New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4075786 | NA (NA) | 69 (1.060) | 48/254 | 0.4 | 98.7% | intergenic (‑328/+113) | PP_3586/tpx | transposase/2‑Cys peroxiredoxin |
? | NC_002947 | = 4957611 | 1 (0.010) | intergenic (‑49/+114) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein |
TAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCGGC > NC_002947/4075653‑4075935 | tAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTc > 1:1397192/1‑150 (MQ=34) tAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTc > 2:33643/1‑150 (MQ=34) aaCAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTca < 1:224451/150‑1 (MQ=35) cAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTcaca > 1:404198/1‑150 (MQ=37) aaaGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCttt < 2:486170/149‑1 (MQ=255) aaaGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCttt > 1:486170/1‑149 (MQ=255) ggcTGGCCCTACCGGGCCCACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACt > 2:19025/1‑150 (MQ=255) tGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACATCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACtgtg < 2:316348/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACtgtg > 1:860155/1‑150 (MQ=255) ccTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCCAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGCAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGc > 1:1315188/1‑150 (MQ=255) ccTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGc > 2:1334886/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGc > 2:881650/1‑146 (MQ=255) ccGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGc < 1:881650/146‑1 (MQ=255) ccGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGt > 2:396023/1‑150 (MQ=255) cAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAgg < 2:404198/150‑1 (MQ=255) cAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAgg > 2:906603/1‑150 (MQ=255) aaCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGtt > 2:249509/1‑144 (MQ=255) aaCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGtt < 1:249509/144‑1 (MQ=255) aCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCa > 1:1095454/1‑139 (MQ=255) aCCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCa < 2:1095454/139‑1 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCttt < 1:699925/123‑1 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCttt > 2:699925/1‑123 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCggg < 1:464640/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCcgg < 1:1702015/150‑1 (MQ=255) cttttcttttTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTca > 1:185353/1‑111 (MQ=37) cttgtcttttTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTca < 2:185353/111‑1 (MQ=37) tttttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:1342108/1‑150 (MQ=255) tttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1432578/150‑1 (MQ=255) tttCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:1142273/150‑1 (MQ=255) cAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1100102/1‑150 (MQ=255) acaTGTCCGCCGCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:894319/148‑1 (MQ=255) aTGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 2:1056181/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGcc < 1:1422725/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTTCTGCGCGACCGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGACGCCa > 2:275527/1‑150 (MQ=21) cAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAg > 1:1284857/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGcaca < 1:1494726/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGGCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc < 1:1493130/150‑1 (MQ=255) gCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTAc > 1:285969/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGAcgcc > 2:181703/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:971716/123‑1 (MQ=255) aaGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:971716/1‑123 (MQ=255) aGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGAcgcccgc < 2:113118/150‑1 (MQ=255) gTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGt < 2:669207/107‑1 (MQ=255) gTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGt > 1:669207/1‑107 (MQ=255) tACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGc < 1:906603/150‑1 (MQ=255) cTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCAc > 2:928033/1‑150 (MQ=255) gTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAAt < 2:1315188/150‑1 (MQ=255) tttGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTg > 1:1168269/1‑84 (MQ=255) tttGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTg < 2:1168269/84‑1 (MQ=255) tttGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATc > 2:487817/1‑150 (MQ=255) tgcGCGACAGCGCAGACCGGAAGGGCTGGGGGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTAc > 2:705478/1‑150 (MQ=255) tgcACGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTAc > 2:711218/1‑150 (MQ=255) cgACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCa < 2:1284857/150‑1 (MQ=255) cgACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCa < 1:33643/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAg > 2:375845/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAg < 1:396023/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTAca < 1:19025/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACACCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAgcg > 1:565601/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCgg > 1:1195259/1‑70 (MQ=255) ggAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCgg < 2:1195259/70‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGcgccgc < 1:1334886/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCgccgcc < 1:181703/150‑1 (MQ=255) gggCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCt < 1:1363840/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTc < 2:659303/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTc < 1:928033/150‑1 (MQ=255) tGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGTGGCCAGGATGATCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTa < 2:44976/150‑1 (MQ=255) tGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTa < 1:552006/150‑1 (MQ=255) tGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTa < 1:711218/150‑1 (MQ=255) ggTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 1:770308/80‑1 (MQ=255) ggTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa > 2:770308/1‑80 (MQ=255) aTCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCgg > 1:694596/1‑150 (MQ=255) aTCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGATTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCgg < 1:705478/150‑1 (MQ=255) tctcCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCGGc < 1:935940/150‑1 (MQ=255) | TAACAAAGCAAAAGGCGGCTGGCCCTACCGGGCCAACCGCCTTTTCTTTTTCAAAATGTCAGCGTCGCTGCGGAACTGAAGCCGTACACCTCATGTTTGCTGCGCGACAGCGCAGCCCGGAAGGGCTGGGTGATCTCCTACGGGGATGTCACAGCCTTTGAAAACTGTGCCGCACGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCTACAGACGCCCGCCCTGCCCCACGCAATCCTTACTTCAGTACAGCCAGCGCCGCCTCGTAGTTCGGC > NC_002947/4075653‑4075935 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |