New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3945563 | 47 (1.040) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 8.0% | coding (780/810 nt) | PP_3482 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3945582 | 47 (1.080) | coding (761/810 nt) | PP_3482 | hypothetical protein |
CACCAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCAGCCTT > NC_002947/3945436‑3945726 | cACCAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgct > 1:525101‑M2/1‑147 (MQ=255) aCCAGGCCGGCGACCATGGCGAAAGCAACGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgctg > 1:71‑M2/1‑146 (MQ=255) ccAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTgg > 2:1114204/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGc > 2:999186/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGc > 1:935481/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGca > 2:935471/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGcac > 2:388077/1‑150 (MQ=255) cGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCAGCTCAACCATGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAAt > 2:296489/1‑150 (MQ=255) gCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACAGTCAGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGCCGCAGAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTg > 1:512979/1‑150 (MQ=255) cATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTAGCCGGCTGGCACAATTCCACgg > 1:34923/1‑150 (MQ=255) cATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCACCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgc > 1:214365‑M2/1‑132 (MQ=255) cATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCACCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgc < 2:214365‑M2/134‑3 (MQ=255) gcAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAAtt > 2:529494/1‑138 (MQ=255) gcAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAAtt < 1:529494/138‑1 (MQ=255) aGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGt < 2:277797/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGtt > 2:190558/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGtt > 2:191191/1‑150 (MQ=255) agggACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCa < 2:1147280/147‑1 (MQ=255) agcGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCCGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCa < 2:771138/150‑1 (MQ=255) ccaaaccaaCGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGc > 2:987117/1‑150 (MQ=255) aaaccaaCGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAAtt > 2:363820/1‑115 (MQ=255) aaaccaaCGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAAtt < 1:363820/115‑1 (MQ=255) ccaaGGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCggg < 1:377928/150‑1 (MQ=255) ccaaCGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGCGATAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCCCGTCGCAGCGGCCCggg < 1:880168/150‑1 (MQ=255) caaCGTGCCGCGGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCgggg > 2:504086/1‑150 (MQ=255) ggTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCACCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATg > 1:586443/1‑150 (MQ=255) tGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAg > 1:1198052/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGc > 1:132282/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGcc < 1:388077/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGcc > 1:1196079/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAg > 2:497443/1‑150 (MQ=255) gcATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAg < 1:296489/150‑1 (MQ=255) acATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAg > 2:1081838/2‑150 (MQ=255) cATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAgg < 1:556654/150‑1 (MQ=255) tGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTa < 2:916943/150‑1 (MQ=255) aGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCt < 1:497443/150‑1 (MQ=255) cccccgcccgcCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGa < 2:935481/147‑1 (MQ=255) ccACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGa < 1:935471/150‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAg > 1:1048308/1‑101 (MQ=255) aCCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAg < 2:1048308/101‑1 (MQ=255) ccgcccgcCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGt > 1:908867/1‑102 (MQ=255) ccgcccgcCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGt < 2:908867/102‑1 (MQ=255) cccgccACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTg < 1:999186/150‑1 (MQ=255) acaTGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGTTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCa > 2:211841/1‑150 (MQ=255) caTGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAg < 1:190558/150‑1 (MQ=255) caTGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAg < 1:191191/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAgg < 1:135972/150‑1 (MQ=255) ggCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGc < 2:1196079/150‑1 (MQ=255) gcACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgctgtgcgccatgtggcgggcggtggcctgacatgcgccgcctcgacctggaattccagccacgacgcagcg > 1:396856‑M2/1‑26 (MQ=255) gcACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgctgtgcgccatgtggcgggcggtggcctgacatgcgccgcctcgacctggaattccagccacgacgcagcg < 2:396856‑M2/98‑73 (MQ=255) gcACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTg > 1:507075/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgctgtgcgccatgtggcgggcggtggcctgacatgcgccgcctcgacctggaattccagccacggcgcagcggaccgttg < 1:242525‑M2/104‑81 (MQ=255) acaGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGgctgtgcgccatgtggcgggcggtggcctgacatgcgccgcctcgacctggaattccagccacggcgcagcggaccgttg > 2:242525‑M2/1‑24 (MQ=255) caGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTc < 2:1198052/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCt < 2:507075/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAgc > 2:981222/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCa < 2:914875/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCa > 1:742166/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCAGcc < 1:442175/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCAGCCtt > 2:1129134/1‑150 (MQ=255) | CACCAGGCCGGCGACCATGGCGCAGGCAAGGGCGAGCAGCGACCAAACCAACGGTCCGCTGCGCCGTGGCTGGAATTCCAGGTCGAGGCGGCGCATGTCAGGCCACCGCCCGCCACATGGCGCACAGCGGGTCGGCTTCGCTGGCCGGCTGGCACAATTGCACGGCCGCCAGTTGCGGCACGTCGCAGCGGCCCGGGGCATGCAGGTACACCCGCGGCAGGTGCTCGCCGTACAGCTCACAGGTACGCTCGATCAGTGCTTGCAGGGCCTGGTCGCTGTCAGCGCAGCCTT > NC_002947/3945436‑3945726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |