New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1558189 = | 38 (0.840) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 9.4% | coding (26/993 nt) | PP_1368 | glycosyltransferase domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 1558211 = | 41 (0.950) | coding (4/993 nt) coding (732/732 nt) |
PP_1368 PP_1369 |
glycosyltransferase domain‑containing protein hypothetical protein |
ACAGGCGCAGGCGCAGCGCATTGATGACCCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATGTCTACAGG > NC_002947/1558040‑1558333 | cgagcacgttgcgcttgggactgcaccctgtagacatgcgccatcgctcatcccgtgactattggttgcgcacgctggagagactgttgaaggatggccgcgaaccgctgaccaagtctgcctggctggagcgccagggggcagcatgaa > 1:927872‑M1/150‑150 (MQ=255) aggcgcaggcgcAGCGCATTGATGACCCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGTAGTAGCCCGCTACCGCCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATgccagc < 1:1053847/150‑1 (MQ=255) gcgcagcgcaTTGATGACGCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGAAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCgccagcca > 2:72861/1‑150 (MQ=255) gcgcagcgcaTTGATGACCCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCgccagcca < 1:499940/150‑1 (MQ=255) cgcaTTGATGACCCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCa < 2:1016357/150‑1 (MQ=255) cccAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtgc > 1:969174/1‑150 (MQ=255) ccAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtgct > 1:873069/1‑150 (MQ=255) acaacaGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGcccc < 1:1138093/150‑1 (MQ=255) caacgGAATCATGCATAGTGGCATGCGCAGCCCGTCGCAGTCGACTAGGGGCAGCCTCTGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGccccc < 2:11449/150‑1 (MQ=255) aacaGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCCCCAGCTGGTCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCt > 1:991174/1‑150 (MQ=255) cTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCACTccag‑cca < 2:834033/150‑1 (MQ=255) tagCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCa < 2:969174/150‑1 (MQ=255) aTGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAGACCAGGcctgg > 2:1143109/1‑146 (MQ=255) tGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATgccagc < 2:952741/95‑1 (MQ=255) tGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATgccagc > 1:952741/1‑95 (MQ=255) gAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTg < 1:1136032/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTg < 1:72861/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTg < 2:873069/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTg < 2:425230/150‑1 (MQ=255) tCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGc < 1:1016171/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CAAGGCAGACTTGTTCAGCGGTTCGCGGCCAt > 1:20756/1‑150 (MQ=255) gagactgttgaaggatggccgcgaaccgctgaccaagtctgcctggctggagcgccagggggcagcatgaAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtg < 2:405088‑M1/27‑1 (MQ=255) gagactgttgaaggatggccgcgaaccgctgaccaagtctgcctggctggagcgccagggggcagcatgaAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtg > 1:405088‑M1/71‑97 (MQ=255) ggCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCtt < 1:1164429/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCa < 2:1152830/82‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCa > 1:1152830/1‑82 (MQ=255) tCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCAAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCaa < 1:75581/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAAc > 2:608195/1‑150 (MQ=255) tCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTc > 2:1011786/1‑129 (MQ=255) tCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTc < 1:1011786/129‑1 (MQ=255) ggatggccgcgaaccgctgaccaagtctgcctggctggagcgccagggggcagcatgaAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtgc > 2:1011082‑M1/59‑86 (MQ=255) ggatggccgcgaaccgctgaccaagtctgcctggctggagcgccagggggcagcatgaAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCAtgc < 1:1011082‑M1/28‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGCTCGCTGCCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGtctc > 1:777404/1‑150 (MQ=255) cTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCa < 1:405678/112‑1 (MQ=255) cTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCa > 2:405678/1‑112 (MQ=255) accgccCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAAc < 1:68762/150‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGtctctc < 1:151389/132‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGtctctc > 2:151389/1‑132 (MQ=255) ccAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATa > 1:903190/1‑150 (MQ=255) cAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAg > 2:487473/1‑150 (MQ=255) tgcagcGCTGGGGCCAGCGTTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGt > 2:1142167/6‑150 (MQ=255) aCGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCAcc < 2:903190/150‑2 (MQ=255) aCCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGc > 2:45564/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATg > 1:1162646/1‑150 (MQ=255) cccAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCACCTGGCGCTCCAC‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATGt > 2:503870/1‑150 (MQ=255) cAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATGTCt > 2:1083478/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATGTCTACAgg < 1:45564/150‑1 (MQ=255) cagcgccagcCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAg < 2:658997/89‑1 (MQ=255) cagcgccagcCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAg > 1:658997/1‑89 (MQ=255) | ACAGGCGCAGGCGCAGCGCATTGATGACCCAGCACAACAGAATCATGCCTAGTAGCATGAGCAGCAGGTGCGGGTCGAACCGGCTCAGCCTCGGCAGCAGCTCGCTACCACCCAGCAACGCTGGCACCAGCGCTGCACCCAGCAATGCCAGCGCCAGCCAGGCCCAGCGCTTCATGCTGCCCCCTGGCGCTCCAG‑CCAGGCAGACTTGGTCAGCGGTTCGCGGCCATCCTTCAACAGTCTCTCCAGCGTGCGCAACCAATAGTCACGGGATGAGCGATGGCGCATGTCTACAGG > NC_002947/1558040‑1558333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |