New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 375245 = | 79 (1.060) | 4 (0.060) | 4/242 | NT | 5.3% | coding (532/1233 nt) | PP_0312 | electron transfer flavoprotein subunit alpha |
? | NC_002947 | 375282 = | 68 (0.960) | coding (569/1233 nt) | PP_0312 | electron transfer flavoprotein subunit alpha |
TTCCACAGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCT > NC_002947/375133‑375427 | ttCCACAGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTCCCAAACCCGCCGAAAGGATCAAGGCCTGCGGGCTGTAGCTCACCAGTTAGCGCCGCGTAGCCGGTTGCGGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCgg < 1:1876942/150‑1 (MQ=255) aggtcttgctggccggcgccggcgcggccgatacactggccgtccttgacctgccatacccgggttgccgggcgctcgcccagcgcggcacccaggcgccgacccagttcccCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCgg > 2:689590‑M1/113‑150 (MQ=255) aggtcttgctggccggcgccggcgcggccgatacactggccgtccttgacctgccatacccgggttgccgggcgctcgcccagcgcggcacccaggcgccgacccagttcccCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCgg < 1:689590‑M1/38‑1 (MQ=255) taaataGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCggg < 1:968645/145‑1 (MQ=255) tCCACAGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCggg < 2:1497048/150‑1 (MQ=255) acaGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑Gaa > 2:1733652/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACt < 2:1209342/150‑1 (MQ=255) ctggccggcgccggcgcggccgatacactggccgtccttgacctgccatacccgggttgccgggcgctcgcccagcgcggcacccaggcgccgacccagttcccCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTgg > 1:1338401‑M1/105‑150 (MQ=255) ccGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTgg < 1:273811/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCCATTGAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTgg < 1:1452400/150‑1 (MQ=255) cggcgccggcgcggccgatacactggccgtccttgacctgccatacccgggttgccgggcgctcgcccagcgcggcacccaggcgccgacccagttcgcgccgCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTggg > 1:790474‑M1/104‑150 (MQ=255) ggTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGt > 2:865843/1‑150 (MQ=255) gtgtCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTc > 1:715932/1‑150 (MQ=255) gtgtCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTGCGCGCCGCGCCACTGTCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTc < 2:688315/150‑1 (MQ=255) gATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGgcgc > 1:1337476/1‑150 (MQ=255) gctgGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGc > 1:1870959/1‑150 (MQ=255) tgGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCcg > 2:938703/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCGTTGTGCCGCGCTgg < 2:1419428/150‑1 (MQ=255) 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gAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAgcgc > 2:1521803/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCg < 2:1870959/150‑1 (MQ=255) cTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGc > 1:1904658/1‑150 (MQ=255) cTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCAACAATCCAACTGCT‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGc > 2:528985/1‑150 (MQ=255) tttGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCa > 1:562600/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGGACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAAcc > 1:1037430/1‑150 (MQ=255) ggTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCgg > 1:103491/1‑150 (MQ=255) ttATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCaggc < 1:1334134/150‑2 (MQ=255) tATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTa < 1:1521803/150‑1 (MQ=255) cACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTCTGGc > 2:942228/1‑150 (MQ=255) aCCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCa < 2:1855442/150‑1 (MQ=255) cGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAgg > 1:673355/1‑150 (MQ=255) gCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCaa < 2:1509605/150‑1 (MQ=255) gTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGc > 2:1666595/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAg > 2:516732/1‑150 (MQ=255) 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ACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGAGCCGGCCAGCAAGACCTGCAAc > 1:874850‑M1/1‑150 (MQ=255) gctgctGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGAc < 1:909013/100‑1 (MQ=255) gctgctGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGAc > 2:909013/1‑100 (MQ=255) tgcCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCACCCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGc > 1:232472/1‑150 (MQ=255) tgcCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGc > 2:1630455/1‑150 (MQ=255) cccGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcg > 2:535992/1‑150 (MQ=255) cccGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcg > 2:844711/1‑150 (MQ=255) ccGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc < 2:287291/150‑1 (MQ=255) ccGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc < 1:1733652/150‑1 (MQ=255) ccGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGCATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc > 1:1426474/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGcc < 1:760743/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACCGGATCTTCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCt < 1:1357/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGAt > 2:507049/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTgg < 2:1867846/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCACGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTgg > 2:454786/1‑150 (MQ=255) tggcgGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCtggcggg < 2:1338401‑M2/145‑2 (MQ=255) tggcgGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTagcggc > 2:30756‑M2/6‑150 (MQ=255) ggcgGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCt < 2:646943‑M2/146‑1 (MQ=255) | TTCCACAGCCGGTGTCGATCGGCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGG‑‑‑GAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCT > NC_002947/375133‑375427 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |