New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5726880 = | 46 (1.020) | 4 (0.090) | 4/232 | NT | 9.3% | coding (142/2574 nt) | opgH | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
? | NC_002947 | 5726901 = | 35 (0.830) | coding (121/2574 nt) | opgH | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
CACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAGTTACTCA > NC_002947/5726731‑5727020 | cACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCt > 2:139082/1‑150 (MQ=255) cACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCt > 1:523131/1‑150 (MQ=255) aCGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTg > 1:715589/1‑150 (MQ=255) cctggagctatcagttgcctgccgatgagtaactcaagcgcaaggccggaatcgcttggcgagtacctggcccacccaccactgagcgacgagcagcgggctgagcttgccagctgcacctcgttcagtgagctacaccaacgctTggcg > 1:228116‑M1/146‑150 (MQ=255) ccTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTggcgg < 2:1022650/150‑1 (MQ=255) gATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGTCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgccgc < 2:882934/150‑1 (MQ=255) gcctgccgctgagtaactcaagcgcaaggccggaatcgcttggcgagtacctggcccacctaccactgagcgacgagcagcgggctgagcttgccagctgcacctctttcagtgagctacaccaacgctTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCa > 1:161314‑M1/130‑150 (MQ=255) gCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTgg > 1:594645/1‑150 (MQ=255) gCGAGCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTgg < 2:246649/150‑1 (MQ=255) aTCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGCCGTCGCTCCTCTCGGCTTTTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCATGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgtgt < 1:569718/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGc > 2:491772/1‑150 (MQ=255) gCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGc > 2:558310/1‑134 (MQ=255) gCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGc < 1:558310/134‑1 (MQ=255) gCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACt < 1:491772/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTg < 1:1096338/114‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTg > 2:1096338/1‑114 (MQ=255) cGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTCCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCTTCGGGAGAGCTGGCGGCCGGGCTTGCCGCCAATCGTTGGGGACGCCCCCTGACCGAGGTGc > 2:211288/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCAGGTTGGCCCACAAGCGCTGATGGAGCATGCGGAATGAGTTTCTGCTGGCAAGCTc > 2:918291/1‑150 (MQ=255) cGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGaa > 2:649600/1‑127 (MQ=255) cGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGaa < 1:649600/127‑1 (MQ=255) cGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAg < 2:925860/150‑1 (MQ=255) gAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTg < 1:1136679/97‑1 (MQ=255) gAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTg > 2:1136679/1‑97 (MQ=255) ctggcccacctaccactgagcgacgagcagcgggctgagcttgccagctgcacctcgttcagtgagctacaccaacgctTggc < 1:290530‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggcccacctaccactgagcgacgagcagcgggctgagcttgccagctgcacctcgttcagtgagctacaccaacgctTggc > 2:290530‑M1/80‑83 (MQ=255) aTTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCgc < 1:401848/150‑1 (MQ=255) aTTTCGGCTTCTTCCAGATCGGAGGCGTGTGCCATTCTGATGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGATGTTCCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCgc < 1:209422/150‑1 (MQ=255) tttCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCgctg > 2:63404/1‑103 (MQ=255) tttCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGCTg < 1:63404/106‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGTTGCCTACGCCCATTCGCCCGCCCTCCGAGGCGTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCtc < 2:615389/150‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCtc > 2:574169/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCtcg > 2:364674/1‑150 (MQ=255) cttcttCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGc < 1:1127193/126‑1 (MQ=255) cttcttCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGc > 2:1127193/1‑126 (MQ=255) tcttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCtcgtcg < 1:364674/150‑1 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGtt < 2:1075991/81‑1 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGtt > 1:1075991/1‑81 (MQ=255) cAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAg < 2:523131/150‑1 (MQ=255) ggcgCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTg < 1:139082/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTTAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTgg < 2:594645/150‑1 (MQ=255) cTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGcc > 2:1097801/1‑150 (MQ=255) tGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCa > 2:1207674/1‑150 (MQ=255) ccgcGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGt > 1:1205379/4‑150 (MQ=255) cACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTa > 2:636551/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCTCTGCTCGGCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCaa < 1:211288/150‑1 (MQ=255) ccagctgcacctcgttcagtgagctacaccaacgctTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTg < 2:1142034‑M1/28‑1 (MQ=255) gCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTc > 1:204877/1‑150 (MQ=255) ccACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCg > 2:842410/1‑150 (MQ=255) cACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGCTCGGCTGGGTACTCGCCAAGCGATTCCgg > 1:305470/1‑150 (MQ=255) cTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGt < 2:798989/106‑1 (MQ=255) cTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGt > 1:798989/1‑106 (MQ=255) gCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGTGCTTg > 1:402358/1‑150 (MQ=255) tgagctacaccaacgctTGGCGGCCAACCCGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCCATGCTCGTCATTCATGGGGAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGa < 1:1174441‑M1/133‑1 (MQ=255) ggCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAGtt < 2:715589/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAGTTACCCa < 1:1207674/150‑1 (MQ=255) caacgctTGGCGGCCAACCCGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTgg < 1:1142034‑M1/57‑1 (MQ=255) | CACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCCTGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAGTTACTCA > NC_002947/5726731‑5727020 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |