| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4466688 | 55 (1.220) | 8 (0.180) | 8/246 | NT | 13.1% | coding (387/1362 nt) | nhaA‑II | Na(+)/H(+) antiporter NhaA |
| ? | NC_002947 | = 4466713 | 52 (1.160) | coding (412/1362 nt) | nhaA‑II | Na(+)/H(+) antiporter NhaA | |||||
GGCCTGATGACCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCAATCATCGATG > NC_002947/4466542‑4466833 | ggCCTGATGACCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGtttt < 1:554678/150‑1 (MQ=255)ggCCTGATGACCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGtttt < 1:649918/150‑1 (MQ=255) ccTGATGACCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTgg < 1:1207308/150‑1 (MQ=255) atgaCCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCAc > 2:625552/1‑150 (MQ=255) cgtCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGcc > 2:1143647/3‑150 (MQ=255) cATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGcc > 2:514393/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCAcgc > 2:726999/1‑146 (MQ=255) aTCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCGGACTTTTGGTCACGCGCca > 2:579729/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCATCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCAcgc < 1:726999/146‑1 (MQ=255) tCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCACCGCAGCTCCAGTCTCCAGCCTGCGTCAAGCCACTCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCcag > 1:22643/1‑150 (MQ=255) tttttCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCcagca > 2:255152/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCCCGCGCcagaagcagaa > 2:733829/1‑145 (MQ=255) tGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTg < 2:477914/129‑1 (MQ=255) tGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTg > 1:477914/1‑129 (MQ=255) tGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACcaac > 2:837026/1‑150 (MQ=255) tGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCAGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACcaac < 1:514393/150‑1 (MQ=255) tGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTg < 2:313322/123‑1 (MQ=255) tGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTg > 1:313322/1‑123 (MQ=255) ggAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGt > 2:127067/1‑150 (MQ=255) cgAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGAc < 2:556373/150‑1 (MQ=255) gagaTCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACg < 2:22643/150‑1 (MQ=255) agaTCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACgg > 2:929847/1‑150 (MQ=255) gaTCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGa > 2:1190784/1‑150 (MQ=255) cACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATc > 2:547169/1‑150 (MQ=255) cACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATc < 1:255152/150‑1 (MQ=255) gTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCGTCCCATGGCAGCCGCTGTAGGCGGCGTACCGGTGTTTCATTTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTg < 1:625552/150‑1 (MQ=255) gCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTtttggtctgctggcgcgtgaccaaaactca < 1:123104‑M1/114‑31 (MQ=255) gCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTtttggtctgctggcgcgtgaccaaaactca > 2:123104‑M1/1‑84 (MQ=255) gCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCg < 2:449489/150‑1 (MQ=255) cACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCgg > 2:395991/1‑150 (MQ=255) cACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCgg > 2:293650/1‑150 (MQ=255) cTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTg < 2:1131209/150‑1 (MQ=255) tggccAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTgg > 1:1207188/4‑150 (MQ=255) gTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTggg < 1:579729/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGc < 1:395991/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGt > 2:245391/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTa < 1:245391/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTg < 2:338831/150‑1 (MQ=255) gCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGc < 1:547169/150‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGcc < 1:733829/150‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGcc < 2:269866/150‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGcc < 1:929847/150‑1 (MQ=255) aGCCACGCTTCCCATGTCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTgttggtctgctggcgcgtgaccaaaa < 2:585928‑M1/90‑27 (MQ=255) aGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTgttggtctgctggcgcgtgaccaaaa > 1:585928‑M1/1‑64 (MQ=255) gCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTgttggtctgctggcgcgtgaccaaaactcaggtag > 2:1082087‑M1/1‑63 (MQ=255) gCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTgttggtctgctggcgcgtgaccaaaactcaggtag < 1:1082087‑M1/98‑36 (MQ=255) gCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTc < 1:64031/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCCGCTc < 1:972080/150‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCg > 2:821247/1‑150 (MQ=255) ccACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCg < 1:127067/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATGTCGCCTTTGCGGTgg > 2:644277/1‑130 (MQ=255) aCGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTgg < 1:644277/130‑1 (MQ=255) cTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGGACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAg > 1:1154080/1‑150 (MQ=255) cTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAg > 2:5007/1‑150 (MQ=255) cATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTtttggtctgctggcgcgtgac < 2:832412‑M1/73‑22 (MQ=255) cATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTtttggtctgctggcgcgtgac > 1:832412‑M1/1‑52 (MQ=255) cATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGc > 2:679933/1‑132 (MQ=255) cATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGc < 1:679933/132‑1 (MQ=255) aTGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATc < 1:1143647/150‑1 (MQ=255) aTGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATc > 1:783700/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAacgtacgt < 1:293650/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACg < 2:454339/75‑1 (MQ=255) gTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACg > 1:454339/1‑75 (MQ=255) aGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATtcct > 1:847847/1‑150 (MQ=255) tACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATtcc > 2:544722/1‑144 (MQ=255) tACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATtcc < 1:544722/144‑1 (MQ=255) tcctcTATCTGAGTTTTGGTCACGTGCCAGCAGCCCCTTAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCCGTGGGCGCATCGGCTCTGCTCGGTAAGTCGATCCCGTCCACCGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCaa < 1:368099/150‑1 (MQ=255) tcctcTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCaa < 1:5007/150‑1 (MQ=255) ctACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgccatgggaagcgtggc > 2:1082087‑M2/1‑35 (MQ=255) ctACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgccatgggaagcgtggc < 1:1082087‑M2/98‑64 (MQ=255) ccTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCAATCATCGa > 1:181508/1‑150 (MQ=255) cTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCAATCATCGAt < 1:1190784/150‑1 (MQ=255) tGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCAATCATCGATg < 1:821247/150‑1 (MQ=255) tGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAAAactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgccatgggaagcgtggcttgacgcaggctggacagtgc > 2:123104‑M2/1‑30 (MQ=255) tGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAAAactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgccatgggaagcgtggcttgacgcaggctggacagtgc < 1:123104‑M2/114‑85 (MQ=255) ttttGGTCACGCGCCAGCAGACCAACactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgccatgggaagcgtggct > 1:585928‑M2/1‑26 (MQ=255) ttttGGTCACGCGCCAGCAGACCAACactcaggtagaggagtgcgggtaccgctacgccgccgacagcggctgacatgggaagcgtggct < 2:585928‑M2/90‑65 (MQ=255) | GGCCTGATGACCATCTTTTTCCTGGTCGTGGGCATGGAGATCCGCCGCGAGATCCACGAAGGTGCACTGTCCAGCCTGCGTCAAGCCACGCTTCCCATGGCAGCCGCTGTCGGCGGCGTAGCGGTACCCGCACTCCTCTACCTGAGTTTTGGTCACGCGCCAGCAGACCAACAAGGTTGGGCCGTGCCAACGGCGACGGATATCGCCTTTGCGGTGGGCGTATTGGCCCTGCTCGGCAAGTCGATCCCGTCCAACGTACGTGTATTCCTCCTCGCCCTGGCAATCATCGATG > NC_002947/4466542‑4466833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |