| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6032808 = | 44 (0.590) | 8 (0.140) | 6/188 | NT | 29.9% | intergenic (+16/+120) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 6032890 = | 5 (0.090) | intergenic (+98/+38) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein | |||||
GATCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCT > NC_002947/6032660‑6032950 | gATCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCtt < 1:1719432/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc < 1:716558/150‑1 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtttgagggactactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:1680316‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:104218‑M1/144‑150 (MQ=255) agcagcagGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGGGGGGATCCTTTTTAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg < 1:230528/150‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGt > 2:261334/1‑150 (MQ=255) gcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggcctcTTCGCGGGTaaa > 1:1781020‑M1/139‑150 (MQ=255) agGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCCAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:929174/150‑1 (MQ=255) ggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:1065915‑M1/17‑1 (MQ=255) ggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:255577‑M1/134‑150 (MQ=255) gcTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:143428/1‑150 (MQ=255) gcTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACATTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGc < 1:483965/150‑1 (MQ=255) gcTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCAACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGTCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg < 2:1606364/140‑1 (MQ=255) gcTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCAACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg > 1:1606364/1‑140 (MQ=255) ctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1286547‑M1/132‑150 (MQ=255) gtgGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 2:1378813/150‑4 (MQ=255) ggTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:219123/150‑1 (MQ=255) tGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:857210/150‑1 (MQ=255) tgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagctgatgttgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACAgg > 1:1057971‑M1/125‑150 (MQ=255) gattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 2:1394360‑M1/124‑150 (MQ=255) ttgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt < 2:713791‑M1/29‑1 (MQ=255) atgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgtcgtcgctggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgc > 2:1485375‑M1/119‑150 (MQ=255) cgcACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgcgc < 2:11562/150‑1 (MQ=255) aCCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCa < 1:1327070/149‑1 (MQ=255) aCCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCa > 2:1327070/1‑149 (MQ=255) aCCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAg > 2:200884/1‑150 (MQ=255) ccGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc > 2:1461154/1‑116 (MQ=255) ccGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc < 1:1461154/116‑1 (MQ=255) cGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGGGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCCAGGTGACGGTCACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCt < 2:1738592/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 2:1020737/1‑137 (MQ=255) cGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg < 1:1020737/137‑1 (MQ=255) cGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCt > 2:735427/1‑150 (MQ=255) tggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 1:1103766‑M1/107‑133 (MQ=255) tggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg < 2:1103766‑M1/27‑1 (MQ=255) ggcggcGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCa < 2:511246/150‑1 (MQ=255) ggcggcGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCa < 1:735427/150‑1 (MQ=255) tcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTg < 2:1041822‑M1/48‑1 (MQ=255) cgACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGa < 1:143428/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAc > 2:907670/1‑150 (MQ=255) gACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGAc < 1:200884/150‑1 (MQ=255) atcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc > 1:1065915‑M1/96‑150 (MQ=255) atcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc > 1:713791‑M1/96‑150 (MQ=255) ctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAccc < 2:8137/150‑1 (MQ=255) ttggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCt > 1:1041822‑M1/92‑150 (MQ=255) cAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAg > 1:1550720/1‑150 (MQ=255) aGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCA‑ACTGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGa < 1:1561445/150‑1 (MQ=21) aGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGa < 1:326042/150‑1 (MQ=255) gCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGc < 2:1550720/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCGTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCggg < 2:1020952/150‑1 (MQ=255) gggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:1767779/150‑1 (MQ=255) gggTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:1767779/1‑150 (MQ=255) atggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCt < 1:281589‑M1/59‑1 (MQ=255) atggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCt > 2:281589‑M1/69‑127 (MQ=255) ggTGAGGCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGAAGATGGCCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGAGGGGAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 1:1563331/150‑1 (MQ=38) ggTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAACGTGACGGTGACCAATTAAGCTTGTAGCGGCCTCTTCGAGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 1:1562786/150‑1 (MQ=38) 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ccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAg > 2:511879‑M1/25‑55 (MQ=255) ccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 1:1229369‑M1/55‑1 (MQ=255) ccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc > 2:1229369‑M1/25‑79 (MQ=255) cAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc > 1:1026930/1‑77 (MQ=255) cAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTAc < 2:1026930/77‑1 (MQ=255) gTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACaa < 1:907670/150‑1 (MQ=255) ccTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCAGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCAc < 2:1090282/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCt > 1:1659074/1‑150 (MQ=255) | GATCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCT > NC_002947/6032660‑6032950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |