| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3339160 = | 13 (0.690) | 5 (0.320) | 5/202 | NT | 29.7% | intergenic (‑119/+124) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
| ? | NC_002947 | 3339248 = | 13 (0.840) | intergenic (‑207/+36) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase | |||||
GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCA > NC_002947/3339011‑3339279 | gcgagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcc < 1:375188‑M1/1‑1 (MQ=255)gACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTAc > 1:442621/1‑150 (MQ=255) gttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCtt > 2:378042‑M1/146‑150 (MQ=255) gCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTc > 1:233943/1‑150 (MQ=255) gggggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTcgc < 1:337019/150‑1 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg < 2:60437‑M1/10‑1 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcaccgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg > 1:159889‑M1/141‑150 (MQ=255) gtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccacctcggatggccgggcCTCTTCGCGggcaa < 1:348271‑M1/14‑3 (MQ=255) gttgttGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGc < 2:92889/150‑1 (MQ=255) gttgttGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGc < 2:404679/150‑1 (MQ=255) gggCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGAAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGcc > 2:329560/1‑150 (MQ=255) ggCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGccc < 2:400854/150‑1 (MQ=255) ggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGcc < 2:157446‑M1/17‑1 (MQ=255) ggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGcc > 1:157446‑M1/100‑116 (MQ=255) agcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTgg > 1:136592‑M1/85‑150 (MQ=255) gAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGa > 2:112356/1‑150 (MQ=255) gACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCg < 2:442621/150‑1 (MQ=255) agGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATc > 2:375188/1‑150 (MQ=255) ggCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATc‑c > 2:370476/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCTGGCCATCTCG‑GATGGCCGGGc < 1:329560/150‑1 (MQ=39) attgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAagag < 2:214763‑M1/88‑1 (MQ=255) attgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAagag > 1:214763‑M1/38‑125 (MQ=255) cgGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGCGATGTCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGACCAATAACTGCGCCGTCCCCGTGGGCGGGGGCAAGCCCGCGGGCAGACCCGGCCATC‑CTATAGGGTTATGCCGTcc < 2:260805/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCa > 1:60437/1‑150 (MQ=255) atctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTggg > 2:247921‑M1/18‑84 (MQ=255) atctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTggg < 1:247921‑M1/67‑1 (MQ=255) | GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCA > NC_002947/3339011‑3339279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |