New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1102886 = | 85 (1.140) | 7 (0.100) | 7/238 | NT | 8.3% | intergenic (+20/‑98) | ttg2E/ttg2F | toluene‑tolerance protein/BolA family protein |
? | NC_002947 | 1102932 = | 76 (1.090) | intergenic (+66/‑52) | ttg2E/ttg2F | toluene‑tolerance protein/BolA family protein |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGAACGTGA > NC_002947/1102786‑1103080 | gCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCtttt > 2:24514/1‑150 (MQ=255) acccggcaatttctcttcaaggaagcttttaacttctacggcctgcatgctcaacctcaatcggcgcccgatgcgcacgggtcggccatcatacaaaaaaGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCtttt > 1:757584‑M1/101‑150 (MQ=255) gTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTTGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCtttttt < 1:1874785/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTg > 2:1519653/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGTGCGTGGCATGCCCGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGGTGAATTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTg < 1:319251/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTCGGGATTCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa > 1:1059834/1‑150 (MQ=255) aGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTatg < 2:1497057/150‑1 (MQ=255) tGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTatgatg < 1:24514/150‑1 (MQ=255) gCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGTCAAGCTAGTTGGCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGAc < 2:1858597/150‑1 (MQ=255) gCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGAc < 2:1872950/150‑1 (MQ=255) gCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGAc < 2:622468/150‑1 (MQ=255) ccTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGACTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTg < 2:1208455/150‑1 (MQ=255) tgatgaTATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTgcg > 1:1268619/1‑150 (MQ=255) tgatgaTATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGACTTCGCGGTGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTgcg > 2:1484349/1‑150 (MQ=255) ttttaacttctacggcctgcatgctcaacctcaatcggcgcccgatgcgcacgggtcggccatcatacaacaaaGCCCCACGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCttt < 2:1894578‑M1/49‑1 (MQ=255) ttttaacttctacggcctgcatgctcaacctcaatcggcgcccgatgcgcacgggtcggccatcatacaaaaaaGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCttt > 1:1894578‑M1/75‑123 (MQ=255) gatATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATc > 1:1124842/1‑150 (MQ=255) atatGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCg < 1:1519653/150‑1 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGt < 2:1168269/120‑1 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGt > 1:1168269/1‑120 (MQ=255) gggAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGcc > 1:1129058/1‑150 (MQ=255) gAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa < 2:822006/119‑1 (MQ=255) gAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTa > 1:822006/1‑119 (MQ=255) aaTTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGAtt < 2:121179/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAgg > 1:522145/1‑150 (MQ=255) gAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCCATTGAGGtgg > 1:1030392/1‑148 (MQ=255) tATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGa < 1:426319/139‑1 (MQ=255) tATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGa > 2:426319/1‑139 (MQ=255) tATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATg > 1:630337/1‑150 (MQ=255) ctctcGCTGCTGTGCCAGCACGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAgg > 2:1367798/2‑150 (MQ=255) tctcGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGc > 1:635533/1‑150 (MQ=255) tctcGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGc > 1:1335996/1‑150 (MQ=255) tctcGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGc < 2:374675/150‑1 (MQ=255) tcGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGTGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCTCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCg < 1:627643/150‑1 (MQ=255) tcGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCg < 1:880183/150‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGGGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTa < 2:442791/150‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCAGGCAGGCCGTAGAAg < 2:465669/150‑1 (MQ=255) aGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGt < 2:6121/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGaa > 2:39719/1‑146 (MQ=255) tGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGaa < 1:39719/146‑1 (MQ=255) tGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTa > 1:1168309/1‑150 (MQ=255) tGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑TCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa < 1:290545/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa < 2:613030/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa > 1:756842/1‑150 (MQ=255) tAGTGGCTAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTGCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGAATGATG‑GCAGATACGTGTGCGTTGGGCGCCGCTTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCGTCCtt > 1:225521/1‑150 (MQ=255) tAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCtt > 1:1549631/1‑150 (MQ=255) tAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCtt > 1:1109014/1‑150 (MQ=255) cAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAgaga > 1:397019/1‑150 (MQ=255) aGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAg < 2:579218/118‑1 (MQ=255) aGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAg > 1:579218/1‑118 (MQ=255) aGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGaa < 2:397019/150‑1 (MQ=255) aGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGaa < 2:756842/150‑1 (MQ=255) aGGCACGGATGATGGCACCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGaa > 2:928500/1‑150 (MQ=255) gCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTTTTTTATT‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAAt > 2:1284990/1‑150 (MQ=255) gCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAAt > 1:709762/1‑150 (MQ=255) aCGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTg > 1:314501/1‑150 (MQ=255) cGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGCGTAACGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGc < 1:18918/150‑1 (MQ=255) gatgatGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCg < 1:1418157/150‑1 (MQ=255) aaaagcccctcgcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGt > 1:757584‑M2/51‑150 (MQ=255) atgGCCCCGCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGCGGGGCTTTTTTG‑AGAACGCGACTACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGtt < 1:697706/150‑1 (MQ=255) aaagcccctcgcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgtggggcTTTGTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa < 2:1894578‑M2/74‑1 (MQ=255) aaagcccctcgcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa > 1:1894578‑M2/50‑123 (MQ=255) CCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCgg > 2:1774332‑M1/1‑150 (MQ=255) cctcgcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGcc < 1:502515‑M2/96‑1 (MQ=255) cctcgcctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGcc > 2:502515‑M2/44‑139 (MQ=255) CCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCggg < 1:555249‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCggg < 2:352987‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGt > 2:1549631‑M1/1‑150 (MQ=255) cctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGaa < 2:757584‑M2/112‑1 (MQ=255) tCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAg > 2:425025/1‑150 (MQ=255) ctgcgaagcccaacgaaggcttcgctgaccgaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAg > 2:1158002‑M2/38‑150 (MQ=255) gAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaa < 2:709762/150‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaa > 2:1229946/1‑150 (MQ=255) aaGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaag < 1:1136544/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGTCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaagg < 1:1639/146‑1 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTaaaa > 1:944139/1‑100 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaaggcgaa < 2:1335996/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaagg > 1:1581729/1‑146 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaagg > 2:1639/1‑146 (MQ=255) ttCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTgaagg < 2:1581729/146‑1 (MQ=255) ttGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCt < 2:1168309/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAgg < 1:1422622/78‑1 (MQ=255) ggCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAgg > 2:1422622/1‑78 (MQ=255) gCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAATTCGAAGGCTGCaa > 1:1339332/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCaa > 2:440338/1‑150 (MQ=255) cTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAg < 1:726662/82‑1 (MQ=255) cTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAg > 2:726662/1‑82 (MQ=255) cAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCa < 2:400796/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCa > 2:1887135/1‑150 (MQ=255) aGGCGAGGGGCTTTTTTTTTTTTTT‑TCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGTGGTTGAGCATGCAGGCAGTAGAAGTTAAATGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGTGTTCCTGGGTCGTAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAg > 2:158271/1‑150 (MQ=255) aGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAGGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAg > 2:931888/1‑150 (MQ=255) aGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAg < 1:1253356/150‑1 (MQ=255) aGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCAACACCTTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAg > 1:528038/1‑150 (MQ=255) gaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGa > 1:1284640‑M2/8‑150 (MQ=255) gaggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCACCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGa > 2:1727558‑M2/8‑150 (MQ=255) aggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGaa < 2:630337‑M2/144‑1 (MQ=255) aggggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGaa < 1:1863852‑M2/144‑1 (MQ=255) ggcTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGAACGt > 2:763519‑M2/4‑150 (MQ=255) ttttttGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGAACGTGa > 1:1761263/1‑149 (MQ=255) ttttttGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGAACGTGa < 2:1761263/149‑1 (MQ=255) | GCGTGCGAGGTGCGTGGCATGCCTGATGATATGCGGGAAATTGCCGAGGTCTATGATCTCGATGAAGTGCTGGCAAGCTAGTGGCCAGGCACGGATGATGGCCCCTCGGTCAGCGAAGCCTTCGTTGGGCTTCGCAGGCGAGGGGCTTTTTTGTATGATG‑GCCGACCCGTGCGCATCGGGCGCCGATTGAGGTTGAGCATGCAGGCCGTAGAAGTTAAAAGCTTCCTTGAAGAGAAATTGCCGGGTTCCCGGGTCGAAGTTGAAGGCGAAGGCTGCAACTTCCAGTTGAACGTGA > NC_002947/1102786‑1103080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |