| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6112622 = | 54 (1.200) | 4 (0.090) | 3/238 | NT | 7.5% | coding (179/528 nt) | PP_5363 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 6112656 = | 47 (1.090) | coding (145/528 nt) | PP_5363 | hypothetical protein | |||||
GGTCGGTAATCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCATGCCTAGGG > NC_002947/6112473‑6112769 | gtccatgaagattcgtctgccactgttggcgttggccctaggcatgagcagtccactggtacaagcccagatgctgcaaccggggttgtgggagctgaccaccagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcat < 2:703536‑M1/1‑1 (MQ=255)gtccatgaagattcgtctgccactgttggcgttggccctaggcatgagcagtccactggtacaagcccagatgctgcaaccggggttgtgggagctgaccaccagcaacatgcaggtcgatggaaagcagctaccctacatgtaattcat > 2:379961‑M1/150‑150 (MQ=255) tccatgaagattcgtctgccactgttggcgttggccctaggcatgagcagtccactggtacaagcccagatgctgcaaccggggttgtgggagctgaccaccagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcaTg > 2:950906‑M1/149‑150 (MQ=255) gtcggtAATCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTg < 1:1000101/150‑1 (MQ=255) gtAATCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGctct > 2:878911/1‑150 (MQ=255) tAATCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTg < 1:326035/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTggc < 2:385114/150‑1 (MQ=255) tcttctGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTggcg > 2:1145698/1‑150 (MQ=255) cttctGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTggcgg > 1:431876/1‑150 (MQ=255) tctGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCa < 2:431876/150‑1 (MQ=255) ctGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAg < 1:3404/150‑1 (MQ=255) gCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCaa < 1:8219/150‑1 (MQ=255) gCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTCTCCATCCACCACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCaa < 1:991391/150‑1 (MQ=255) cccGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAAc > 2:883403/1‑150 (MQ=255) ccGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACt < 1:1145698/150‑1 (MQ=255) gATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTgg < 1:33439/150‑1 (MQ=255) gggTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGc > 1:477374/1‑150 (MQ=255) tCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATg > 2:478847/1‑150 (MQ=255) cctaggcatgagcagtccactggtacaagcccagatgctgcaaccggggttgtgggagctgaccaccagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcaTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGa < 1:55052‑M1/37‑1 (MQ=255) taggcatgagcagtccactggtacaagcccagatgctgcaaccggggttgtgggagctgaccaccagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcaTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAAt > 2:55052‑M1/112‑150 (MQ=255) aGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTcc < 1:883403/150‑1 (MQ=255) ggggAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCa < 1:909513/150‑1 (MQ=255) tCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGt > 2:325838/1‑150 (MQ=255) tCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGt > 1:417783/1‑150 (MQ=255) ccACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATGGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGc > 1:678279/1‑150 (MQ=255) cACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGcc < 1:478847/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGaa > 2:177578/1‑125 (MQ=255) aCCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGaa < 1:177578/125‑1 (MQ=255) caagTTCAGGCGCGAGGCACGAACGCACACCGTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCAt > 2:744313/4‑150 (MQ=255) ttCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGAc < 1:878911/150‑1 (MQ=255) aGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCtt > 1:768865/1‑138 (MQ=255) aGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCtt < 2:768865/138‑1 (MQ=255) aGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGttctt < 1:916984/92‑1 (MQ=255) aGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGttctt > 2:916984/1‑92 (MQ=255) gCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCt > 1:807321/1‑150 (MQ=255) gCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCt > 2:445705/1‑150 (MQ=255) gAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCgg < 2:1083702/115‑1 (MQ=255) gAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCgg > 1:1083702/1‑115 (MQ=255) gAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCtggtg < 2:807321/150‑1 (MQ=255) gAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCtggtg < 1:1101577/150‑1 (MQ=255) gCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCa < 2:417783/150‑1 (MQ=255) acacCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGc > 2:140949/1‑150 (MQ=255) cagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcaTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAAt < 1:959431‑M1/39‑1 (MQ=255) cagcaacatgcaggtcgatggcaagccgctacccgacatggaattcaTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAAt > 2:959431‑M1/48‑86 (MQ=255) cTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGTTCAGCTCCCACAACCCCg > 1:1035970/1‑150 (MQ=255) cTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCg < 2:477374/150‑1 (MQ=255) acTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTg > 2:950250/1‑150 (MQ=255) tGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTgca < 1:445705/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGTTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTggg < 2:1035970/150‑1 (MQ=255) tttGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTgggt < 2:827471/150‑2 (MQ=255) gCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGCGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTTCCATCGACCTGCATGTTGCTGGGGGTTAGCGCCTACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGt > 1:68767/1‑150 (MQ=255) gCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGt > 1:1181091/1‑150 (MQ=255) cacCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAg < 2:1181091/150‑1 (MQ=255) ccTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGa > 2:4260/1‑150 (MQ=255) ccTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGa < 2:678279/150‑1 (MQ=255) ccTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGa < 1:744313/150‑1 (MQ=255) tCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTg > 2:778396/1‑150 (MQ=255) ccATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTgca < 2:159797/123‑1 (MQ=255) ccATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTgca > 1:159797/1‑123 (MQ=255) atcatTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTc > 2:678682/1‑150 (MQ=255) tcatTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCa < 1:678682/150‑1 (MQ=255) atTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCATg > 2:453740/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCTGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGc < 1:725036/124‑1 (MQ=255) cgcgTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCTGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGc > 2:725036/1‑124 (MQ=255) gcgTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCATGCCTAg < 1:325838/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCATGCCTAggg < 1:4260/150‑1 (MQ=255) | GGTCGGTAATCTTCTGTGTGCAGCCCGATTTCGGGTCCTGCAGGGGAATGTCATTCGTTGCCACCTGTTCAGGCGTCAGGCACGAACGCACACCCTTACCACCTACACTGACCCCTTGTTTGGCCAACACCCCTTCCATCATTGCGCGTTGCTCTGGCGGCAGGTTCTTCAACTGGCCGAGCATGAATTCCATGTCGGGTAGCGGCTTGCCATCGACCTGCATGTTGCTGGTGGTCAGCTCCCACAACCCCGGTTGCAGCATCTGGGCTTGTACCAGTGGACTGCTCATGCCTAGGG > NC_002947/6112473‑6112769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |