| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6071678 = | 63 (1.400) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 6.1% | intergenic (‑45/+57) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 6071727 = | 64 (1.490) | intergenic (‑94/+8) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
CTTTTCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTC > NC_002947/6071529‑6071815 | atgcagcaagcggcgcgtgtttcggattacaccgcgttcatgtacatgggcaaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctc < 1:360034‑M1/1‑1 (MQ=255)atgcagcaagcggcgcgtgtttcggattacaccgcgttcatgtacatgggcaaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccactc < 2:1111351‑M1/1‑1 (MQ=255) ttttCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcg > 2:721085/1‑150 (MQ=255) accaGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 2:948512/1‑150 (MQ=255) tcgtGGCCAGCAGGTTGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACGGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAAccc > 2:952477/4‑150 (MQ=255) aTGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 2:164466/1‑133 (MQ=255) aTGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:164466/133‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTg < 1:952477/150‑1 (MQ=255) cagcagGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGcc > 1:965023/1‑150 (MQ=255) agGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGac > 1:448146/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGacac > 1:487789/1‑150 (MQ=255) cTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAg < 1:948512/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGt < 2:600151/150‑1 (MQ=255) ctTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGttt < 2:965023/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTc < 2:455674/150‑1 (MQ=255) atgggcaaactggtcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTc > 2:360034‑M1/105‑150 (MQ=255) gaaaactgggcgaattcggggataccgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGa > 1:845715‑M1/101‑150 (MQ=255) ggCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcggc < 1:1146057/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tgATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGtt < 2:300045/117‑1 (MQ=255) gggTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTa < 2:1104454/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGTGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAg > 1:1111351/1‑150 (MQ=255) tAAGGCTTTCTTTGTTGATGATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTc > 2:50034/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTc < 2:1065188/150‑1 (MQ=255) gCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCg > 2:536800/1‑150 (MQ=255) tttctttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACAcc < 1:902228/70‑1 (MQ=255) tttctttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACAcc > 2:902228/1‑70 (MQ=255) ttttgtgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGc < 1:721085/145‑1 (MQ=255) tttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGc > 1:629984/1‑150 (MQ=255) tttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGc > 1:1190803/1‑150 (MQ=255) tgttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGctt < 1:536800/150‑1 (MQ=255) ttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGcc < 2:227919/115‑1 (MQ=255) ttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGcc > 1:227919/1‑115 (MQ=255) gATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCttcttc < 2:192430/150‑1 (MQ=255) gATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCttcttc < 1:554290/150‑1 (MQ=255) tcatcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 2:390971/51‑1 (MQ=255) tcatcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 1:390971/1‑51 (MQ=255) 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tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTg < 2:320631/127‑1 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTg > 1:320631/1‑127 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGcc > 2:1142411/1‑137 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGcc < 1:1142411/137‑1 (MQ=255) tttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACa > 2:1195536/1‑150 (MQ=255) tGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 1:1195536/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGTCGGGTTGGTGAACAGggtat < 2:629984/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGt > 2:160391/1‑137 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGt < 1:160391/137‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcg < 2:448146/150‑1 (MQ=255) cgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg > 1:568452/1‑142 (MQ=255) cgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 2:568452/142‑1 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggtatc > 1:480567/1‑150 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCAGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATccc > 1:1009152/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGtt < 2:1134763/62‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGtt > 1:1134763/1‑62 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTg < 1:50760/124‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTg > 2:50760/1‑124 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg > 2:557833/1‑130 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 1:557833/130‑1 (MQ=255) aGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTc > 1:461738/1‑150 (MQ=255) | CTTTTCCACCAGCCCGCCCATGGCCAGCAGGTGGCTGCGCACCTCTTCGAGCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAGTCTTCGGTCTGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTC > NC_002947/6071529‑6071815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |