New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3435481 = | 37 (0.820) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 8.5% | coding (350/981 nt) | gpJ | baseplate/tail fiber protein |
? | NC_002947 | 3435521 = | 30 (0.700) | coding (390/981 nt) | gpJ | baseplate/tail fiber protein |
CTGGTGAACCGCGCCGCTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTGTGGTGGTCTGCGA > NC_002947/3435372‑3435670 | tacctcgggggtcaactccgcctcaacaaaccggggcgaatcgaccgacacgttggtcagctcggccgacgcgctcagcccgtgatactcataggcgccgctgctgccgGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGcc > 2:657161‑M1/110‑150 (MQ=255) aCCGCGCCGCTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGgcagca > 1:525960/1‑150 (MQ=255) gccgcTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCATTGTCGGTATCCGGCAGCAgcggc < 2:412076/150‑1 (MQ=255) cgcTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGTCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGgcgc > 1:330427/1‑150 (MQ=255) cgcTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGgcgc < 1:736859/150‑1 (MQ=255) gATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGCTGTTGGTCCAGGTCCGCCTGTAGAGGCGGTAATGGAGTGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTAt < 1:1173207/150‑1 (MQ=255) aTTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATg > 1:717981/1‑150 (MQ=255) ttACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGa < 2:525960/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTAt < 2:1060425/150‑1 (MQ=255) ggAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACgg < 1:261887/150‑1 (MQ=255) gaAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTa < 1:551358/135‑1 (MQ=255) gaAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTa > 2:551358/1‑135 (MQ=255) cTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAgc > 2:209802/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGt < 1:543497/150‑1 (MQ=255) tCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCAGCCCCTATGACTATCACGTGCTGAGCGCGTCgg > 2:120124/1‑150 (MQ=255) ccGCCCGGCTGATCCTTATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGc < 2:530623/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGAGCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTCCCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGa < 2:463913/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAg < 1:922095/150‑1 (MQ=255) aTCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGa > 2:371433/1‑142 (MQ=255) aTCCTGAGGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGa < 1:371433/142‑1 (MQ=255) cagctcggccgacgcgctcagcccgtgatactcataggcgccgctgctgccgGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGgca > 1:778397‑M1/53‑97 (MQ=255) cagctcggccgacgcgctcagcccgtgatactcataggcgccgctgctgccgGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGgca < 2:778397‑M1/45‑1 (MQ=255) ggTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGcc > 2:446026/1‑150 (MQ=255) gTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGa > 2:1181813/1‑127 (MQ=255) gTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGa < 1:1181813/127‑1 (MQ=255) gCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGttt > 2:1018977/1‑150 (MQ=255) ggTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGCttgt < 2:777183/150‑1 (MQ=255) gTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTttgtt < 2:717981/150‑1 (MQ=255) tgccggctaccgacaaggcctcaagcgacagccgcgtgcggtagcCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTg < 2:778397‑M2/52‑1 (MQ=255) tgccggctaccgacaaggcctcaagcgacagccgcgtgcggtagcCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTg > 1:778397‑M2/46‑97 (MQ=255) ggctaccgacaaggcctcaagcgacagccgcgtgcggtagcCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTa > 2:657161‑M2/42‑150 (MQ=255) cTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTgccg > 2:604672/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCAGGCGATTCGCCCCGGGTGGGTGATTCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTgccg > 2:1040724/1‑150 (MQ=255) cGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTgccggccg < 2:448082/150‑1 (MQ=255) cGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTgccggccg < 1:446026/150‑1 (MQ=255) gCCTCGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCAtt < 1:180392/150‑1 (MQ=255) ttGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATtgtg > 1:731595/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTgtgg < 2:330427/150‑1 (MQ=255) tCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGAGTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGTAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTgtggtg < 1:120124/150‑1 (MQ=255) cggtagcCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTGtggtgg < 1:906227‑M2/143‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTGTGGTGGTCTGCGa < 1:458401/150‑1 (MQ=255) | CTGGTGAACCGCGCCGCTGATTACGGTGTGGAGAAGCTGGTTATCCGCCCGGCTGATCCTGATGCGGTGCCGCCGGTAGAGGCGGTAATGGAGGGCGACGAAGCGCTGCGCTACCGCACGCGGCTGTCGCTTGAGGCCTTGTCGGTAGCCGGCAGCAGCGGCGCCTATGAGTATCACGGGCTGAGCGCGTCGGCCGAGCTGACCAACGTGTCGGTCGATTCGCCCCGGTTTGTTGAGGCGGAGTTGACCCCCGAGGTACGGGCCCAGCTGCCGGCCGGGGCCATTGTGGTGGTCTGCGA > NC_002947/3435372‑3435670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |