New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4551231 = | 43 (0.950) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 6.7% | coding (556/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
? | NC_002947 | 4551263 = | 43 (1.010) | coding (588/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
GCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACATGGTGGCGGAAA > NC_002947/4551117‑4551411 | gcggcCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGcc < 2:492422/150‑1 (MQ=255) ggcCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCgt < 2:170604/150‑1 (MQ=255) cgaaccgcagtaaccgccatgggtgctctggtctccgacgatcgggtgggccaccatgcggtccaggtcgacgctggtgatggagttgatggtgttgatcaacgacacggcatcggcccgcgccgcgcatcgaggcggggccgaTGCCgt < 1:683176‑M2/6‑1 (MQ=255) cGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTc > 2:1047236/1‑150 (MQ=255) gcGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCCCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATAGCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGt < 2:293947/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATc < 1:573747/150‑1 (MQ=255) cgccatgggtgctctggtctccgacgatcgggtgggccaccatgcggtccaggtcgacgctggtgatggagttgatggtgttgatcaacgacacggcatcggcccgcgccgcgcatcgaggcggggccgaTGCCGTGTCGTTGAt > 2:869431‑M2/131‑145 (MQ=255) cgccatgggtgctctggtctccgacgatcgggtgggccaccatgcggtccaggtcgacgctggtgatggagttgatggtgttgatcaacgacacggcatcggcccgcgccgcgcatcgaggcggggccgaTGCCGTGTCGTTGAt < 1:869431‑M2/15‑1 (MQ=255) cGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCa > 2:730022/1‑150 (MQ=255) ggAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCAt > 1:531330/1‑150 (MQ=255) tgtgGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGACGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTc > 2:875451/1‑150 (MQ=255) tgGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCa > 2:986047/1‑150 (MQ=255) tgGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCa > 2:174505/1‑150 (MQ=255) tGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCTGCGACTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACAATCAACTCCATCACCa < 1:1051610/150‑1 (MQ=255) tGGTCACCCGCTGGTCCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCa < 2:799825/150‑1 (MQ=255) ggTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAg > 2:328629/1‑150 (MQ=255) cGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCAtgg < 1:174505/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGcc > 1:694588/1‑150 (MQ=255) cgcgcTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCa > 2:182968/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGGACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGa > 1:883337/1‑150 (MQ=255) ccGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtc < 1:698306/150‑1 (MQ=255) ccGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGCCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGGCGTTGAGCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtc > 1:18020/1‑150 (MQ=255) cGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtcg > 1:70799/1‑150 (MQ=255) tGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGc < 1:765872/136‑1 (MQ=255) tGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGc > 2:765872/1‑136 (MQ=255) tGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGAtcgtcg < 1:227186/150‑1 (MQ=255) aTCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGga < 1:730022/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCTTACTCCGAACATCACCGATATCCGCCAGACGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGGCGAACTGGACCGCAGAGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGAc > 2:724345/1‑150 (MQ=255) aGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCcga < 1:1205095/150‑1 (MQ=255) ttACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCAtggtgg < 1:882928/123‑1 (MQ=255) ttACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCAtggtgg > 2:882928/1‑123 (MQ=255) ttACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCa > 2:413661/1‑150 (MQ=255) cGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCAcc < 2:720397/92‑1 (MQ=255) cGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCAcc > 1:720397/1‑92 (MQ=255) gAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGAGCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGTCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATgg > 2:855542/1‑150 (MQ=255) cATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCgg < 1:318777/150‑1 (MQ=255) atcaacgacacggcaTCGGCCC‑CGCCTCG‑ATGCGCGGCGCGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCg < 1:869431‑M1/130‑1 (MQ=255) atcaacgacacggcaTCGGCCC‑CGCCTCG‑ATGCGCGGCGCGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCg > 2:869431‑M1/16‑145 (MQ=255) ccGATAACCGCCAGTCTGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGCTCTCATAACCTTCTGTTTGGCTATCTGCTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACt < 1:1047236/150‑1 (MQ=255) acggcaTCGGCCC‑CGCCTCG‑ATGCGCGGCGCGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCg < 1:683176‑M1/144‑1 (MQ=255) gCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCGTCTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCgg < 1:724345/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCa < 1:182968/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCGGCGTCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGt < 1:956648/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCAt < 2:231739/127‑1 (MQ=255) gTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCAt > 1:231739/1‑127 (MQ=255) CCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGAACGCATGGTGGCCCACACGGTCCCCTAAGACCGGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGcc > 1:328629‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcgcAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCAGTGCTTTGCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGACCACATGGAGGTAACGGCGGTGCGGTAGTGAAGCCGATTg > 1:928544/1‑150 (MQ=255) cgcAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCt < 2:883337/150‑1 (MQ=255) gcAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGc < 1:783136/81‑1 (MQ=255) gcAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAACGTCGACCTGGACCGCATGGTGGc > 2:783136/1‑81 (MQ=255) t‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGaa < 2:70799/150‑1 (MQ=255) aGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCg < 2:411046/110‑1 (MQ=255) aGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCg > 1:411046/1‑110 (MQ=255) gCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCCCCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACAtgg > 2:887131/1‑150 (MQ=255) gCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACAtgg < 1:413661/150‑1 (MQ=255) g‑gggCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCGGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACAtggtg < 1:131763/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACATGGTGGCGGaaa < 2:531330‑M2/149‑1 (MQ=255) | GCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCG‑GGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGCCGATTGCCTTGAACATGGTGGCGGAAA > NC_002947/4551117‑4551411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |