New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4794368 | 37 (0.820) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 7.2% | coding (656/984 nt) | PP_4222 | protein SyrP |
? | NC_002947 | = 4794392 | 42 (0.970) | coding (632/984 nt) | PP_4222 | protein SyrP |
ATCGGTGTGCCGTCGCCGTAGTAGACGTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTCACATCAAGG > NC_002947/4794224‑4794514 | aTCGGTGTGCCGTCGCCGTAGTAGACGTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCTTCCAGGGGTGc > 2:142434/1‑150 (MQ=255) gtgtGCCGTCGCCGTAGTAGACGTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTgg < 2:841343/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGTAGTAGACGTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGc > 2:1170653/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGtctgccaggccgtggccacgcacccctggac < 2:1129080‑M1/150‑32 (MQ=255) atctggCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGGCCCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGt < 1:734133/146‑1 (MQ=255) aaGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGc < 2:1067583/150‑1 (MQ=255) tCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGGAGCTCa < 1:106959/150‑1 (MQ=255) tCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCa < 1:1170653/150‑1 (MQ=255) cTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCACCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACcgtc < 2:795186/150‑1 (MQ=255) gacgaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGtctgccaggccgtggccacgcaccc > 1:248876‑M1/1‑95 (MQ=255) gacgaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGtctgccaggccgtggccacgcaccc < 2:248876‑M1/120‑26 (MQ=255) gacgaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCtt < 1:95327/150‑1 (MQ=255) acgaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTgcg > 1:642399/1‑131 (MQ=255) acgaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTgcg < 2:642399/131‑1 (MQ=255) gaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCtt < 1:184396/147‑1 (MQ=255) gaTTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCtt > 2:184396/1‑147 (MQ=255) tCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTcc > 1:920691/1‑150 (MQ=255) cGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCt < 1:1139406/116‑1 (MQ=255) cGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCt > 2:1139406/1‑116 (MQ=255) ggTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCTCAATTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCt > 1:822348/1‑150 (MQ=255) gagaCATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACt > 2:842177/1‑150 (MQ=255) aTGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGcc < 1:828005/139‑1 (MQ=255) aTGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGcc > 2:828005/1‑139 (MQ=255) aTGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCt > 2:622648/1‑150 (MQ=255) aTGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCt < 1:112139/150‑1 (MQ=255) gAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCg > 2:941145/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCgg < 2:614963/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTc > 1:234105/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCg < 1:941145/150‑1 (MQ=255) gCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGgtg < 1:1163071/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGAtg < 2:779999/103‑1 (MQ=255) cTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGAtg > 1:779999/1‑103 (MQ=255) ccATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTg > 2:39390/1‑150 (MQ=255) tACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTc < 1:39390/150‑1 (MQ=255) aCCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGATAAACACCTGCTcc > 2:689128/1‑150 (MQ=255) cTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTc < 1:1101264/111‑1 (MQ=255) cTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTc > 2:1101264/1‑111 (MQ=255) cTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCa > 1:944904/1‑150 (MQ=255) ccccGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTTCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTcac > 1:373691/1‑150 (MQ=255) ccccGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTcac > 1:595454/1‑150 (MQ=255) cccGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTcaca > 2:986226/1‑150 (MQ=255) gTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGAcctggacgggggatcaggtatggttcaatcaggcccacctgttccatgtctccaacctaccggccgaggtgcgcgaaagcctgctggaaatcgtcgacgaggaagacttgccgcgcaac < 2:1129080‑M2/150‑120 (MQ=255) cAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTTCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTCACATCAAgg < 2:373691/150‑1 (MQ=255) gggTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGAcctggacgggggatcaggtatggttcaatcaggcccacctgttccatgtctccaacctaccggccgaggtgcgcgaaagcctgctggaaatcgtc < 2:248876‑M2/120‑96 (MQ=255) gggTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGAcctggacgggggatcaggtatggttcaatcaggcccacctgttccatgtctccaacctaccggccgaggtgcgcgaaagcctgctggaaatcgtc > 1:248876‑M2/1‑25 (MQ=255) | ATCGGTGTGCCGTCGCCGTAGTAGACGTTGCGCGGCAAGTCTTCCTCGTCGACGATTTCCAGCAGGCTTTCGCGCACCTCGGCCGGTAGGTTGGAGACATGGAACAGGTGGGCCTGATTGAACCATACCTGATCCCCCGTCCAGGGGTGCGTGGCCACGGCCTGGCAGACCTGGCGCGTGCGCAGCTCACCGTCGTCCTTCCATTCCCAGTCGATGTGGTGCGCGCGGCAATAGGCCTCCACTACGCTGCGGTCCTCGGTGTTGAACACCTGCTCCCAACTCACATCAAGG > NC_002947/4794224‑4794514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |