New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1398016 | 33 (0.730) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 8.3% | coding (958/1119 nt) | tolA | colicin S4/filamentous phage transport protein |
? | NC_002947 | = 1398047 | 35 (0.810) | coding (989/1119 nt) | tolA | colicin S4/filamentous phage transport protein |
CAGGGTGACCAGGTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAGATGACATTTACAC > NC_002947/1397872‑1398157 | cAGGGTGCCCCGGTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTg > 2:45756/1‑150 (MQ=255) ggTGACCAGGTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGcc < 1:828201/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTcc > 1:474857/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAgt < 2:579289/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGATCAATTGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAgtg < 1:274524/150‑1 (MQ=255) cTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGccc < 2:250591/150‑1 (MQ=255) ttCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCg > 1:960538/1‑150 (MQ=255) cgacgaCCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTa < 1:231569/150‑1 (MQ=255) cTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAgtggtg < 2:770139/133‑1 (MQ=255) cTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAgtggtg > 1:770139/1‑133 (MQ=255) cTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGt < 1:45756/150‑1 (MQ=255) gATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAtacgggccgtcaccactggaccgggccacgctgacattgg < 2:36109‑M1/150‑41 (MQ=255) ccGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTcggc < 2:1000333/150‑1 (MQ=255) gCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGACTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTAACATCACCAATGTAAGCGTGTCCCGGTCCAGTGAGTACGGCCCGTATAACAGTTcggcgg > 2:165764/1‑150 (MQ=255) gcgGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCg < 2:474857/150‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTgaag > 2:44241/1‑150 (MQ=255) tGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACAtt < 1:291346/150‑1 (MQ=255) gTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCAAGTGGTGACCGAAACTATGACATTACGGTGGTGGCAGTGTTGAAGAACATTGGTCGtt > 2:435547/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGt > 1:65870/1‑146 (MQ=255) cGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGt < 2:65870/146‑1 (MQ=255) cGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCCAAGGACATTTGGGCGGTGGCTGCGGTCAAGAACATTGGTCGTTTGa > 2:157968/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGAc < 1:157968/150‑1 (MQ=255) gcAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAtacgggccgtcaccactggaccgggccacgctgacattggtgatgg > 2:39111‑M1/1‑63 (MQ=255) gcAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAtacgggccgtcaccactggaccgggccacgctgacattggtgatgg < 1:39111‑M1/109‑47 (MQ=255) aTGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAg < 2:960538/150‑1 (MQ=255) gtggtCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGc < 2:119441/150‑1 (MQ=255) tggtCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCA < 1:1046028‑M1/48‑1 (MQ=255) tggtCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCA > 2:1046028‑M1/1‑48 (MQ=255) tGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCa > 2:1021774/1‑150 (MQ=255) aTCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAgg > 1:5848/1‑124 (MQ=255) aTCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAgg < 2:5848/124‑1 (MQ=255) aCATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAAc > 2:34143/1‑143 (MQ=255) aCATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAAc < 1:34143/143‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATAtcgtt < 1:435547/150‑1 (MQ=255) gCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATcgttcgtt > 2:1098956/1‑150 (MQ=255) gACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAg > 2:682438/1‑150 (MQ=255) cGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAGAt < 1:1098956/150‑1 (MQ=255) ccATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTAtgacattggtgatggtaccgtccggcaacatgttgatctgcaggaccaccgtcatgcccttgc > 2:39111‑M2/1‑46 (MQ=255) ccATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTAtgacattggtgatggtaccgtccggcaacatgttgatctgcaggaccaccgtcatgcccttgc < 1:39111‑M2/109‑64 (MQ=255) aTCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAGATGACAttt > 2:22508/1‑150 (MQ=255) cACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAGATGACATTTac < 2:297861/150‑1 (MQ=255) ccAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTAtgacattggtgatggtaccgtccggcaacatgttgatctgcaggaccaccgtcatgcccttgcgcgcggaaggcggacgtgcccagccctcggccgcgcgcatgcggatc < 2:36109‑M2/150‑111 (MQ=255) | CAGGGTGACCAGGTGGCCGGCGACTTCGACGACCTGATCCGCATGCGCGCGGCCGAGGGCTGGGCACGTCCGCCTTCCGCGCGCAAGGGCATGACGGTGGTCCTGCAGATCAACATGTTGCCGGACGGTACCATCACCAATGTCAGCGTGGCCCGGTCCAGTGGTGACGGCCCGTATGACAGTTCGGCGGTGGCTGCGGTGAAGAACATTGGTCGTTTGACCGAGATGCAGGGTATGAAGCCGAGCGATTTCAACCAATATCGTTCGTTCAAGATGACATTTACAC > NC_002947/1397872‑1398157 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |