New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1436018 = | 45 (1.000) | 6 (0.140) | 5/236 | NT | 11.0% | intergenic (‑48/+105) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 1436109 = | 54 (1.260) | intergenic (‑139/+14) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
TCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCG > NC_002947/1435873‑1436167 | tCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTg < 2:983015/150‑1 (MQ=255) cAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGAGGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTCGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACCACCCCTgca > 2:492331/1‑148 (MQ=255) tGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCgg > 1:489034/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTc < 2:15186/150‑1 (MQ=255) ggtggtTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCa < 2:346763/150‑1 (MQ=255) gtggtTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa < 2:1063997/137‑1 (MQ=255) gtggtTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa > 1:1063997/1‑137 (MQ=255) gtTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcg > 2:1067478/1‑150 (MQ=255) ttGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGc < 1:1188245/138‑1 (MQ=255) ttGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGc > 2:1188245/1‑138 (MQ=255) ggTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:628231/150‑1 (MQ=255) tCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 2:1039924/1‑150 (MQ=255) ggCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGc < 1:503320/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGt < 1:1049779/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATg < 2:687327/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCgg < 2:489034/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCgg < 1:1067478/150‑1 (MQ=255) cGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTACCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGt > 2:440151/1‑150 (MQ=255) ggTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTc > 2:177357/1‑150 (MQ=255) ggTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTc > 2:1026694/1‑150 (MQ=255) ggTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCGGTGAGGGGCATGGAGCCTCCTTGGAACTCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTc < 2:307520/150‑1 (MQ=255) tctGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTcgc < 1:1028439/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGACATCTAATTCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGc > 1:822133/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCt < 1:1038163/137‑1 (MQ=255) cGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCt > 2:1038163/1‑137 (MQ=255) cGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCAc > 1:802851/1‑150 (MQ=255) gATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACg > 2:129707/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGc > 2:437158/1‑150 (MQ=255) gcagGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGc > 2:123689/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTccc > 2:672420/1‑150 (MQ=255) ttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 2:806198‑M1/63‑150 (MQ=255) cagcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccacggctctCCCTGTGGGAGCGGGCGTAGGCGCGAACACCGGCGAAGCCCGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:171030‑M1/61‑150 (MQ=255) cTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 1:1026694/150‑1 (MQ=255) gCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTc > 2:953176/1‑109 (MQ=255) gCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTc < 1:953176/109‑1 (MQ=255) gCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGt < 1:263292/150‑1 (MQ=255) aTGTAGCATCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTgg < 2:822133/150‑1 (MQ=255) tGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGgc < 1:177357/150‑1 (MQ=255) tcctTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAg > 2:566226/1‑150 (MQ=255) gAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTgg < 1:798862/136‑1 (MQ=255) gAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTgg > 2:798862/1‑136 (MQ=255) tCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGtttt < 1:437158/150‑1 (MQ=255) caaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGc < 2:282799‑M1/77‑1 (MQ=255) caaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGc > 1:282799‑M1/30‑106 (MQ=255) aaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:901317‑M1/29‑118 (MQ=255) aaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 1:901317‑M1/90‑1 (MQ=255) aTGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTc < 1:129707/150‑1 (MQ=255) gCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCgg > 1:848919/1‑150 (MQ=255) aGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:338022/113‑1 (MQ=255) aGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGcc < 2:761588/150‑1 (MQ=255) aGATGCATGGGGGGGATTACGACCCATGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 1:338022/1‑113 (MQ=255) aTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAg > 1:931567/1‑150 (MQ=255) gggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTgg > 2:1100856/1‑150 (MQ=255) cGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGc > 1:392778/1‑150 (MQ=255) cGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGc > 2:838145/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTg > 1:160610/1‑150 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc < 2:392778/150‑1 (MQ=255) CCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATg > 2:509520‑M1/1‑115 (MQ=255) CCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATg < 1:509520‑M1/115‑1 (MQ=255) CCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCg > 1:838145‑M1/1‑150 (MQ=255) | TCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCG > NC_002947/1435873‑1436167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |