| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 744924 = | NA (NA) | 60 (1.070) | 44/266 | 0.4 | 93.8% | intergenic (‑586/+45) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
| ? | NC_002947 | = 2218171 | 4 (0.070) | coding (47/828 nt) | PP_1958 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TTTCTTACTCATACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGCTCTGGTAGCGGGGATGGAGGCGCGGAAGAAGTTCGCCAAGAGGTACCGG > NC_002947/2218023‑2218319 | tccacgggcttggggtagaggtagactttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCgt < 1:1058546‑M2/10‑1 (MQ=255) ccacgggcttggggtagaggtagactttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCgtg < 1:533475‑M2/11‑1 (MQ=255) cacgggcttggggtagaggtagactttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCgtgt > 2:319935‑M2/139‑150 (MQ=255) ttACTCATACGGGCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaac < 1:1382183‑M2/150‑6 (MQ=255) tCATACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgat > 1:1365983‑M2/1‑141 (MQ=255) accagcggtccCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATAAGAGAACCTATCACCTTTCCTCCAAGACCATGCGCCGggaaccgag < 1:746980‑M2/145‑10 (MQ=255) cATACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTAAGATTGAACGGGTCAGCTGGGCTATGGCATTCCCTCTACGACCATCACCCGgtaagcgatc > 2:746980‑M2/1‑140 (MQ=255) aTACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatcc < 1:851903‑M2/150‑12 (MQ=255) aTACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccagatc < 1:647687‑M2/150‑12 (MQ=255) tCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaac > 1:896797‑M2/1‑133 (MQ=255) aggtagactttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAg < 2:516963‑M2/28‑1 (MQ=255) ggtagactttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGc < 2:534121‑M2/29‑1 (MQ=255) ctttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCAACAcc < 2:1282550‑M2/35‑1 (MQ=255) cGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctac > 2:1382183‑M2/1‑124 (MQ=255) tttttcgactttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACAccc > 2:498796‑M2/115‑150 (MQ=255) tAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatg > 2:475995‑M2/1‑121 (MQ=255) tAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatg < 1:475995‑M2/135‑15 (MQ=255) tttgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCg > 2:603730‑M2/106‑150 (MQ=255) tgctgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCt > 1:127423‑M2/104‑150 (MQ=255) tgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGc < 1:319935‑M2/50‑1 (MQ=255) tgtcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGc > 1:8244‑M2/101‑150 (MQ=255) tcggggcgcatcatggcgggctggctccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTg < 2:621518‑M2/48‑1 (MQ=255) aTGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaa > 2:851903‑M2/1‑106 (MQ=255) 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tccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTTCGGCTATTTCGAt < 2:512043‑M2/77‑1 (MQ=255) tccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatatggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCa < 2:1031835‑M2/54‑1 (MQ=255) tccagaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatatggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCa > 1:1031835‑M2/74‑127 (MQ=255) ccACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaaca < 1:1220646‑M2/150‑70 (MQ=255) ccACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaaca < 2:1227943‑M2/150‑70 (MQ=255) ccACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGCCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaaca < 1:1112744‑M2/150‑70 (MQ=255) cagaaagaaatcgggatcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGAtgt > 1:1097274‑M2/72‑150 (MQ=255) agaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGAtgtg > 1:1165446‑M2/71‑150 (MQ=255) gaaagaaatcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGAtgtgt > 2:194517‑M2/70‑150 (MQ=255) ttGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccat < 1:1246501‑M2/150‑77 (MQ=255) ttGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccat < 2:1030313‑M2/150‑77 (MQ=255) ttGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaa > 1:880448‑M2/1‑74 (MQ=255) tcgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACg > 1:1157747‑M2/62‑150 (MQ=255) cgggagcacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGa < 2:1165446‑M2/90‑1 (MQ=255) cccacccGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagca < 2:335020‑M2/150‑84 (MQ=255) ccacccGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatg < 1:894389‑M2/143‑78 (MQ=255) ccacccGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatg > 2:894389‑M2/1‑66 (MQ=255) cacagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGtt > 2:708907‑M2/55‑150 (MQ=255) acagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTa < 2:127423‑M2/97‑1 (MQ=255) acagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTa < 1:194517‑M2/97‑1 (MQ=255) cagcatcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAg < 1:77223‑M2/98‑1 (MQ=255) atcgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTAtt < 2:1157747‑M2/102‑1 (MQ=255) cgggaatcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGa < 1:998424‑M2/104‑1 (MQ=255) aCTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaaca < 1:934764‑M2/124‑70 (MQ=255) aCTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaaca > 2:934764‑M2/1‑55 (MQ=255) aCTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccggggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtaga > 1:1368448‑M2/1‑55 (MQ=255) atcaggtggacggttggaatgtggggatgatggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGct < 1:708907‑M2/109‑1 (MQ=255) tgtgAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgcta < 1:1308515‑M2/150‑102 (MQ=255) aaGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccga < 1:1280865‑M2/150‑106 (MQ=255) aGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgat < 2:609326‑M2/150‑107 (MQ=255) aGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctg > 1:433731‑M2/1‑44 (MQ=255) 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2:1220646‑M2/1‑24 (MQ=255) cATTCCCACTAAGACCATCCCACGgtaacccatccatgaaccccacctaccacaaggtagaagcctaggttaccgtgccatctctggcgaacagttccatggcagaagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctc > 1:452640‑M2/1‑24 (MQ=255) ttCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctcca < 2:572984‑M2/150‑129 (MQ=255) ttCCCTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtagaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctcca < 1:1219865‑M2/150‑129 (MQ=255) atggatcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGCTCTGGTAGCGGGGATGGAGGCGCGgaagaa < 1:498796‑M2/138‑1 (MQ=255) ccTCTAAGACTATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatgg > 2:822473‑M2/1‑19 (MQ=255) ccTCTAAGACTATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatgg < 1:822473‑M2/97‑79 (MQ=255) ccTCTAAGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccagga > 1:1386812‑M2/1‑19 (MQ=255) atcccttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGCTCTGGTAGCGGGGATGGAGGCGCGGAAGAAGTTc > 1:442646‑M2/9‑150 (MQ=255) aGACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtggc > 2:1112744‑M2/1‑13 (MQ=255) ttaCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGa < 2:713666‑M2/104‑1 (MQ=255) gACCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtggcg < 1:559260‑M2/150‑139 (MQ=255) aCCATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtggcgc > 1:1030313‑M2/1‑11 (MQ=255) aCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGCTCTGGTAGCGGGGATGGAGGCGCGGAAGAAGTTCGCCAaga > 2:1077269‑M2/2‑150 (MQ=255) cATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtggcgcag < 2:1396069‑M2/150‑142 (MQ=255) cATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagt < 1:121941‑M2/130‑122 (MQ=255) cATCCCCCGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagt > 2:121941‑M2/1‑9 (MQ=255) ccccGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgttaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtgg < 1:627985‑M2/141‑137 (MQ=255) ccccGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGt < 2:889230/91‑1 (MQ=255) ccccGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGt > 1:889230/1‑91 (MQ=255) cccGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgcta > 2:80684‑M2/1‑4 (MQ=255) cccGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgcta < 1:80684‑M2/105‑102 (MQ=255) cccGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTAtt > 1:535116/1‑67 (MQ=255) cGgtaaccgatccatgaaccccacctaccacaaggtggaagccaaagttaccgtggcatctctggcgaacagttccatggcagcagcgcttcgtagtctgctaccgatgaggcgtgcggcagtcgctccaggacgtggcgcagccacgta < 1:1106903‑M2/150‑149 (MQ=255) | TTTCTTACTCATACGGTCCCTGTGGCGATAATGTGGGCTCAAGATGTGCTGCCGATGATAGCTCATGGCCACGTCTTGGCTACCCACCCGTACCACTCCGTGTGAAGGGATCAGAGGAGCTATGGCATTCCCTCTAAGACCATCCCCCGTGTACGCGTCCTCACCCAGCCACACCCTCTGCCTCGCTGGCCTCATGCCGCTCTGCGGCTATTTCGATGTGTGTTTTACGAATCGTTAGTATTGAGCGCTCTGGTAGCGGGGATGGAGGCGCGGAAGAAGTTCGCCAAGAGGTACCGG > NC_002947/2218023‑2218319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |