New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1335055 | 47 (1.040) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 9.0% | coding (224/990 nt) | PP_1160 | asparaginase family protein |
? | NC_002947 | = 1335089 | 35 (0.790) | coding (258/990 nt) | PP_1160 | asparaginase family protein |
GCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCGGGCAATGATGGGCCGGCCAACTTGTT > NC_002947/1334945‑1335235 | gCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCtt < 1:388639/150‑1 (MQ=255) cAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑g < 1:170073/150‑1 (MQ=255) cAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑g < 2:1057924/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTTAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGa < 1:208381/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATAGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGc < 1:75229/150‑1 (MQ=255) gTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCaa > 1:583313/1‑150 (MQ=255) ccACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAggg > 1:525702/1‑150 (MQ=255) cgAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGGGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCt > 2:1114011/1‑150 (MQ=255) gAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCtt > 2:602673/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTg < 2:525702/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa < 2:222555/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑g < 2:921567/118‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑g > 1:921567/1‑118 (MQ=255) ttGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGcc < 1:658526/150‑1 (MQ=255) ttCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGa > 2:721075/1‑150 (MQ=255) aTTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGcc > 1:809610/1‑107 (MQ=255) aTTGTCCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGcc < 2:809610/107‑1 (MQ=255) tgCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGctc > 2:354032/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGctct < 1:721075/150‑1 (MQ=255) tGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCGATGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGc > 1:1168045/1‑150 (MQ=255) gCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGcc > 1:1091456/1‑150 (MQ=255) cccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa < 1:349239/114‑1 (MQ=255) cccAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTgaa > 2:349239/1‑114 (MQ=255) aGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGAt < 2:1091456/150‑1 (MQ=255) gTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGAATCTGCTCTGGCCATTCGAtg > 2:821861/1‑150 (MQ=255) cATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGACACAGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGc < 1:665611/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCAtt > 1:326571/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCGGGTGCTGCTGTGGCCATTCGATGTGCCAtt > 2:968728/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCATTCAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTg < 1:821861/150‑1 (MQ=255) tGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGa > 2:1188322/1‑139 (MQ=255) tGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGa < 1:1188322/139‑1 (MQ=255) cTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGtgat < 2:583313/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCa < 1:354032/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCTGGGGTCCAACCAT‑GAGATTGAGGCAATGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTCGCCATTCGATGCGCCATTGGTGATTATATGTGCCATg < 2:1168045/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTAGACGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTc < 1:989660/150‑1 (MQ=255) tGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcactgggg > 1:649518‑M2/1‑38 (MQ=255) tGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcactgggg < 2:649518‑M2/83‑46 (MQ=255) gCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGt < 2:805444/150‑1 (MQ=255) tGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcact < 2:1201772‑M2/74‑42 (MQ=255) tGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGgccagcacctccagcaacgtcgcgaagcccagcgatgcact > 1:1201772‑M2/1‑33 (MQ=255) gCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTTAGGCATT‑AGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCg < 1:968728/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCggg > 2:430970/1‑150 (MQ=255) gTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGCGCCAATGTACCTACAGCCTTGAAGAACCCCACTGCCCGCAACAGCGGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCGGGCAATGATggg < 1:1114011/150‑1 (MQ=255) gcgGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCGGGCAATGATGGGCCGGCCa > 2:226902/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCGGGCAATGATGGGCCGGCCAACttgtt < 1:430970/150‑1 (MQ=255) | GCAACTGCTTCAGGTTCCACAATTGCGCGAAATGGCGCAGTTGAACGTTGCTTCATTGTGCCTGCTCCCCAGTGCATCGCTGGGCTTCGCGACGTTGCTGGAGGTGCTGGCATGGGCCCGGGGCGAGGTGGAGCGCGGGGCTCAGGCCTT‑GGTATTGAGCCAAGGGACCGACAGCCTTGAAGAAACGGCCTATTTCCTGGATCTGCTCTGGCCATTCGATGTGCCATTGGTGATGACCGGTGCCATGCGCTCGGCGAGTCAGCCGGGCAATGATGGGCCGGCCAACTTGTT > NC_002947/1334945‑1335235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |