New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4336935 = | 60 (1.330) | 3 (0.070) | 3/232 | NT | 5.2% | coding (324/885 nt) | PP_3811 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4337001 = | 53 (1.260) | coding (258/885 nt) | PP_3811 | LysR family transcriptional regulator |
TACGCCGGGCGATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGCCCCAGT > NC_002947/4336787‑4337079 | tACGCCGGGCGATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGc > 2:929313/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCa > 2:546189/1‑150 (MQ=255) cagcttgaggagcgcctgggcgtgcgcctgctcaaccgctccacccggcgcctcgatgccacgccactggggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAg < 2:19864‑M1/6‑1 (MQ=255) gCGATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc < 1:104053/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgcgc < 1:130415/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGGGCATCCAGGGCACCAAGCCGCCACGCCAGGTCATAGCCTTAACCAATCAGGTCCACAGCGGGGTCGCTCAGGTATACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCTCTGGCGCGCCATgg < 2:108126/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTCGAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAAc < 1:957013/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAAc > 1:114331/1‑150 (MQ=255) ctccAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAg > 2:276786/1‑150 (MQ=255) tccAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc < 2:972739/132‑1 (MQ=255) tccAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc > 1:972739/1‑132 (MQ=255) aGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACCTCAAACTGGTGGTGCATCTGAAAAAACTCAATCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAgcggc < 1:929313/150‑1 (MQ=255) aCCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCt > 1:513648/1‑150 (MQ=255) aCCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCt > 2:1152789/1‑150 (MQ=255) ccAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTc > 1:993471/1‑150 (MQ=255) aaTCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc > 2:491313/1‑121 (MQ=255) aaTCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc < 1:491313/121‑1 (MQ=255) aaTCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAg < 1:237785/150‑1 (MQ=255) tCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAAGCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGgc < 1:124020/150‑1 (MQ=255) ccggcgcctcgatgccacgccactggggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAg < 2:153845‑M1/6‑1 (MQ=255) ccggcgcctcgatgccacgccactggggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAg > 1:153845‑M1/101‑106 (MQ=255) ccAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGACAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGc > 2:147562/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAgg < 2:637661/139‑1 (MQ=255) cAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAgg > 1:637661/1‑139 (MQ=255) tCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTTCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCgcgc < 1:131947/150‑1 (MQ=255) tCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc < 1:427452/105‑1 (MQ=255) tCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTgc > 2:427452/1‑105 (MQ=255) cATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCa < 2:513648/150‑1 (MQ=255) tAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAgg > 2:978026/1‑150 (MQ=255) aGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGa > 2:763940/1‑150 (MQ=255) tCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTgg < 2:274815/150‑1 (MQ=255) ccAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGcc > 2:201952/1‑150 (MQ=255) cactggggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTgg > 2:659485‑M1/81‑150 (MQ=255) tggggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGAAGAGCAGGACGTGCGTCTGGCCg < 2:559462‑M1/73‑1 (MQ=255) aGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACCTCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCg < 1:147562/150‑1 (MQ=255) ggTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGc > 1:568435/1‑150 (MQ=255) gggcagcactactaccagtcggccctgcgcctgctgggtgaagtgcagcaggtcgaacacgacatcagcggccagGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCt > 1:559462‑M1/76‑150 (MQ=255) cacaGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGAt > 2:592482/1‑150 (MQ=255) acaGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTgg < 2:844169/135‑1 (MQ=255) acaGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTgg > 1:844169/1‑135 (MQ=255) gTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTgg < 1:1057683/133‑1 (MQ=255) gTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTgg > 2:1057683/1‑133 (MQ=255) gCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGAc < 1:546189/150‑1 (MQ=255) tCATGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGAc < 2:974310/118‑1 (MQ=255) tCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAACCGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACct > 1:142116/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGAc > 1:974310/1‑118 (MQ=255) gTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTggg < 1:1073755/119‑1 (MQ=255) gTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTggg > 2:1073755/1‑119 (MQ=255) gTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTgg > 2:1190320/1‑118 (MQ=255) gTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTgg < 1:1190320/118‑1 (MQ=255) cTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTACAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTc > 1:880389/1‑150 (MQ=255) ccACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCAc > 1:111423/1‑150 (MQ=255) cacaTCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCAcc < 1:276786/150‑1 (MQ=255) gTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGc > 1:724084/1‑150 (MQ=255) gTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGCCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGc < 1:1152789/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGAc > 1:64182/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGAc < 2:142116/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCAATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGAc > 1:511294/1‑150 (MQ=255) tGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTgg > 2:721558/1‑150 (MQ=255) aGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGgtag < 1:201952/150‑1 (MQ=255) aaaCTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGgtagta < 1:978026/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGtgc > 1:1184139/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGtgct > 1:1044339/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAgg > 2:232045/1‑124 (MQ=255) ggTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAgg < 1:232045/124‑1 (MQ=255) tCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGcc > 1:191602/1‑150 (MQ=255) agcagGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGcccc > 2:125163/1‑150 (MQ=255) gcaggcagCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGCCCCa > 1:1088233/1‑150 (MQ=255) aggcagCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGCCCCAgt < 1:386771/150‑1 (MQ=255) | TACGCCGGGCGATCAGGCTGGAGTCCTCCAGTGCACCAATCCGCAGCGCCAGGTCATAGCCTTCACCAATCAGGTCCACAGCGCGGTCGCTCAGGTCTACCTCCACATCAACCTGGGGGTGCAACTGCAGAAACTCGGTCAGCAGGCAGCCCAGGTGCGCCATGGCAAACGACAGCGGCGCGCTCAGGCGCAAGGTGCCGCGCAGGACCTGGGCCTGGCCGCTGATGTCGTGTTCGACCTGCTGCACTTCACCCAGCAGGCGCAGGGCCGACTGGTAGTAGTGCTGCCCCAGT > NC_002947/4336787‑4337079 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |