| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 486032 = | 17 (0.900) | 3 (0.170) | 3/232 | NT | 15.4% | coding (286/381 nt) | apaG | Co(2+)/Mg(2+) efflux protein |
| ? | NC_002947 | 486064 = | 17 (0.960) | coding (254/381 nt) | apaG | Co(2+)/Mg(2+) efflux protein | |||||
ATTTGAGCGGCTGCAGGCAGCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTGATCAGCCAGTGGCGCGA > NC_002947/485886‑486176 | aTTTGAGCGGCTGCAGGCAGCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCACTCTCGGCGTCGAAGCGCTTCCCGTCCTCGGCGAAAATATCGTAGCTGCCCTTCATgtt > 2:158178/1‑148 (MQ=255) gCGGCTGCAGGCAGCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAAc > 1:355927/1‑150 (MQ=255) aggcagCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCgggaga > 1:492540/1‑147 (MQ=255) cagCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCtga < 2:360787/150‑1 (MQ=255) cAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGca < 2:355927/150‑1 (MQ=255) gcgccactggctgatcaccaacggtgacggcgaggtagaggaagtacgcggcgccggcgtggtcggccagcaacccaacatcgaccctggccagagccacacttacagcagt < 1:268972‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgccactggctgatcaccaacggtgacggcgaggtagaggaagtacgcggcgccggcgtggtcggccagcaacccaacatcgaccctggccagagccacacttacagcagt > 2:268972‑M1/112‑112 (MQ=255) gcgccactggctgatcaccaacggtgacggcgaggtagaggaagtacgcggcgccggcgtggtcggccagcaacccaacatcgaccctggccagagccacacttacagcagTGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGt > 1:241573‑M1/112‑150 (MQ=255) gCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTGGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGAGGAGACCACTGCTGTGAGTGTGGctct > 2:118388/1‑150 (MQ=255) gCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGctct > 2:416853/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAggg > 1:498810/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTc < 1:136686/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGtt < 2:174272/150‑1 (MQ=255) cGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTgg < 2:498810/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCCGGAAGGGCGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTg > 2:353468/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGc > 1:48445/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCa > 2:91781/1‑150 (MQ=255) tcGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGGTGTTGGGTTGCTGGCAGACCACGCCGGCGCCGCGt > 1:225021/1‑150 (MQ=255) gtcggccagcaacccaacatcgaccctggccagagccacacttacagcagTGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCActgc < 1:354114‑M1/36‑1 (MQ=255) gtcggccagcaacccaacatcgaccctggccagagccacacttacagcagTGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCActgc > 2:354114‑M1/51‑86 (MQ=255) aaGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCctct > 1:106078/1‑150 (MQ=255) aaCATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTg < 1:353468/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTGATCAGCCAGTGgc > 1:356010/1‑150 (MQ=255) cTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTGATCAGCCAGTGGCGCGa < 1:454329/150‑1 (MQ=255) cTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTGATCAGCCAGTGGCGCGa < 1:416853/150‑1 (MQ=255) | ATTTGAGCGGCTGCAGGCAGCCCTGCAGGTCACCGACGGCGTAGGTGGCCATCAGTGCAGCGCTCCGGGCACTGCCAGCCGGAAGGGGGCAATCTCGGCGTCGAAGCGCTTACCGTCCTCGGCGAACATCTGGTAGCTGCCCTGCATGGTGCCAACGCGGGTGCTGATGACGGCACCACTGCTGTAAGTGTGGCTCTGGCCAGGGTCGATGTTGGGTTGCTGGCCGACCACGCCGGCGCCGCGTACTTCCTCTACCTCGCCGTCACCGTTGGTGATCAGCCAGTGGCGCGA > NC_002947/485886‑486176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |