New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5816894 = | 26 (0.350) | 13 (0.180) | 10/244 | NT | 26.5% | intergenic (+24/+105) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
? | NC_002947 | 5816989 = | 47 (0.660) | intergenic (+119/+10) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
AGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAACCAGGTTACGCA > NC_002947/5816842‑5817132 | agcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑Cttt > 1:1903194/1‑150 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGCTCGACGTCTTCCGGTACCGGCCCCTGCGCTGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAg < 2:1893789/150‑1 (MQ=39) cagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAgg < 2:1903194/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCt < 1:1727771/150‑1 (MQ=255) ccAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCtt > 2:1443399/1‑150 (MQ=255) gCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGAt < 1:1443399/150‑1 (MQ=255) ggCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTCCTACATGCCTCTCATCAACTCACGGTccc > 2:240522/1‑150 (MQ=37) ggCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTccc > 1:876635/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCGCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑ATTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAAc < 1:240522/150‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTTCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTc > 2:357620/1‑150 (MQ=255) gcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtcggagcgggcgcgcccgcgaaagggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTCGTTCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCCCCATCGTc > 1:681888‑M2/83‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCCGGAACTCCAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCCCCATCGTCAGCac > 1:1737161/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAg > 1:1824017/1‑83 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAg < 2:1824017/83‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATc > 1:13830/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGTTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCACCTCCCTCGTCAGCATCcccccc > 1:1646675/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 2:1374510/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCACGAGAAAAGGCACTTGGTATATGGTTGTTCTCTCAAAT‑AAGACTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCACCCCCGcc > 1:432239/1‑150 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTcc > 2:623273‑M2/71‑118 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTcc < 1:623273‑M2/48‑1 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCt > 1:1326820‑M2/71‑130 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCt < 2:1326820‑M2/60‑1 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCa < 2:132595‑M2/72‑1 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCa > 1:132595‑M2/71‑142 (MQ=255) cacaGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 1:864489/1‑150 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCCGCATccc > 2:1355462‑M2/70‑145 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccc < 1:1355462‑M2/76‑1 (MQ=255) acatgtatgtgatctgcgcccgagagcgacgctctacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgc > 2:551239‑M2/69‑150 (MQ=255) aGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCa < 2:1098931/138‑1 (MQ=255) aGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCa > 1:1098931/1‑138 (MQ=255) aggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaagggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgccg > 1:1435932‑M2/67‑150 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCCCCgccccc > 2:1634487/1‑150 (MQ=255) gcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgccccgcc > 2:145461/1‑150 (MQ=255) gTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCt > 2:1821360/1‑150 (MQ=255) gTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCt > 2:1778792/1‑150 (MQ=255) ctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCa < 1:1821360/150‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGtactac > 1:149245/1‑64 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGtactac < 2:149245/64‑1 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa > 1:1913602/1‑150 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa < 1:145461/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:864489/150‑1 (MQ=255) cAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGAc > 2:691914/1‑150 (MQ=255) gCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCATCCGCCGCCCCGCCCCGCCTCACTGAAGAcca > 2:1258407/1‑148 (MQ=255) cacaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACt < 2:31582/139‑1 (MQ=255) cacaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACt > 1:31582/1‑139 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTgc < 2:876635/150‑1 (MQ=255) tACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:1624220/138‑1 (MQ=255) tACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa > 1:1624220/1‑138 (MQ=255) tacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaagggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGcc < 2:1435932‑M2/116‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCaa < 2:1752754/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGc < 1:691914/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGc < 1:551239/150‑1 (MQ=255) tgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGc > 1:471545‑M2/29‑150 (MQ=255) gCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCATCTCCCCCTCCATTGTCAGTATTCCCTCCCCCGCCCTTCCCTTGATCACTGAAGACATCTGCGCCTACCGccaaaa > 2:1841992/1‑146 (MQ=255) cGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAAACAACTGCGCCAACCGCcccccc > 2:55367/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGa > 2:1334746/1‑119 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGa < 1:1334746/119‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCCCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAACCAgg > 1:1567561/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCCCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCCTCGTCAGCATCCCCTCCACCGCCCCGCCCTGCACCCCCGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCCCCCCAACCAgg > 2:248966/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAAGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTgc > 1:673918/1‑126 (MQ=255) ccGCGAAAGGGC‑CTTTGCAAGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTgc < 2:673918/126‑1 (MQ=255) gAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAACCAGGTTAc > 1:45365/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCCGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCCCCCGAACCAGGGTAc > 1:1250958/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCACCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAACCAGGTTAc > 1:1203459/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGCTCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCCCCCCCCCCCCACCCGGTTACGcc > 2:61134/1‑149 (MQ=255) | AGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGC‑CTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAACCAGGTTACGCA > NC_002947/5816842‑5817132 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |