New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4172981 | 48 (1.060) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 5.8% | coding (571/825 nt) | PP_3671 | aldo/keto reductase family oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 4173006 | 50 (1.140) | coding (596/825 nt) | PP_3671 | aldo/keto reductase family oxidoreductase |
GGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGCTGGCCAACCTGGCC > NC_002947/4172832‑4173130 | ggTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCC > 1:759153‑M1/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAg > 2:705877/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAg < 1:279584/150‑1 (MQ=255) tACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAgg < 1:731322/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAgc < 1:201720/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAgcg < 1:58305/150‑1 (MQ=255) ggAAACCCTGGACGCGCCGGTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGt > 2:951630/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAg < 2:307833‑M2/150‑2 (MQ=255) tGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACTCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAgg > 2:350583‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCtggatcaccggctgcgccgctgcctggccgcgt < 1:859850‑M1/150‑34 (MQ=255) gTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCaa < 1:951630/150‑1 (MQ=255) tCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAg > 1:1004660/1‑150 (MQ=255) ggCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCa > 1:682457/1‑150 (MQ=255) ggCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACA‑CCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCAGCAAGCAt > 2:570876/1‑150 (MQ=255) aaTTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATgg < 1:998988/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGc > 2:48721/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGc < 1:307833/150‑1 (MQ=255) cATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAgcgg > 1:720717/1‑97 (MQ=255) cATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAgcgg < 2:720717/97‑1 (MQ=255) gccagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGAGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAAt < 1:705877/150‑1 (MQ=255) cagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATgg > 2:883558/1‑150 (MQ=255) agcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgc < 2:51332/150‑1 (MQ=255) gcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgct > 1:302202/1‑150 (MQ=255) gcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgct < 2:1004660/150‑1 (MQ=255) cTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGGGTCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAg > 1:772/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCAGGCGTCCAGCCAGCCGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGAGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCAGAAATGGCTGCTAGACCAGGACGGCGTggc > 2:233722/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGACGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggc > 2:851983/1‑150 (MQ=255) ccATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCtggatcaccggctgcgccgctgcctggccgc > 1:1001152‑M1/1‑44 (MQ=255) ccATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCtggatcaccggctgcgccgctgcctggccgc < 2:1001152‑M1/75‑32 (MQ=255) ccATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACCCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGAt > 1:936371/1‑150 (MQ=255) cATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATc > 2:1102109/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCa > 2:1073242/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATc > 1:246504/1‑142 (MQ=255) gTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATc < 2:246504/142‑1 (MQ=255) ttGCTCACCGCCTACA‑CCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCCGAGCTGCTTGTGATCCATGCTATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCca < 1:570876/150‑1 (MQ=255) tGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCca < 1:1102109/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGtgct < 2:756908/82‑1 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGtgct > 1:756908/1‑82 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCcagca > 1:724946/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCagcagc > 1:206378/1‑150 (MQ=255) ccGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATgg > 2:1126585/1‑104 (MQ=255) ccGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATgg < 1:1126585/104‑1 (MQ=255) cTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCa > 1:383740/1‑111 (MQ=255) cTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCa < 2:383740/111‑1 (MQ=255) acacCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCccagccag > 2:1048583/1‑83 (MQ=255) acacCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCccagccag < 1:1048583/83‑1 (MQ=255) acacCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcg < 2:533624/122‑1 (MQ=255) acacCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcg > 1:533624/1‑122 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCGCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCAAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCa > 1:79469/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgctgct > 1:753990/1‑99 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgctgct < 2:753990/99‑1 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATccc < 1:1117181/126‑1 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATccc > 2:1117181/1‑126 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCca > 1:618508/1‑134 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCca < 2:618508/134‑1 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCa < 2:682457/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCAAAAGCCAGCAGCCCCTGAAACCAGCTGGCCa > 2:560418/1‑150 (MQ=255) aCGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAggccgcgtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatggtattccacctgaattgccgacaacggcg < 1:859850‑M2/150‑118 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAggccgcgtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatgg > 1:1001152‑M2/1‑31 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAggccgcgtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatgg < 2:1001152‑M2/75‑45 (MQ=255) ggCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGCTGGCCAACCTg < 2:759153/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGCTGGCCAACCTg < 2:377670/150‑1 (MQ=255) cctggatcaccggctgcgccgctgcctggccgagtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatggtattccacctgaattgccgacaacggcgcgccca > 2:350583‑M1/1‑2 (MQ=255) ctggatcaccggctgcgccgctgcctggccgcgtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatggtattccacctgaattgccgacaacggcgcgcccag < 2:307833‑M1/150‑150 (MQ=255) cAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGCTGGCCAACCTGGcc > 2:758407/1‑150 (MQ=255) | GGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGCTGGCCAACCTGGCC > NC_002947/4172832‑4173130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |