New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4459082 = | 53 (1.170) | 4 (0.100) | 4/230 | NT | 7.8% | coding (63/1455 nt) | trkH‑I | potassium transporter |
? | NC_002947 | 4459110 = | 46 (1.100) | coding (91/1455 nt) | trkH‑I | potassium transporter |
ATTGCCGGCCACGACTTTACGCCTTTTTTACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGACACACCGCAACTGCGGA > NC_002947/4458933‑4459227 | cttgccgtcgtgagcagatacatgtccctggtccgcagttgcggtgtgtcgggtacgccgcgggccaccatgagcaggccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgcggtcgtacaccagcagc < 2:347791‑M1/1‑1 (MQ=255) aCGACTTTACGCCTTTTTTACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATgg > 1:781515/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGc > 2:1150943/1‑150 (MQ=255) ttttttACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCt < 1:1184015/150‑1 (MQ=255) ttttttACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCt < 1:144018/150‑1 (MQ=255) tCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACgctgc > 2:635540/1‑150 (MQ=255) tCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCAAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACgctgc > 2:612767/1‑150 (MQ=255) gACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGctgctg < 1:635540/150‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTAc > 2:700870/1‑150 (MQ=255) cGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGa > 2:170355/1‑150 (MQ=255) gCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGcgac < 1:1098672/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTc > 1:199091/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CCATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCg < 1:1150943/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCg < 2:781515/150‑1 (MQ=255) ccGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGAc > 1:432227/1‑116 (MQ=255) ccGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGAc < 2:432227/116‑1 (MQ=255) caccatgagcaggccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgctgtcgtacaccagcagc > 1:27068‑M1/85‑85 (MQ=255) caccatgagcaggccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgcggtcgtacaccagcagc < 2:27068‑M1/1‑1 (MQ=255) tGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCg > 2:218636/1‑150 (MQ=255) tGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATCATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCGGCGACCACCTCGGTGCAttgg > 2:510833/1‑148 (MQ=255) ccAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCTTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGCTAGCCGTCAGCATGGTGCTTCGTGCTCCTG‑GACTTCTCCCTGACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTg < 1:510833/150‑1 (MQ=255) cccTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTg > 1:260243/1‑150 (MQ=255) ccTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGa > 1:1040018/1‑150 (MQ=255) cGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgt < 1:170355/150‑1 (MQ=255) tCCTGCATTGTGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTAAGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTgtgtgt < 2:61184/150‑1 (MQ=255) ccTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtg > 2:121181/1‑146 (MQ=255) ccTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtg < 1:121181/146‑1 (MQ=255) ccTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTc > 1:347791/1‑150 (MQ=255) gCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGc < 2:656664/150‑1 (MQ=255) ccTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGccc < 1:612767/150‑1 (MQ=255) ccTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCACTGGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGccc > 1:378998/1‑150 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtgt < 1:552038/126‑1 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtgt > 2:552038/1‑126 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtgt > 2:552532/1‑126 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCtgtgt < 1:552532/126‑1 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCg < 1:96000/130‑1 (MQ=255) ttCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGGTCTGTGTGTCg > 2:96000/1‑130 (MQ=255) attGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGCCCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGCTAGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCTCGCGTCGTa < 2:199091/150‑1 (MQ=255) ttGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTAc < 2:142098/150‑1 (MQ=255) gtcgctgcggtcgtacaccagcagCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGAc < 2:1073605‑M1/27‑1 (MQ=255) gtcgctgcggtcgtacaccagcagCGTCAGCACGGTGATTC‑CAATGCTGAc > 1:1073605‑M1/25‑51 (MQ=255) gtgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCAtg > 2:1159913/1‑131 (MQ=255) gtgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCAtg < 1:1159913/131‑1 (MQ=255) tgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCgcgg < 2:49987/141‑1 (MQ=255) tgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCgcgg > 1:49987/1‑141 (MQ=255) tgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGa < 2:372379/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGacaca < 2:390183/150‑1 (MQ=255) tCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATGGTTCTGTCATTACCTCTGCGCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGacacac > 1:682233/1‑150 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATc > 2:217701/1‑99 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATc < 1:217701/99‑1 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTAcc > 1:816964/1‑140 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTAcc < 2:816964/140‑1 (MQ=255) cgtacaccagcagCGTCAGCATTG‑GAATCACCATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGt < 1:278883‑M1/123‑1 (MQ=255) cgtacaccagcagCGTCAGCATTG‑GAATCACCATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGt > 2:278883‑M1/14‑136 (MQ=255) gATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGACACACCGCa > 1:99842/1‑150 (MQ=255) aCGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGACACACCGCAACTg > 2:630386/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTc > 1:870787/1‑73 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTc < 2:870787/73‑1 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGt > 1:469214/1‑80 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGt < 2:469214/80‑1 (MQ=255) tGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGACACACCGCAACTGCGGa < 2:515348/150‑1 (MQ=255) | ATTGCCGGCCACGACTTTACGCCTTTTTTACTCGACATTACCGTAAAGCAGGCAATACTGCCGGCACTGTCCCAACGAGCTCCCTCAATGCCGCTTCCTGCATTGCGTTTCATCGCCTTCATTATTGGTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTC‑CAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCGACACACCGCAACTGCGGA > NC_002947/4458933‑4459227 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |