New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2855879 = | 37 (0.820) | 3 (0.070) | 3/240 | NT | 6.7% | noncoding (79/87 nt) | PP_mr36 | C4 ncRNA |
? | NC_002947 | 2855956 = | 48 (1.100) | noncoding (2/87 nt) | PP_mr36 | C4 ncRNA |
AAGCGCGTAATCCGTGGCCTGGATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGCGACAGGCCGAG > NC_002947/2855740‑2856028 | aaGCGCGTAATCCGTGGCCTGGATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTa > 2:810404/1‑150 (MQ=255) cgTAATCCGTGGCCTGGATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCgg < 2:915367/150‑1 (MQ=255) tCCGTGGCCTGGATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGCGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGa > 2:38809/1‑150 (MQ=255) ggATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCgaga < 1:1005817/150‑1 (MQ=255) tgattttcgttgcacatggaaatagtcagccctagtctcggcctgtcgctgccaattcagcgaccggttttgacagaccgctgacgttgtcctcatgtgctcgcttacaTGGc > 2:1166432‑M1/110‑113 (MQ=255) tgattttcgttgcacatggaaatagtcagccctagtctcggcctgtcgctgccaattcagcgaccggttttgacagaccgctgacgttgtcctcatgtgctcgcttacaTGGc < 1:1166432‑M1/4‑1 (MQ=255) aaGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGgcgc > 2:306181/1‑150 (MQ=255) aGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCga < 2:263694/131‑1 (MQ=255) aGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCga > 1:263694/1‑131 (MQ=255) agagGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTgg > 1:657176/1‑135 (MQ=255) agagGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTgg < 2:657176/135‑1 (MQ=255) aCCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTGGGCACTCGGCGCACCACAGGGTg < 1:163892/150‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTgg < 1:613001/127‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTgg > 2:613001/1‑127 (MQ=255) gtgggtCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGt > 2:608683/1‑150 (MQ=255) ggtCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGcc < 2:820135/140‑1 (MQ=255) ggtCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGcc > 1:820135/1‑140 (MQ=255) ctcggcctgtcgctgccaattcagcgaccggttttgacagaccgctgacgttgtcctcatgtgctcgctttcaTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCa > 1:914884‑M1/74‑150 (MQ=255) gCGTACCTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGa < 1:349517/143‑1 (MQ=255) gCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGCGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGa > 2:349517/1‑143 (MQ=255) cGTAACCCAAACCTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCACGCATGGGTTTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGa < 1:676986/150‑1 (MQ=255) gTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAg > 1:1041321/1‑150 (MQ=255) tCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACaa > 1:255104/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGa < 2:722/145‑1 (MQ=255) cAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGACGCCAGGAAAGCGAGCACATGAGGa > 1:722/1‑145 (MQ=255) accggttttgacagaccgctgacgttgtcctcatgtgctcgctttcaTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGc > 2:992484‑M1/48‑131 (MQ=255) accggttttgacagaccgctgacgttgtcctcatgtgctcgctttcaTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGc < 1:992484‑M1/84‑1 (MQ=255) gTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAg < 1:38809/150‑1 (MQ=255) ggAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCgg < 2:1025449/150‑1 (MQ=255) cTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGaaa < 1:953027/108‑1 (MQ=255) cTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGaaa > 2:953027/1‑108 (MQ=255) aCCTTGCTGTCAAACAAGATGATGAAAACTGGACGCAAGCTGATAGAGCGAGAGGTGGGCACCCTGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCt > 2:740834/1‑150 (MQ=255) tCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTgg < 2:713618/148‑1 (MQ=255) tCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTgg > 1:713618/1‑148 (MQ=255) tCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCa < 1:608683/150‑1 (MQ=255) aaaCAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGc > 1:868899/1‑150 (MQ=255) aaCAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAGCACCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGCg > 1:968361/1‑150 (MQ=255) aaCAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGCg > 2:1112153/1‑150 (MQ=255) cAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGc > 1:1139730/1‑115 (MQ=255) cAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGc < 2:1139730/115‑1 (MQ=255) aGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCaaaa > 1:358879/1‑125 (MQ=255) aGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCaaaa < 2:358879/125‑1 (MQ=255) TGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGCGACAGGCCgag < 1:827533‑M1/150‑1 (MQ=255) | AAGCGCGTAATCCGTGGCCTGGATCAGGGTGTCTTCAAGGCAGAGGGACCGGTGGGGTGGGTCTGGAACGATCTTGAGCATGGCGTAACTCCAACGTCGGAAAGTGGAGCTACCTCAACCTTGCTGTCAAACAAGATGGTGGCAGCTGTACGCGGGTTGACAGACCGAGACGTTGGCACTCGGCGCACCACAGGGTGCCCACACGTACAGCCGCCATGAAAGCGAGCACATGAGGACAACGTCAGCGGTCTGTCAAAACCGGTCGCTGAATTGGCAGCGACAGGCCGAG > NC_002947/2855740‑2856028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |