New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5701854 = | 54 (1.200) | 5 (0.120) | 4/234 | NT | 9.4% | coding (534/852 nt) | phaB | poly(3‑hydroxyalkanoate) depolymerase |
? | NC_002947 | 5701880 = | 45 (1.060) | coding (560/852 nt) | phaB | poly(3‑hydroxyalkanoate) depolymerase |
CCGGTGCGGTAATGGTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGCGACGACGACCCGTTGATCCCGCTGATC > NC_002947/5701706‑5702001 | aatccgccaggccagcaggcgcatgttgatcagcgggatcaacgggtcgtcgtcgccagccagtaccagggtgggctgccggatcttgtgcagccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctt > 2:831036‑M1/150‑150 (MQ=255) gTGCGGTAATGGTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATgccg > 2:227336/1‑150 (MQ=255) ccgccaggccagcaggcgcatgttgatcagcgggatcaacgggtcgtcgtcgccagccagtaccagggtgggctgccggatcttgtgcagccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTgcc > 1:1118563‑M1/147‑150 (MQ=255) gTAATGGTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGCCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCACCCATCGCCAGTACTTGACCAAGTAGTC‑TGCAGCGATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCGATGCACCATGCCGCCAAg > 1:1178154/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGAGCTATGGCGGCGGCTTCAGACGTGACGCCGATCTGGCCATGCACCATGCCGCAAAGGTgcg < 2:702165/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATGCGAATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCGATGGACCATGCCGCCAAGGTgcgc < 2:1022472/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTgcgc > 1:334912/1‑150 (MQ=255) aGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCcgg > 1:460249/1‑150 (MQ=255) ggCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCcggc < 1:370491/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCcggcg < 2:460249/150‑1 (MQ=255) cccAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAg > 1:267873/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTggg < 2:1000989/150‑1 (MQ=255) agcgggatcaacgggtcgtcgtcgccagccagtaccagggtgggctgccggatcttgtgcagccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTgg > 1:1112820‑M1/119‑150 (MQ=255) gTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGc < 2:913138/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGct < 2:1178154/150‑1 (MQ=255) gtgGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGctacta > 2:935484/1‑150 (MQ=255) gatgatGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGctac > 2:1050863/1‑145 (MQ=255) gatgatGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGctac < 1:1050863/145‑1 (MQ=255) gatgatGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTg > 1:110177/1‑150 (MQ=255) gCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGACCATCTTGGGCAGCTGTTCg < 1:41602/150‑1 (MQ=255) cccccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGc > 1:162326/1‑150 (MQ=255) cccccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGc > 1:1131268/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTTCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCcgg < 1:885308/114‑1 (MQ=255) ccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTGcgg > 2:885308/1‑114 (MQ=255) ccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAgg < 1:227336/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTAATACTGGCAGCTGTTCGCAgg > 1:594152/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTgg > 2:239250/1‑150 (MQ=255) gCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGAc < 2:334912/150‑1 (MQ=255) cATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACCACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCa > 2:959026/1‑150 (MQ=255) tCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCCCAGTTTCCCTACCCTCGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATc < 1:142168/150‑1 (MQ=255) t‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCaa < 2:381701/94‑1 (MQ=255) t‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCaa > 1:381701/1‑94 (MQ=255) t‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGc < 2:1131739/150‑1 (MQ=255) gtgcagccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTgg < 1:225934‑M1/32‑1 (MQ=255) gtgcagccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTgg > 2:225934‑M1/63‑94 (MQ=255) gCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGcaca > 1:502196/1‑150 (MQ=255) gCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGcaca > 1:314124/1‑150 (MQ=255) agccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCt > 1:775385‑M1/59‑88 (MQ=255) agccagtggatgctggtccagccgagccctgcgaacagctgccagtagtagcccagctTGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCt < 2:775385‑M1/30‑1 (MQ=255) gatgatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGc < 1:873055/105‑1 (MQ=255) gatgatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGc > 2:873055/1‑105 (MQ=255) gatgatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCa < 1:1105556/150‑1 (MQ=255) atgatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGCGACCCCGCCATGGCGATGCACCATGGTGCCAAGGTGCGCTCCGGCGCAAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAg < 1:570092/150‑1 (MQ=255) gatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTgg > 1:103380/1‑130 (MQ=255) gatCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTgg < 2:103380/130‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCt < 2:1131268/150‑1 (MQ=255) gcggcggcTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCa > 2:181769/1‑118 (MQ=255) gcggcggcTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCa < 1:181769/118‑1 (MQ=255) gcggcggcTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTgg < 2:502196/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTa > 2:671998/1‑150 (MQ=255) gcTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTActgg < 1:239250/150‑1 (MQ=255) ttCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGa > 2:684808/1‑100 (MQ=255) ttCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGa < 1:684808/100‑1 (MQ=255) ttCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTActggct < 2:162326/150‑1 (MQ=255) aCGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGcga < 2:267873/150‑1 (MQ=255) tGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGcgacga > 2:437723/1‑150 (MQ=255) aCCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGcgacgacg > 2:799397/1‑150 (MQ=255) aCCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGcgacgacg > 1:80245/1‑150 (MQ=255) cTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGc < 2:165795/48‑1 (MQ=255) cTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGc > 1:165795/1‑48 (MQ=255) aTGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCa < 2:475743/79‑1 (MQ=255) aTGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCa > 1:475743/1‑79 (MQ=255) cACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGCGACGACGACCCGTTGATCCCGCTg > 1:911845/1‑150 (MQ=255) cATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGCGACGACGACCCGTTGATCCCGCTGATc < 1:671998/150‑1 (MQ=255) | CCGGTGCGGTAATGGTGCCAGGCAAGCCCAAGGTGCTGTGGATGATGGCCAGCCCCCGGCGTTACGTGCAGCCATCGCATGT‑CATCCGCATTGCGCCGATGATCTATGGCGGCGGCTTCCGACGTGACCCCGACCTGGCCATGCACCATGCCGCCAAGGTGCGCTCCGGCGGCAAGCTGGGCTACTACTGGCAGCTGTTCGCAGGGCTCGGCTGGACCAGCATCCACTGGCTGCACAAGATCCGGCAGCCCACCCTGGTACTGGCTGGCGACGACGACCCGTTGATCCCGCTGATC > NC_002947/5701706‑5702001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |