718548/150‑1 (MQ=255) ccccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACcgg > 1:1787675/1‑84 (MQ=255) ccccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACcgg < 2:1787675/84‑1 (MQ=255) ccccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGCCa > 1:1378924/1‑150 (MQ=255) ccccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGACATTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGccc > 2:449154/1‑149 (MQ=255) cccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacatgggcgatcctgttctcgtgt > 2:611015‑M2/1‑36 (MQ=255) cccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacatgggcgatcctgttctcgtgt < 1:611015‑M2/134‑99 (MQ=255) cccGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCAGAAGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTACCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGCCAc > 1:1789385/1‑150 (MQ=255) ccttgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacat > 2:760052‑M1/1‑2 (MQ=255) ccttgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacat < 1:760052‑M1/113‑112 (MQ=255) cttgcaacacggcgggaatagcccgctgttgcacgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacatgggcgatcctgttctcgtgtgggctgggcccgttggga > 2:1595446‑M1/1‑1 (MQ=255) cGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCACgggggtcggctgggtgtagcccgcagcctcgatagcgcggacaagagcctcggagagaccgagggaagcaaaggacatgggcgatcctgttctaatgtgggctgggcccgttggga < 1:1531799‑M2/150‑117 (MQ=255) cGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGCCACgg > 2:1895830/1‑150 (MQ=255) | ACCGATGCCCGTCGCGCCAGGCAGAACATCCCAACGGGCCCAGCCCACACGAGAACAGGATCGCCCATGTCCTTTGCTTCCCTCGGTCTCTCCGAGGCTCTTGTCCGCGCTATCGAGGCTGCGGGCTACACCCAGCCGACCCCCGTGCAACAGCGGGCTATTCCCGCCGTGTTGCAAGGCCGCGACCTGATGGTTGCCGCACAGACAGGTACGGGTAAAACCGGCGGCTTTGCCCTGCCGATTCTCGAGCGCCTGTTCCCGGCCGGCCATCCCGACAAATCACAGCGCCACGG > NC_002947/5672743‑5673035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |