| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1895760 | 18 (0.960) | 4 (0.220) | 4/234 | NT | 17.7% | coding (952/1986 nt) | PP_1700 | acyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 1895766 | 20 (1.120) | coding (958/1986 nt) | PP_1700 | acyltransferase | |||||
GGCAACTCGTGGTTCTGGTTTGTCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGACTGGCTGGCACTGCTGG > NC_002947/1895622‑1895910 | ggCAACTCGTGGTTCTGGTTTGTCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCCCGCTGTTGTgcgag > 1:403292‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTTGTCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTgcgagc < 2:310042‑M2/135‑7 (MQ=255) ggTTTGTCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTgcgagc > 1:310042‑M2/1‑129 (MQ=255) tCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTg < 2:86178/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTg > 1:86178/1‑149 (MQ=255) tCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCGTCGCCTTATGCTAACAGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGc > 2:140956/1‑150 (MQ=255) gCCTATGCGAAGGGTTGGCGCCACGGGGAGGGCACGGTGGTGTCTCTGGTGCTGATCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGCTCGGCTCGTTc < 2:62508/150‑1 (MQ=255) ccTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCg < 1:305800/150‑1 (MQ=255) gATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGt > 1:489082/1‑107 (MQ=255) gATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGt < 2:489082/107‑1 (MQ=255) aCGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCctgc > 2:183007/1‑150 (MQ=255) gTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCCGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCtgt > 2:61698/1‑150 (MQ=255) gATGGCACGCTCGTGACCCCGGTGCTGCGCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCTAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCGGTTCGGCTCGTTCGGCCTGCCCCTGTTCGGCCTGCTgtgg < 2:122112/150‑1 (MQ=255) tGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTAc > 2:423398/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGTTGTACCGGCTgg > 2:369298/1‑149 (MQ=255) tcGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAgcg > 1:214599/1‑150 (MQ=255) gTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGt < 2:267817/97‑1 (MQ=255) gTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGt > 1:267817/1‑97 (MQ=255) cATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTgcgagcccagggcaatgcccaccgagaacagggtcagcaccagggtcaccaccgtgccatcaccgt < 1:77799‑M2/89‑67 (MQ=255) cATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTgcgagcccagggcaatgcccaccgagaacagggtcagcaccagggtcaccaccgtgccatcaccgt > 2:77799‑M2/1‑23 (MQ=255) cccTGGGCTCGCTGTTGTgcgagcccagggcaatgcccaccgagaacaggg < 2:307844‑M2/51‑34 (MQ=255) cccTGGGCTCGCTGTTGTgcgagcccagggcaatgcccaccgagaacaggg > 1:307844‑M2/1‑18 (MQ=255) ccTGGGCTCGCTGTTGTGCGATCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCCGCGCCGCACGActggct < 2:261152/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGActggctg > 2:168697/1‑150 (MQ=255) gCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGACTGGCTGGCAc < 1:183007/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGACTGGCTGGCActgct > 1:78651/1‑150 (MQ=255) tgttgtGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGACTGGCTGGCACTGCTgg < 1:301903/150‑1 (MQ=255) | GGCAACTCGTGGTTCTGGTTTGTCGGCGCCATCTACCTCACGCAGATCCCGGCCTATGCCAAGGATTGGCTGCACGGTGATGGCACGGTGGTGACCCTGGTGCTGACCCTGTTCTCGGTGGGCATTGCCCTGGGCTCGCTGTTGTGCGAGCGGCTCAGTGGACGCAAGGTGGAAATCGGCCTGGTGCCGTTCGGCTCGTTCGGCCTGACCCTGTTCGGCCTGCTGTGGTGGTGGCACTCCGGTGATGTACCGGCTGCAGCAGCGCCGCACGACTGGCTGGCACTGCTGG > NC_002947/1895622‑1895910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |