New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2049046 = | 47 (1.040) | 3 (0.070) | 3/236 | NT | 6.0% | coding (269/372 nt) | PP_1822 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2049089 = | 49 (1.140) | coding (226/372 nt) | PP_1822 | hypothetical protein |
GATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGGGCGGCGGCGTCGCGTTTG > NC_002947/2048946‑2049237 | gATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCtt < 2:661983/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTg < 2:394305/150‑1 (MQ=255) ggcAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCATCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTc > 2:780101/1‑150 (MQ=255) ggcAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTc > 2:863355/1‑150 (MQ=255) ccagttccacgcctgcccgttctgtgtcaaaacccgccgcacactgcaccgcttgaacgtgccggtggcgctgcgcgacgccaagaacgACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCa > 2:1157‑M1/90‑150 (MQ=255) aCCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCa < 2:252760/150‑1 (MQ=255) cGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAgc < 1:128577/150‑1 (MQ=255) cGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAgc > 1:552385/1‑150 (MQ=255) aTCCAGGTAAGCGATGATTGCCTGGTACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCAc > 2:710244/1‑150 (MQ=255) aaGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGt < 2:186567/150‑1 (MQ=255) cGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAgc > 1:593145/1‑134 (MQ=255) cGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAgc < 2:593145/134‑1 (MQ=255) ctGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGt < 1:860442/149‑1 (MQ=255) tcaaaacccgccgcacactgcaccgcttgaacgtgccggtggcgctgcgcgacgccaagaacgACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCtt > 2:620373‑M1/64‑113 (MQ=255) tcaaaacccgccgcacactgcaccgcttgaacgtgccggtggcgctgcgcgacgccaagaacgACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCtt < 1:620373‑M1/50‑1 (MQ=255) gCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGc > 1:1032014/1‑150 (MQ=255) tCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTgcgg < 2:825994/150‑1 (MQ=255) cATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTgcggc < 2:552385/150‑1 (MQ=255) aTACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCCTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTgcggcg > 1:676430/1‑150 (MQ=255) tACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGcggcgg < 1:177987/150‑1 (MQ=255) tACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGcggcgg < 2:1032014/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGtt > 2:182487/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGtttt < 2:372093/150‑1 (MQ=255) cAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTg > 2:968180/1‑150 (MQ=255) cAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTg < 1:710244/150‑1 (MQ=255) aGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGa < 2:667564/150‑1 (MQ=255) aGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGCCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGa > 1:438369/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGa > 1:404912/1‑150 (MQ=255) gCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACgg < 1:753860/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACggg < 1:780101/150‑1 (MQ=255) cGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCTTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGc < 2:41074/150‑1 (MQ=255) ttcttcAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGc > 1:931906/1‑150 (MQ=255) aTGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAAc > 2:152624/1‑150 (MQ=255) tgcgcgacgccaagaacgacccggtgcaccgccaggccctgcaggaaggtggcggccgggtCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTgg > 2:1157‑M2/62‑150 (MQ=255) gCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGcggcgg < 2:1155895/112‑1 (MQ=255) gCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGCTGCAGTGTGcggcgg > 1:1155895/1‑112 (MQ=255) cATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAgc > 1:543929/1‑150 (MQ=255) cATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAgc < 1:152624/150‑1 (MQ=255) tGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAgcgc > 2:117069/1‑150 (MQ=255) tGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAgcgc > 1:573147/1‑150 (MQ=255) ggCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGcc > 2:242145/1‑150 (MQ=255) gCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCTTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAGGTGGGGCAGCTTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAgcgcga > 1:265378/1‑148 (MQ=255) aagaacgacccggtgcaccgccaggccctgcaggaaggtggcggccgggtCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGa > 2:620373‑M2/51‑113 (MQ=255) aagaacgacccggtgcaccgccaggccctgcaggaaggtggcggccgggtCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGa < 1:620373‑M2/63‑1 (MQ=255) aCTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGc > 1:6748/1‑150 (MQ=255) ACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTg > 1:15988‑M1/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAAc < 2:276458/116‑1 (MQ=255) cTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAAc > 1:276458/1‑116 (MQ=255) ttCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGATCGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGAt < 2:594775/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCg > 1:201635/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCg > 1:836714/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCgg > 1:433923/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGAggg > 2:1036075/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGggcg < 2:931906/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGggcggc < 2:407081/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGggcggc < 2:836714/150‑1 (MQ=255) gTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGggcggcggc > 1:1133028/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAg > 2:250644/1‑107 (MQ=255) aCCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAg < 1:250644/107‑1 (MQ=255) ccgggtCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGGGCGGCGGCGTcgc < 2:6748‑M2/144‑1 (MQ=255) tCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGGGCGGCGGCGTCGCGTTTg > 1:779551‑M2/2‑150 (MQ=255) | GATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGGCGGTGCACCGGGTCGTTCTTGGCGTCGCGCAGCGCCACCGGCACGTTCAAGCGGTGCAGTGTGCGGCGGGTTTTGACACAGAACGGGCAGGCGTGGAACTGGTACAGCGCCAGCCCCTTGGCCGCTTGCTCGATGCGGGCCTGGGCGGCGGCGTCGCGTTTG > NC_002947/2048946‑2049237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |