New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3394863 | 47 (0.630) | 4 (0.060) | 4/246 | NT | 8.1% | coding (321/948 nt) | PP_2998 | 2‑dehydropantoate 2‑reductase |
? | NC_002947 | = 3394881 | 45 (0.620) | coding (339/948 nt) | PP_2998 | 2‑dehydropantoate 2‑reductase |
GACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAGGCCATC > NC_002947/3394746‑3395028 | gACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGa > 2:1758383/1‑150 (MQ=255) gATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCgg < 2:885786/150‑1 (MQ=255) gATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCgg < 2:248327/150‑1 (MQ=255) ggtggtggtGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTAGCAGATGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgct < 1:730978/150‑1 (MQ=255) gtggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctg < 1:1686980/150‑1 (MQ=255) gtggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctg > 1:1628395/1‑150 (MQ=255) tggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggtg < 1:1088252/131‑1 (MQ=255) tggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggtg > 2:1088252/1‑131 (MQ=255) tggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg > 1:908722/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAGTCGTTTAACACTGCCGAGGCGATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGGGCTGTAGCTGAAGAACGGGCTCGGCCACGAGGGCAACCTGGCCGAAGTGGTGGGGCGCGGGCGGGCGCTGGGTGGCAAgg > 2:1182340/1‑149 (MQ=255) aaGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGCGTTCTGGCTGGCAAGACCTAt > 1:1533445/1‑150 (MQ=255) cGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAATGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTcg < 2:451232/150‑1 (MQ=255) tttCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCACACGGGCTGATATGCGCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACTTGCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCGAGGCCTAtcgcggg > 2:270455/1‑144 (MQ=255) acTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg < 1:1620551/124‑1 (MQ=255) acTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg > 2:1620551/1‑124 (MQ=255) tGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg < 1:1003549/122‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg > 2:1003549/1‑122 (MQ=255) gAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCCGCGTGctcctc < 2:1818315/150‑1 (MQ=255) ccACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATcca > 1:28428/1‑149 (MQ=255) cACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCGCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgc > 1:902948/1‑150 (MQ=255) aCGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgcg > 1:1394726/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCgcgc < 2:1394726/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGGGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCgcgc > 2:1313626/1‑150 (MQ=255) gATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgtgt < 2:1377645/150‑1 (MQ=255) aTAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGtgtg > 1:1388876/1‑150 (MQ=255) ccACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGggcggc > 1:652154/1‑150 (MQ=255) gACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACa < 1:848642/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGAc > 2:1678739/1‑150 (MQ=255) tGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCCATGTCGGTGGGTTGCTCTTCGCGCGGGGCTCTATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCa < 2:1162035/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTGCACAACGGGCTCGGCCACGAGGATATCCTGGTCGAGGTGGTGGGTCCCGAGCGGGTGCCGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGTTCCTCGCGCCGGGCTTTATGCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCAt < 1:746379/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCGCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCg > 2:400046/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTAATCGGc < 2:652154/150‑1 (MQ=255) gCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGa > 2:706185/1‑150 (MQ=255) tGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGc > 1:1790956/1‑150 (MQ=255) gCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCt > 1:869235/1‑150 (MQ=255) gAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGa < 2:869235/150‑1 (MQ=255) aaCGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGAc < 2:238207/150‑1 (MQ=255) cGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACgg < 2:1790956/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCACGAGGAAATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGGCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCa > 1:892019/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGACGTGGTGGATTGCTAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCGTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGc > 1:151583/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggccgagcccgttctgcagcgacagcaccagcgtctgtgggcctatcagcccgtgggcaccggcgatggcct > 2:302587‑M2/1‑26 (MQ=255) tCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggccgagcccgttctgcagcgacagcaccagcgtctgtgggcctatcagcccgtgggcaccggcgatggcct < 1:302587‑M2/100‑75 (MQ=255) ccACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggccgagcccgttctgcagcgacagcaccagcgtctgtgggcctatcagcccgtgg > 2:1782200‑M2/1‑22 (MQ=255) ccACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggccgagcccgttctgcagcgacagcaccagcgtctgtgggcctatcagcccgtgg < 1:1782200‑M2/80‑59 (MQ=255) aCGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACgg > 1:1131183/1‑149 (MQ=255) aCGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGATGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCATGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGGTGGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGc > 2:688091/1‑150 (MQ=255) aGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGcccc > 1:742254/1‑150 (MQ=255) cATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGt > 1:1404672/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAg < 2:246019/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAg < 2:573553/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAgg < 2:1474616/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAGGCCAt > 2:372571/1‑150 (MQ=255) cGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAGGCCAt > 2:373165/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAGGCCATc < 2:1628395/150‑1 (MQ=255) | GACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGCCAGCTGACGCCCCGCGTGCAGGCCATC > NC_002947/3394746‑3395028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |