New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5334493 = | 59 (1.310) | 4 (0.090) | 4/232 | NT | 7.2% | coding (875/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5334532 = | 48 (1.140) | coding (914/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
ACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTCGGCAGCCAGCGGCCTG > NC_002947/5334345‑5334629 | aCCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTg < 1:293951/150‑1 (MQ=255) ccaggtggttcagggccatgcccgacagcgccagggtggtgacgatgatcaggccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTgg < 1:686415‑M1/3‑1 (MQ=255) caggtggttcagggccatgcccgacagcgccagggtggtgacgatgatcaggccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGt < 2:631325‑M1/4‑1 (MQ=255) gtggttcagggccatgcccgacagcgccagggtggtgacgatgatcaggccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGTGCt > 1:408273‑M1/144‑150 (MQ=255) gctgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCt > 2:725693/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCtg > 2:1094233/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCtg‑t < 2:832712/150‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCtg‑t > 2:1197905/1‑150 (MQ=255) ccatgcccgacagcgccagggtggtgacgatgatcaggccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGTGCTG‑TGggccggcc < 1:255559‑M1/18‑1 (MQ=255) ttcGCCTCGGCCATCGTCATGCAGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTg > 1:319895/1‑150 (MQ=255) gCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGGGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTgcgc > 1:1127137/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCGCATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGATGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGcc > 2:619048/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGAGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCt < 1:1106617/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCAAATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCt > 1:1136480/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCATCGTCATGCAGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCt < 2:319895/150‑1 (MQ=255) cGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCGCATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTgg < 1:619048/150‑1 (MQ=255) cGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTgg < 1:849230/150‑1 (MQ=255) gCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGgc < 1:1094233/150‑1 (MQ=255) cATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGGTCACTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCGGCCGCTGTTGCTGCTGCTGATGAGCCATGCCGGACGGCTAGAGCCG‑TGGGGTGGGCATCGGCTGGgcgc > 2:345493/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCa > 1:54187/1‑150 (MQ=255) gCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCaa > 2:621537/1‑150 (MQ=255) gtgacgatgatcaggccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAAc > 2:255559‑M1/110‑150 (MQ=255) acaTGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCg > 1:720865/1‑150 (MQ=255) aTGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGTGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TCGGCCGGCCTGCCCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAg > 2:510853/1‑150 (MQ=255) aTGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAg < 1:772347/150‑1 (MQ=255) tGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGt > 1:53060/1‑150 (MQ=255) aCCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACt > 1:631325/1‑150 (MQ=255) aCCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTCGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGCCCGGAATGCGCATGGGCGCCAGCACCAACCCCGCCTACt > 2:280619/1‑150 (MQ=255) cacaTGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGggccggc > 2:609448/1‑114 (MQ=255) cacaTGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGggccggc < 1:609448/114‑1 (MQ=255) acaTGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCa > 2:664503/1‑150 (MQ=255) gccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCAc < 2:508787‑M1/37‑1 (MQ=255) gccgctggctgccgacaggccgccaatgtaggccagcagtgccaatgcctggttgttggcggcgatgcccaggcccagggtgaagtactcggggtTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCAc > 1:508787‑M1/96‑132 (MQ=255) aTGGCCTTTACAGAGAACCTCAAACCACGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGTGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCAcc < 2:435751/150‑1 (MQ=255) gCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACcctg < 1:68161/150‑1 (MQ=255) gCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACcctg < 1:664503/150‑1 (MQ=255) ccTTTACCGCGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGTGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCTTTCCCGTGCCGCTGGTGCTGCTCAGGCTG‑CTACGGCGGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACcctgg < 1:510853/150‑1 (MQ=255) cTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACcctggg > 2:1024794/1‑150 (MQ=255) aCCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCt < 2:635592/86‑1 (MQ=255) aCCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCt > 1:635592/1‑86 (MQ=255) gagaACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTCCTTCACCctgggcctgggc > 2:385895/1‑150 (MQ=255) gagaACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCGGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGGACGTCACCctgggcctgggc > 2:665682/1‑150 (MQ=255) acaaCCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCNCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCa < 1:345493/148‑1 (MQ=255) cTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGCTCAA‑GGTGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATcgcc > 1:75062/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTg > 2:764354/1‑75 (MQ=255) aaCCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTg < 1:764354/75‑1 (MQ=255) aaCCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCgccgcc > 1:622931/1‑150 (MQ=255) cccGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCcaa > 2:302986/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCa > 1:679183/1‑106 (MQ=255) ccGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCa < 2:679183/106‑1 (MQ=255) cgctcgctGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCaacaac < 2:694443/150‑1 (MQ=255) tcgctGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAg < 1:1197905/150‑1 (MQ=255) gctGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCGCGCTTCGGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGc < 1:665682/150‑1 (MQ=255) gctGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGc > 2:541475/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCAt > 2:577881/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCAtt < 2:1127137/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTgg < 1:577881/150‑1 (MQ=255) gcCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTg > 1:571882/1‑78 (MQ=255) gcCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTg < 2:571882/78‑1 (MQ=255) tGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGcc > 2:340673/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTg < 1:621537/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGAACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTg < 1:844165/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCctgggcctgggc > 1:952458/1‑106 (MQ=255) gCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCctcggcctgggc < 2:952458/106‑1 (MQ=255) gCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCAACCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACACCCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTGCATTgg > 1:1116666/1‑150 (MQ=255) ccGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCCCCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTggc < 1:905421/150‑1 (MQ=255) gTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCt < 2:53060/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTc > 2:686415/1‑150 (MQ=255) atgaGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTCGGcagccagc > 1:1037800/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGTGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTCGGCAGCCAGCGGCCt > 2:36582/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTCCGCATCCAGCGGCCTg < 2:677288/150‑1 (MQ=255) | ACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTG‑TGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAACCCCGAGTACTTCACCCTGGGCCTGGGCATCGCCGCCAACAACCAGGCATTGGCACTGCTGGCCTACATTGGCGGCCTGTCGGCAGCCAGCGGCCTG > NC_002947/5334345‑5334629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |