New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1335055 | 47 (1.040) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 9.0% | coding (224/990 nt) | PP_1160 | asparaginase family protein |
? | NC_002947 | = 1335089 | 35 (0.790) | coding (258/990 nt) | PP_1160 | asparaginase family protein |
TCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGT > NC_002947/1334908‑1335203 | tCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGCATTGCGACCAGGTCCTTGATGAGGGGCCACAATTGCGCGAAATAGCTCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCAt < 1:569917/150‑1 (MQ=255) aCGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAg < 1:660329/150‑1 (MQ=255) aCGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTACCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAg < 2:364781/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGt > 2:658526/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCAt < 2:784133/133‑1 (MQ=255) ccAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCAt > 1:784133/1‑133 (MQ=255) aaGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGa < 2:763254/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGa < 2:913545/150‑1 (MQ=255) gCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAgc > 2:1096615/1‑150 (MQ=255) tGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGcgcg > 1:805444/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGTGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCgg < 2:1073066/150‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCggg < 2:743309/150‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCggg < 2:612465/150‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCggg < 1:382228/150‑1 (MQ=255) tgAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCa < 1:1096615/150‑1 (MQ=255) gCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCtt < 1:388639/150‑1 (MQ=255) cAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTg < 2:1057924/150‑1 (MQ=255) cAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTg < 1:170073/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTTAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGa < 1:208381/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATAGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGc < 1:75229/150‑1 (MQ=255) gTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCaa > 1:583313/1‑150 (MQ=255) ccACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAggg > 1:525702/1‑150 (MQ=255) cgAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGGGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCt > 2:1114011/1‑150 (MQ=255) gAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCtt > 2:602673/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTg < 2:525702/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa < 2:222555/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTg < 2:921567/118‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTg > 1:921567/1‑118 (MQ=255) ttGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGcc < 1:658526/150‑1 (MQ=255) ttCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGa > 2:721075/1‑150 (MQ=255) aTTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGcc > 1:809610/1‑107 (MQ=255) aTTGTCCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGcc < 2:809610/107‑1 (MQ=255) tgCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGctc > 2:354032/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGctct < 1:721075/150‑1 (MQ=255) tGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCGATGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGc > 1:1168045/1‑150 (MQ=255) gCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGcc > 1:1091456/1‑150 (MQ=255) ccccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCctgagccccgcgctccacctcgccccgggcccatgcca < 2:649518‑M1/83‑39 (MQ=255) ccccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCctgagccccgcgctccacctcgccccgggcccatgcca > 1:649518‑M1/1‑45 (MQ=255) cccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa > 2:349239/1‑114 (MQ=255) cccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa < 1:349239/114‑1 (MQ=255) aGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCctgagccccgcgctccacctcgccccgggccca > 1:1201772‑M1/1‑41 (MQ=255) aGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCctgagccccgcgctccacctcgccccgggccca < 2:1201772‑M1/74‑34 (MQ=255) aGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGAt < 2:1091456/150‑1 (MQ=255) gTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGAATCTGCTCTGGCCATTCGAtg > 2:821861/1‑150 (MQ=255) cATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGACACAGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGc < 1:665611/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCAtt > 1:326571/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCGGGTGCTGCTGTGGCCATTCGATGTGCCAtt > 2:968728/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCATTCAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTg < 1:821861/150‑1 (MQ=255) tGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGa > 2:1188322/1‑139 (MQ=255) tGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGa < 1:1188322/139‑1 (MQ=255) cTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGtgat < 2:583313/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCa < 1:354032/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCTGGGGTCCAACCATGAGATTGAGGCAATGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTCGCCATTCGATGCGCCATTGGTGATTATATGTGCCATg < 2:1168045/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTAGACGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTc < 1:989660/150‑1 (MQ=255) tGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcactgggg < 2:649518‑M2/83‑46 (MQ=255) tGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcactgggg > 1:649518‑M2/1‑38 (MQ=255) gCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGt < 2:805444/150‑1 (MQ=255) | TCGGGGATGGTGTGACGCCAAGCCTGGATTGTGAGCGGCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTGGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGT > NC_002947/1334908‑1335203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |