New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5947618 | 79 (1.060) | 4 (0.060) | 4/246 | NT | 5.4% | coding (912/1260 nt) | rho | transcription termination factor Rho |
? | NC_002947 | = 5947657 | 64 (0.890) | coding (873/1260 nt) | rho | transcription termination factor Rho |
ACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACATCTTTCTTGTGCT > NC_002947/5947469‑5947766 | acacGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGC > 2:1251832‑M1/1‑150 (MQ=255) acacGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGC > 2:999217‑M1/1‑150 (MQ=255) acacGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTCAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAGCCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGC > 2:999191‑M1/1‑150 (MQ=255) acGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACgcgc > 2:899157/1‑150 (MQ=255) acGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACgcgc > 2:1449188/1‑150 (MQ=255) acGCTTCTCAGCGATGCCGCCGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACgcgc < 1:655299/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCgcagca > 2:933019/1‑150 (MQ=255) tcAGCGATGCGGCGGTCCAGCTGCAGCTCCATGTTGCCGGTACTCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCg > 2:802965/1‑150 (MQ=255) cAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCga < 2:831356/150‑1 (MQ=255) aGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCgaa < 2:994593/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAgc < 1:253590/150‑1 (MQ=255) gcggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCtt < 2:966301/150‑1 (MQ=255) gcggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCtt < 2:273848/150‑1 (MQ=255) cggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCccacgccctcgagaagcccaa > 2:478634‑M1/1‑129 (MQ=255) cggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGTAGCACCGAAGAAGCGCTTg < 2:323117/150‑1 (MQ=255) cggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTg < 1:1147602/150‑1 (MQ=255) cggTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTg < 1:1157585/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCGTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTtct > 2:1177088/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTtctc > 2:1137154/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACGTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTtctc > 2:1316690/1‑150 (MQ=255) cAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTNGAg < 2:1191979/150‑1 (MQ=255) aGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgg > 1:1723896/1‑150 (MQ=255) cTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAGACGGCCTCAACGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggc > 2:528720/1‑150 (MQ=255) tCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcg > 2:1298265/1‑150 (MQ=255) tCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcg > 1:1632432/1‑150 (MQ=255) ccATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgt > 2:198460/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtg < 1:1879958/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtg < 1:1879971/150‑1 (MQ=255) ctGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 2:1556999/149‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 2:392176/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCCTGCAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 1:528720/150‑1 (MQ=255) ccGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCccacgccctcgagaagcccaagcgcttcttcggtgctgcgcgtaa < 2:1470082‑M1/150‑46 (MQ=255) ggTACCCTTGAACTCTTCGTAGCTCAATTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCccacgccctcgagaagcccaagcgcttcttcggtgctgcgcgtaaca < 1:478634‑M1/150‑48 (MQ=255) tACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGacac < 2:1632432/150‑1 (MQ=255) ccctgtaacgcttcGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCccacgccctcgagaagcccaagcgcttcttcggtgctgcgcgtaacatcga < 2:572642‑M1/144‑52 (MQ=255) ccTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgg < 2:1083574/131‑1 (MQ=255) ccTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgg > 1:1083574/1‑131 (MQ=255) ccTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTc < 1:745515/142‑1 (MQ=255) ccTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTc > 2:745515/1‑142 (MQ=255) ttGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtg < 1:211651/134‑1 (MQ=255) ttGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtg > 2:211651/1‑134 (MQ=255) ttGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCCCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCg > 2:284048/1‑150 (MQ=255) aCTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCa < 2:1663271/150‑1 (MQ=255) tctTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAAGCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGc > 2:976633/1‑150 (MQ=255) ttCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCAc > 1:1823658/1‑150 (MQ=255) tAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg > 2:155801/1‑123 (MQ=255) tAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 1:155801/123‑1 (MQ=255) tCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGcc > 1:851850/1‑148 (MQ=255) tCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGcc < 2:851850/148‑1 (MQ=255) tCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAAAACCGCTTGTGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACGACCGTGCAGCACCTTGTCgg > 2:1841710/1‑150 (MQ=255) ttCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCt > 2:331570/1‑150 (MQ=255) cGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCg < 2:1636851/150‑1 (MQ=255) cGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAAAACCCCAGAAGCACTAGGAATGCACGAAAGCGTTTTCGGCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCg < 1:976633/150‑1 (MQ=255) gTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCgg < 1:999217/150‑1 (MQ=255) gTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCgg < 1:999191/150‑1 (MQ=255) cATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGAt > 1:940234/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCCGCTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGACGCAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACg < 2:147706/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGtgttg < 1:1251832/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGtgttgt < 2:1137758/150‑1 (MQ=255) ggTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGACGCACCGAAAAACCGCGTGGGCTTCCCGAGGTCGTGTGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTa < 1:1177088/150‑1 (MQ=255) ggTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCCCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTa < 1:284048/150‑1 (MQ=255) gTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAg > 1:1750559/1‑150 (MQ=255) gTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAg < 1:1102410/150‑1 (MQ=255) cAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGc < 1:758880/109‑1 (MQ=255) cAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGc > 2:758880/1‑109 (MQ=255) gcgcAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCAcgcgacc < 2:506150/150‑4 (MQ=255) gTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 1:1215688/81‑1 (MQ=255) gTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg > 2:1215688/1‑81 (MQ=255) aTAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 2:1135457/75‑1 (MQ=255) aTAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg > 1:1135457/1‑75 (MQ=255) aTAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGAGGTGACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATc < 2:621316/150‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGCGAACCGCATACCTGGATGTTTGGGGGCGTACCGAAGGACGTCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGa < 2:17250/150‑1 (MQ=255) ggTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTc < 1:608629/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg > 1:732092/1‑68 (MQ=255) tCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAgggcgtgg < 2:732092/68‑1 (MQ=255) tCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCca > 2:718227/1‑150 (MQ=255) tCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGATGTTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCca > 1:881375/1‑150 (MQ=255) gCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCa < 1:549243/108‑1 (MQ=255) gCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCa > 2:549243/1‑108 (MQ=255) gCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCcagca < 2:102360/150‑1 (MQ=255) gCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCcagca < 2:1022360/150‑1 (MQ=255) gCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGAAACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCcagca > 1:229952/1‑150 (MQ=255) gAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAgg > 2:235599/1‑150 (MQ=255) aaCCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCATGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGa > 2:985756/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACcac < 1:82806/150‑1 (MQ=255) cTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGtgttgt > 2:637726/1‑104 (MQ=255) cTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGtgttgt < 1:637726/104‑1 (MQ=255) tCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGgcgtaacatcgaggaaggcggttcgctgaccattatcgccactgcgctggttgaaaccggctcgaagatggacgaagtgatctacgaagcgttacaggg < 2:572642‑M2/150‑100 (MQ=255) aTGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACAtctttc < 1:1901399/150‑1 (MQ=255) tGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGgcgtaacatcgaggaaggcggttcgctgaccattatcgccactgcgctggttgaaaccggctcgaagatggacgaattgagctacgaagagttcaagggtacc < 1:478634‑M2/150‑104 (MQ=255) gTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACAtctttctt < 1:802965/150‑1 (MQ=255) ttACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGgcgtaacatcgaggaaggcggttcgctgaccattatcgccactgcgctggttgaaaccggctcgaagatggacgaagtgatctacgaagagttcaagggtaccgg < 2:1470082‑M2/150‑106 (MQ=255) aCGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCAc > 1:980135/1‑101 (MQ=255) aCGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCAc < 2:980135/101‑1 (MQ=255) gcgcAGCACCGAATAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACATCTTTCTTGTGCt > 2:1424421/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACATCTTTCTTGTGCt > 2:1905764/1‑150 (MQ=255) | ACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTACCCTTGAACTCTTCGTAGATCACTTCGTCCATCTTCGAGCCGGTTTCAACCAGCGCAGTGGCGATAATGGTCAGCGAACCGCCTTCCTCGATGTTACGCGCAGCACCGAAGAAGCGCTTGGGCTTCTCGAGGGCGTGGGCGTCGACACCACCGGTCAGCACCTTGCCGGAGCTCGGGATCACGGTGTTGTAGGCACGCGCCAGTCGAGTGATCGAGTCCAGCAGGATAACCACATCTTTCTTGTGCT > NC_002947/5947469‑5947766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |