New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1177323 = | 37 (0.820) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 9.3% | coding (200/1578 nt) | guaA | glutamine‑hydrolyzing GMP synthase |
? | NC_002947 | 1177348 = | 42 (0.950) | coding (225/1578 nt) | guaA | glutamine‑hydrolyzing GMP synthase |
CCAGTACACCCAGCTGATCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCGTGTGGACGTTGTC > NC_002947/1177174‑1177471 | ccAGTACACCCAGCTGATCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCaa < 2:479944/150‑1 (MQ=255) gTACACCCAGCTGATCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAg > 1:139510/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGATCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGGACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCcgcg > 1:578288/1‑150 (MQ=255) cAGCTGAGCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCcgcg‑c < 2:453035/150‑1 (MQ=255) gTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGCAGCCAGCAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGttt > 2:1057352/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGa < 2:762735/150‑1 (MQ=255) cgcgAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCCAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCCCGGCAGCCCGTGCTTggc < 2:321864/150‑3 (MQ=255) cgAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCt > 2:475582/1‑150 (MQ=255) gAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTg > 1:211018/1‑150 (MQ=255) gCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGc < 1:775566/150‑1 (MQ=255) gCGTGTACTGCCATCTTCTCCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGCTCCGCGAATTCAACCCGCTCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGc < 2:578288/150‑1 (MQ=255) gcaggtcggaaccttctaccttgccgcccatctgctcggccatggtctgcatgccgtagcagatacccagcacaggcacattcaggtcaaacACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGAcc > 1:862699‑M1/93‑125 (MQ=255) gcaggtcggaaccttctaccttgccgcccatctgctcggccatggtctgcatgccgtagcagatacccagcacaggcacattcaggtcaaacACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGAcc < 2:862699‑M1/33‑1 (MQ=255) cACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGc < 2:922498/150‑1 (MQ=255) cccGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTa > 2:274719/1‑150 (MQ=255) gACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATg > 2:1139495/1‑150 (MQ=255) gACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGAcc > 2:36404/1‑150 (MQ=255) gACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGAc > 2:95630/1‑149 (MQ=255) gACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGAc < 1:95630/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATgg > 2:682207/1‑150 (MQ=255) gcgAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATgg > 1:697226/1‑150 (MQ=255) gcgAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATgg > 1:697176/1‑150 (MQ=255) gctcggccatggtctgcatgccgtagcagatacccagcacaggcacattcaggtcaaacACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGttt < 2:226725‑M1/29‑1 (MQ=255) gctcggccatggtctgcatgccgtagcagatacccagcacaggcacattcaggtcaaacACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGttt > 1:226725‑M1/60‑88 (MQ=255) aaCCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGTCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAg < 1:1057352/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCAAAAAGCCAGCGACGC‑CCTCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTCCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAg < 1:274719/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGaa > 1:694867/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCt < 2:1126293/79‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCt > 1:1126293/1‑79 (MQ=255) tCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGc < 1:1139495/150‑1 (MQ=255) catctccgcCCCGCGGCGGTCCACGAAGCCCACAGGCCGCT‑CTTCCGGCCGTCCTTGTTTGAGCTGAATGTGCCTGTCCTAGTTATTTGCGAAGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGAGCGGCCGCCAGCTAGAAGGTTCCGCCCTGCGt < 2:182567/143‑1 (MQ=255) gcggcCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGt > 2:508838/1‑150 (MQ=255) ggcCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGGAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGATc > 1:182567/1‑150 (MQ=255) ccGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGc < 2:417982/138‑1 (MQ=255) ccGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGc > 1:417982/1‑138 (MQ=255) cGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATgg < 2:154168/98‑1 (MQ=255) cGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATgg > 1:154168/1‑98 (MQ=255) gTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGc < 1:475582/150‑1 (MQ=255) ggTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCg > 2:803565/1‑150 (MQ=255) tCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCgtg > 1:529097/1‑150 (MQ=255) cACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACATGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAgg < 2:829535/116‑1 (MQ=255) cACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACATGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAgg > 1:829535/1‑116 (MQ=255) gAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCGTGTGGAc < 2:529097/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGc < 2:633895/129‑1 (MQ=255) aaCAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGc > 1:633895/1‑129 (MQ=255) aaCAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCGTGTGGACGTTGTc > 1:756655/1‑150 (MQ=255) | CCAGTACACCCAGCTGATCGCCCGCCGCGTGCGCGAAATCGGCGTGTACTGCGAACTGCACCCGTTCGACATGGACGATGAAGCGATCCGCGAATTCAACCCGCGCGGCATCATCCTCGCCGGCGGCCCCGAGTCGGTCCACGAAGCCAACAGCCCGCG‑CGCTCCGCAGGCCGTGTTTGACCTGAATGTGCCTGTGCTGGGTATCTGCTACGGCATGCAGACCATGGCCGAGCAGATGGGCGGCAAGGTAGAAGGTTCCGACCTGCGTGAGTTCGGCTATGCCCGTGTGGACGTTGTC > NC_002947/1177174‑1177471 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |