New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1223780 | 46 (1.020) | 5 (0.120) | 3/236 | NT | 10.1% | coding (272/771 nt) | gltL | glutamate/aspartate ABC transporter ATP binding protein |
? | NC_002947 | = 1223795 | 45 (1.050) | coding (257/771 nt) | gltL | glutamate/aspartate ABC transporter ATP binding protein |
GAGGCCTACACGGTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACGGGCCACAGACCAC > NC_002947/1223638‑1223925 | gAGGCCTACACGGTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGa < 1:1044619/150‑1 (MQ=255) gAGGCCTACACGGTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGa < 2:947966/150‑1 (MQ=255) gCCTACACGGTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAgcg > 1:245924/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCAACGC‑GCGAGCGCAGCTtgg < 2:557525‑M2/150‑4 (MQ=255) tCGAGCAGCGCCAGGACCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggc > 1:4835‑M2/1‑145 (MQ=255) agcagcGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAgg < 2:718003/150‑1 (MQ=255) agcGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTg < 2:51384/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACCCCATTCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTgg < 1:585400/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCt > 2:1047728/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCAAGCTGCGCTCGC‑GCGtgggcatggtgttcca > 2:611350‑M2/1‑134 (MQ=255) ggCCCTTCTTGGTGGCGTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCGGCGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCg < 1:1188679/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCgg < 2:245924/150‑1 (MQ=255) cttcttGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTc > 2:1136099/1‑150 (MQ=255) tcttGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCgg < 1:181302/150‑1 (MQ=255) cttGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggc > 1:288886‑M2/1‑125 (MQ=255) cttGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggc < 2:288886‑M2/130‑6 (MQ=255) ggtggCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTg < 2:380379/133‑1 (MQ=255) ggtggCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCCCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTg > 1:380379/1‑133 (MQ=255) gCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCGTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGaa < 2:1024084/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGt > 2:907939/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtg > 1:387766‑M2/1‑110 (MQ=255) cTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtg < 2:387766‑M2/112‑3 (MQ=255) tGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCg < 2:645886/123‑1 (MQ=255) tGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGGCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCg > 1:645886/1‑123 (MQ=255) aGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGGAGAGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCg > 1:1074590/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTc > 2:477016/1‑107 (MQ=255) ccTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTc < 1:477016/107‑1 (MQ=255) ttGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCAagctgtgcgcgcgcgtgggcatg > 1:379993‑M1/1‑76 (MQ=255) ttGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatg < 2:379993‑M1/99‑24 (MQ=255) ttGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatg < 1:418643‑M1/99‑24 (MQ=255) ttGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatg > 2:418643‑M1/1‑76 (MQ=255) cgcTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTgg > 2:488740/1‑150 (MQ=255) cgcTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTgg < 1:907939/150‑1 (MQ=255) cAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAg > 1:436294/1‑88 (MQ=255) cAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAg < 2:436294/88‑1 (MQ=255) cAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCt > 1:324365/1‑150 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTc < 1:758996/102‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTc > 2:758996/1‑102 (MQ=255) ggTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAg < 1:942464/150‑1 (MQ=255) tCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAgcg > 2:605417/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAgcg > 2:863031/1‑150 (MQ=255) ggTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGt < 2:303802/150‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGtt > 1:853881/1‑150 (MQ=255) tcGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑ACCAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACg > 2:466157/1‑150 (MQ=255) gTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCAc < 2:324365/150‑1 (MQ=255) tGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCCCGC‑GCGCGCGCCATTTATTTGCGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATAGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACt < 1:1047728/150‑1 (MQ=255) tGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTg > 1:922887/1‑150 (MQ=255) tGCGGGAACAGCTCCAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTg < 1:550699/150‑1 (MQ=255) cTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCCAGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTgcccga < 1:605417/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTgcccgagc < 1:488740/150‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTgcccgagccc < 1:1136099/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTgcccgtcgggct > 1:442855/1‑143 (MQ=255) gTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTgcccgagcccga < 1:464317/150‑1 (MQ=255) cTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACgg < 2:638521/150‑1 (MQ=255) tGGAACACCATGCCCAcgcgcgagcgcagcttgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgaggcggaagccaccaagaagggcctg > 2:611350‑M1/1‑16 (MQ=255) tGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCCGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGACCCGCGCCATC‑CTGTGCGTGCACGGCTCGAGCGGGTTGAGGCAATGGCTCAGTGTGCTTGTGCCCGAGCCCGACggg > 1:21355/1‑150 (MQ=255) tGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACggg > 2:76081/1‑150 (MQ=255) cATGCCCACGC‑GCGCGCACAGCTtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaa > 1:379993‑M2/1‑23 (MQ=255) cATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaa > 2:418643‑M2/1‑23 (MQ=255) cATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaa < 2:379993‑M2/99‑77 (MQ=255) cATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaa < 1:418643‑M2/99‑77 (MQ=255) cATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACGGGCCACAGac > 1:126821/1‑150 (MQ=255) gCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgaggcggaagccaccaagaaggtcctggcgctgctcga > 1:4835‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgaggcggaagccaccaag < 2:288886‑M1/130‑126 (MQ=255) gCCCAagctgcgctcgcgcgtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgaggcggaagccaccaag > 1:288886‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACGGGCCACAGaccac < 1:769187/150‑1 (MQ=255) ccAagctgcgctcgcgcgttggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgaggcggaagccaccaagaagggcctggcgctgctcgacc < 2:557525‑M1/150‑148 (MQ=255) cAagctgcgctcgcgcgtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgag > 1:387766‑M1/1‑2 (MQ=255) cAagctgcgctcgcgcgtgggcatggtgttccagcacttcgagctgttcccgcacctgaccatcaccgagaacctgaccattgcccagcgcaaggtactgggccgcagcgag < 2:387766‑M1/112‑111 (MQ=255) cACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACTGCTCCAGCGCGTTGACGCACt > 2:633095/1‑104 (MQ=255) cACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACTGCTCCAGCGCGTTGACGCACt < 1:633095/104‑1 (MQ=255) | GAGGCCTACACGGTCGAGCAGCGCCAGGCCCTTCTTGGTGGCTTCCGCCTCGCTGCGGCCCAGTACCTTGCGCTGGGCAATGGTCAGGTTCTCGGTGATGGTCAGGTGCGGGAACAGCTCGAAGTGCTGGAACACCATGCCCACGC‑GCGAGCGCAGCTTGGGCAGGTTGGTCTTCGGGTCGGCAATCGAAGTGCCATCGA‑CCACGATGTCGCCCTTCTGGAACGGCTCCAGCGCGTTGACGCACTTGATCAGGGTGGACTTGCCCGAGCCCGACGGGCCACAGACCAC > NC_002947/1223638‑1223925 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |