New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1064979 | 67 (1.480) | 3 (0.070) | 3/230 | NT | 5.2% | intergenic (+33/+80) | PP_0922/PP_0923 | hypothetical protein/acyltransferase |
? | NC_002947 | = 1065023 | 48 (1.150) | intergenic (+77/+36) | PP_0922/PP_0923 | hypothetical protein/acyltransferase |
GCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGTGAATC > NC_002947/1064833‑1065128 | gCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTaaa > 1:910600/1‑150 (MQ=255) cGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTGTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGAGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGCGTAAAcc > 1:200783/1‑150 (MQ=255) gggTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 2:92454/1‑150 (MQ=255) ggTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:56845/1‑150 (MQ=255) tGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGGGGTGTGTGGGTAGAGCTTGGCTCTTCGCGAGTAAACCCGcac > 2:1183925/1‑148 (MQ=255) gATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:751365/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:963281/1‑150 (MQ=255) aCTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCGGCTTCTTCGGACaa > 2:834429/1‑150 (MQ=255) ttGGAGCGGCTGTATGAGGCGCTGGTGGCGGATTTTCGCGATTGCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCTGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTTCGTGATACTGGCCTCTTCTCGGGTATACCCGCTTCTACGGGCAAt < 2:549059/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt > 1:163169/1‑150 (MQ=255) cTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt < 2:1177228/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATgcg > 2:1176328/1‑150 (MQ=255) ccgCTGTATGAGGCGCTGCTGGCGGATTGTCGCTACTTCTACCCGAAGCTTCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATTTCTGACAGTTAGATGTATGTTGGGGATTGTGGCCGCTTCGCGGGTATACCCGCGCCTACGGGCGATGCGCTc < 2:61645/148‑1 (MQ=255) aTGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 1:524840/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCg > 2:392490/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCgg < 1:92454/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCggg > 2:917496/1‑150 (MQ=255) gctgctGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCggg < 2:963281/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCa > 2:163169‑M2/1‑149 (MQ=255) gCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt < 2:521296/123‑1 (MQ=255) gCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt > 1:521296/1‑123 (MQ=255) gCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCaccc > 1:917496‑M2/1‑146 (MQ=255) gCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCAGTTCGTTTTGGAGCGGGTTCaccc < 2:1182761‑M2/150‑5 (MQ=255) ttttCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCggg > 2:34734/1‑138 (MQ=255) ttttCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCggg < 1:34734/138‑1 (MQ=255) ttCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 1:529819‑M1/150‑56 (MQ=255) ttCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAg < 2:910600/150‑1 (MQ=255) gcgAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTCGCCTCTTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGc > 1:143129/1‑150 (MQ=255) cgAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGcc > 1:915818/1‑150 (MQ=255) gTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGa > 1:715702/1‑150 (MQ=255) ttCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 2:824967/121‑1 (MQ=255) ttCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg > 1:824967/1‑121 (MQ=255) cTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACa > 2:173623/1‑150 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGGGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGGAGGAACGGGTTCACCCGCGAAGGGGCAAGAACAg > 2:545451/1‑150 (MQ=39) ccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg > 2:193376/1‑115 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 1:627954/115‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg > 2:627954/1‑115 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 1:193376/115‑1 (MQ=255) gCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGt > 2:1119145/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCa < 2:751365/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAg < 2:715702/150‑1 (MQ=255) cGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCa < 1:1119145/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:463563/76‑1 (MQ=255) gTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:463563/1‑76 (MQ=255) gTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAg < 1:173623/150‑1 (MQ=255) gcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGAGTAAACCCGCTCCTACGGCAAATGCGCTCGGGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCACGGCAGGCATTCAGGCAGccc > 1:632853/1‑150 (MQ=39) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCt < 2:56845/150‑1 (MQ=255) gCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCgg > 2:968802/1‑81 (MQ=255) gCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCgg < 1:968802/81‑1 (MQ=255) ggATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAg > 1:307251/1‑105 (MQ=255) ggATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAg < 2:307251/105‑1 (MQ=255) cTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTgg > 2:1038893/1‑150 (MQ=255) tGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttac > 1:196134‑M1/1‑43 (MQ=255) tGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttac < 2:196134‑M1/89‑47 (MQ=255) tGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCATGTCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGgc > 1:886504/1‑150 (MQ=255) aCAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCCATGCGCCCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGgcgc > 2:130418/1‑150 (MQ=255) aCAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGt < 2:713664/145‑1 (MQ=255) aCAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGt > 1:713664/1‑145 (MQ=255) gTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCAt < 1:1182761/150‑1 (MQ=255) gtgtgtGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCCGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACg > 2:766400/1‑150 (MQ=255) gtgtgtGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACg > 1:1157605/1‑150 (MQ=255) tgtgGGTGATACTGGCCTCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCt < 1:422794/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATgcg > 1:732303/1‑52 (MQ=255) tgtgGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATgcg < 2:732303/52‑1 (MQ=255) tgtgGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTgga < 2:666627/135‑2 (MQ=255) tgtgGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTgga > 1:666627/1‑134 (MQ=255) ggTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCac > 2:1187566‑M2/1‑68 (MQ=255) ggTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCac < 1:1187566‑M2/70‑3 (MQ=255) gTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACTCCCTCCTACGGGCAATGCGCGCGGTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCTAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAAc < 1:1183925/150‑1 (MQ=38) gTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAAc < 2:378144/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGaa < 2:628089/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGaa > 2:301983/1‑147 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGaa < 1:301983/147‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAg > 2:958845/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAgc < 1:392490/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCAACCAggc > 2:973995/1‑148 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgaa < 1:529819‑M2/150‑96 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGt > 1:550751/1‑150 (MQ=255) gggTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgaaaatccgc > 1:917496‑M1/1‑4 (MQ=255) gggTgaacccgctccaaaacgaactgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgaaaatccgc < 2:1182761‑M1/150‑147 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGTGaa > 1:543655/1‑150 (MQ=255) gTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacc > 2:1187566‑M1/1‑2 (MQ=255) gTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacc < 1:1187566‑M1/70‑69 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtca > 1:196134‑M2/1‑46 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtca < 2:196134‑M2/89‑44 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGgcgc < 1:905113/111‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGgcgc > 2:905113/1‑111 (MQ=255) tgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgaaaatccgccag > 2:163169‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGTGAATC > NC_002947/1064833‑1065128 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |