New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1460806 = | 58 (1.290) | 6 (0.140) | 6/238 | NT | 9.0% | coding (666/1167 nt) | algJ | alginate O‑acetylase AlgJ |
? | NC_002947 | 1460877 = | 66 (1.520) | coding (595/1167 nt) | algJ | alginate O‑acetylase AlgJ |
ACCCTCGGCATCGACCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATCAGGTCCG > NC_002947/1460659‑1460954 | ctgccagcctgcatgacgacctgtacaaccagttccatgcccaggcacgccaggccaacgtgttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTgg > 2:207616‑M1/148‑150 (MQ=255) cccTCGGCATCGACCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTggg > 1:446642/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCATCGACCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGCAGAAGACgggtgggt > 2:336506/1‑150 (MQ=255) aTCGACCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGtt > 2:1057029/1‑150 (MQ=255) gcccggccggGTGGTGCGATTCTGCAGGTTGTCCGGAGCCGGCAGCGGGTTGCTGGACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGGTGGACAGGACGCCCGTGTAGGGGGCGGTATTGCTGGCTTCGGGGATGATCGCTTGTGGGTCGCCGTTGAg > 2:777678/3‑150 (MQ=255) aCCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGc < 1:361322/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTg < 2:932520/150‑1 (MQ=255) gtggtgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTgg < 1:336506/150‑1 (MQ=255) ggtgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcg < 1:1108572/150‑1 (MQ=255) gtgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcgg > 2:659702/1‑150 (MQ=255) gtgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcgg > 1:43693/1‑150 (MQ=255) tgCGTTTCTGTAGTTGGTCCGCGGCCTGGAGCAGGTTGCTGAGCAATGGTTGCAGTGGCAGGAAGTTTGTCAGGTCGCCCTTTTAGGGGGCTGTTTTGCCGGCTTCGGTGATGACGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcgtc < 2:52983/150‑3 (MQ=255) tgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcggc > 1:446380/1‑150 (MQ=255) tgCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTggcggc > 2:1187541/1‑150 (MQ=255) gCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCt < 1:1057029/150‑1 (MQ=255) ttCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGAcc < 2:245952/150‑1 (MQ=255) gTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGc > 1:1090120/1‑150 (MQ=255) caggcacgccaggccaacgtgttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCa < 2:268210‑M1/44‑1 (MQ=255) ggccGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGACGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAg < 2:47185/148‑1 (MQ=255) tCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAgc < 2:117884/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCtt < 2:285616/139‑1 (MQ=255) ggggCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCtt > 1:285616/1‑139 (MQ=255) ggCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGcgcc < 2:326064/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAGGGTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGcgcc < 2:796028/150‑1 (MQ=255) ccaacgtgttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctat < 1:183436‑M1/1‑1 (MQ=255) ccaacgtgttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctat > 2:183436‑M1/94‑94 (MQ=255) cagcagGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGcgccgc < 1:177120/150‑1 (MQ=255) agcagGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCgccgcc > 1:92970/1‑150 (MQ=255) ttGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCg < 2:92970/150‑1 (MQ=255) gttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGT‑GCCGAAGTGGCGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCg > 1:439268‑M1/87‑149 (MQ=255) gttcgcaccggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGT‑GCCGAAGTGGCGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCg < 2:439268‑M1/63‑1 (MQ=255) tGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCAc < 2:1167011/150‑1 (MQ=255) tGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCAc > 2:488560/1‑150 (MQ=255) gAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTg > 2:581091/1‑105 (MQ=255) gAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTg < 1:581091/105‑1 (MQ=255) accggacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCAccc < 2:250376‑M1/70‑1 (MQ=255) gacctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAg > 1:250376‑M1/77‑150 (MQ=255) aGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAg < 1:1118532/150‑1 (MQ=255) aGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAg < 1:683401/150‑1 (MQ=255) acctgatggcaccgatggagcaggccaaggcccgcggccaggtattcctgcgtaccgatacccactggacgcctaTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAgg > 1:268210‑M1/76‑150 (MQ=255) tCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTc < 2:446642/150‑1 (MQ=255) aGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAg < 2:43693/150‑1 (MQ=255) ggAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTAt > 2:855862/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAgg > 1:6264/1‑150 (MQ=255) ccTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCt > 2:1186436/1‑150 (MQ=255) ccTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCt > 1:384233/1‑150 (MQ=255) gggggCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCcgcg > 1:844967/1‑150 (MQ=255) ggggCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCgg < 1:1093548/150‑1 (MQ=255) ggggCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCgg < 2:6264/150‑1 (MQ=255) ggggCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATAGGTACGCAGCAATACATGGCCGCgg > 2:670214/1‑150 (MQ=255) gtgtTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTg < 2:446380/150‑1 (MQ=255) tgtTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTgg > 1:117906/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGcc > 2:720882/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCt < 2:384233/150‑1 (MQ=255) gCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTg > 2:479301/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGATTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGc > 2:353126/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTgg < 1:825318/103‑1 (MQ=255) ttCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTgg > 2:825318/1‑103 (MQ=255) ggTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCgg < 1:712418/130‑1 (MQ=255) ggTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCgg > 2:712418/1‑130 (MQ=255) gTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGt > 1:754542/1‑97 (MQ=255) gTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGt < 2:754542/97‑1 (MQ=255) gTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGt < 2:40064/150‑1 (MQ=255) gaAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCAGTGCCAt > 1:517200/1‑150 (MQ=255) aaGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTAc > 2:598037/1‑103 (MQ=255) aaGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTAc < 1:598037/103‑1 (MQ=255) aaGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATc > 2:991640/1‑150 (MQ=255) ggCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATCAg < 2:844967/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATCAg < 1:488560/150‑1 (MQ=255) ttGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATCAGGTc > 2:29143/1‑150 (MQ=255) gtgGTTCGCCGTTGAGCCGGCTCTGGCGGCTGACCGTTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCAGAGGCTTCCAGTTGGTATCGGTACGCAGGAAGACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGGGCGATCAGGTCCg < 2:43701/150‑1 (MQ=255) | ACCCTCGGCATCGACCGGCCGGGTGGTGCGTTTCTGCAGGTTGTCCGGGGCCGGCAGCAGGTTGCTGAACAAGGGGTCCAGTGGCAGGAAGTTGGTCAGGTCGCCCTTGTAGGGGGCGGTGTTGCCGGCTTCGGTGATGAAGGCTTGTGGGTCGCCGTTGAGCAGGCTCTGGCGGCTGACCGCTTCGGCCAGCGCCTGCGCCGCCACTTCGGCACCCATAGGCGTCCAGTGGGTATCGGTACGCAGGAATACCTGGCCGCGGGCCTTGGCCTGCTCCATCGGTGCCATCAGGTCCG > NC_002947/1460659‑1460954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |