New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4117899 | 23 (1.220) | 4 (0.230) | 4/232 | NT | 15.2% | coding (545/2256 nt) | PP_3622 | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
? | NC_002947 | = 4117925 | 23 (1.300) | coding (571/2256 nt) | PP_3622 | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
CCACCATGCGCCGTCTGGGCGCGCTCGCCCGGGGCATGCTGCTGCAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCAGTACTGCATC > NC_002947/4117776‑4118065 | ccaccaTGCGCCGTCTGGGCGCGCTCGCCCGGGGCATGCTGCTGCAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTgg > 2:448550/1‑150 (MQ=255) ccaTGCGCCGTCTGGGCGCGCTCGCCCGGGGCATGCTGCTGCAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccg < 2:165449‑M2/150‑4 (MQ=255) ccaTGCGCCGTCTGGGCGCGCTCGCCCGGGGCATGCTGCTGCAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccg > 1:63091‑M2/1‑147 (MQ=255) tgctgcAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCa > 2:91265/1‑150 (MQ=255) gcgcCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTgc < 1:91265/150‑1 (MQ=255) acCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCcca > 1:409076/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCccagc > 2:385441/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGCTGCCCGACCCGGCCTGCGTCAAGCTGCGCGACCccagc > 1:246035/1‑150 (MQ=255) gtgtACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGt > 1:18951/1‑150 (MQ=255) gtACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGttt < 2:18951/150‑1 (MQ=255) ggTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTg > 1:223951/1‑150 (MQ=255) tGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTgg > 2:301115/1‑150 (MQ=255) gCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGaaa < 1:94690/150‑1 (MQ=255) ttCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGcc < 1:34801/150‑1 (MQ=255) cTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCg < 1:168532/150‑1 (MQ=255) tACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGt < 1:448550/150‑1 (MQ=255) ggTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTg > 1:420694/1‑150 (MQ=255) aaCGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGAt < 1:505585/150‑1 (MQ=255) gtagtaCATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGcc > 1:447010/1‑150 (MQ=255) tagtaCATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCt < 1:501572/150‑1 (MQ=255) aCATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGa > 2:507603/1‑150 (MQ=255) aTACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccggtcgtggtatgtactacgttacccggtgtggtagaaagctcatcgaccggtacacccaggtgttcggcgc < 2:348565‑M2/112‑74 (MQ=255) aTACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccggtcgtggtatgtactacgttacccggtgtggtagaaagctcatcgaccggtacacccaggtgttcggcgc > 1:348565‑M2/1‑39 (MQ=255) ccACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccggtcgtggtatgtactacgttacccggtgtggtagaaagctcatcgaccggtacacccaggtgttcggcgcccgcctgcagcagcatgccccgggcgagcgcgcccagacg > 1:54615‑M2/1‑36 (MQ=255) ccACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGccggtcgtggtatgtactacgttacccggtgtggtagaaagctcatcgaccggtacacccaggtgttcggcgcccgcctgcagcagcatgccccgggcgagcgcgcccagacg < 2:54615‑M2/149‑114 (MQ=255) aCCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCAcc < 2:420694/150‑1 (MQ=255) gTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCAg < 2:447010/150‑1 (MQ=255) ccTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCa > 1:406330/1‑145 (MQ=255) ccTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCa < 2:406330/145‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCCACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCAGTACTGCATc < 1:33472/150‑1 (MQ=255) | CCACCATGCGCCGTCTGGGCGCGCTCGCCCGGGGCATGCTGCTGCAGGCGGGCGCCGAACACCTGGGTGTACCGGTCGATGAGCTTTCTACCACACCGGGTAACGTAGTACATACCACGACCGGACGTTCCGTACCCTACGGTGAGCTGGCCGGTCGCGCCATGGACCTGCCGGTGCCCGACCCGGCCAGCGTCAAGCTGCGCGACCCCAGCCAGTTTCGCTGGATTGGAAAGCCCGTACGCCGCCTGGATGCCTACGACAAGTCCACCGGCAAGGCCCAGTACTGCATC > NC_002947/4117776‑4118065 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |