New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5145922 = | 50 (1.110) | 5 (0.120) | 3/238 | NT | 10.2% | coding (880/1323 nt) | srmB | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase |
? | NC_002947 | 5145955 = | 40 (0.920) | coding (847/1323 nt) | srmB | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase |
CACACGGTGTACGTACTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGAAGGTTTCGTTGGCCAGCAA > NC_002947/5145809‑5146093 | ggcgatcatcttcaccaacacccgcgccatggccgaccgcatctacggtcacctggtggccaaggacgtgaaggctttcgtgctgcatggcgaaaaggaccagcaggaccgcaAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCg > 2:835128‑M1/114‑150 (MQ=255) acacGGTGTACGTACTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACCGTTGGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCgg > 1:677845/1‑150 (MQ=255) gtacTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCg < 1:1175484/138‑1 (MQ=255) gtacTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCg > 2:1175484/1‑138 (MQ=255) gtacTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTc < 1:918530/150‑1 (MQ=255) tacTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCg < 2:993139/137‑1 (MQ=255) tacTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCg > 1:993139/1‑137 (MQ=255) acTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCt < 1:931256/150‑1 (MQ=255) cGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCAt < 1:1110049/150‑1 (MQ=255) gCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGACATgca < 2:873828/144‑1 (MQ=255) gCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGACATgca > 1:873828/1‑144 (MQ=255) aaGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGCCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCAAGTCTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTc < 2:644762/150‑1 (MQ=255) gTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCAc > 2:707600/1‑150 (MQ=255) gATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGaaa > 2:922904/1‑139 (MQ=255) gATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGaaa < 1:922904/139‑1 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTgg < 2:476208/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTc < 2:263297/106‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTc > 1:263297/1‑106 (MQ=255) cAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCtt < 1:433859/147‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCtt > 2:433859/1‑147 (MQ=255) ggTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGcca > 2:1088825/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGccacc > 2:64312/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAg > 1:16547/1‑150 (MQ=255) gTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACTTCCTTGGCCACCAGGTGAcc < 1:844427/150‑1 (MQ=255) tCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCg > 1:186791/1‑150 (MQ=255) gATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTa > 1:645841/1‑150 (MQ=255) atatCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc > 1:470521/1‑82 (MQ=255) atatCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc < 2:470521/82‑1 (MQ=255) tatCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCt < 2:487477/129‑1 (MQ=255) tatCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCt > 1:487477/1‑129 (MQ=255) gaaggctttcgtgctgcatggcgaaaaggaccagaaggaccgcaAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc < 1:33449‑M1/36‑1 (MQ=255) gaaggctttcgtgctgcatggcgaaaaggaccagaaggaccgcaAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc > 2:33449‑M1/45‑80 (MQ=255) gaaggctttcgtgctgcatggcgaaaaggaccagaaggaccgcaAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc > 2:33331‑M1/45‑80 (MQ=255) gaaggctttcgtgctgcatggcgaaaaggaccagaaggaccgcaAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGc < 1:33331‑M1/36‑1 (MQ=255) aGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCgg < 1:64312/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCa < 2:842970/150‑1 (MQ=255) cGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGTAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCggg < 2:677845/150‑1 (MQ=255) cggtcgCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGgtgt > 1:674190/1‑150 (MQ=255) gtcgCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTg < 2:674190/150‑1 (MQ=255) gCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCACGAGGCAGGATATCCCACATGGGCTGGGCTACCAGGTGTCCGTCGATTCTTTTCGCTATTGCGCGGGTGTTGGTg > 1:928684/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTTCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGa > 1:1015912/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGt > 1:507014/1‑148 (MQ=255) ccaccaGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGt < 2:507014/148‑1 (MQ=255) accaGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAg > 1:212491/1‑150 (MQ=255) ccaGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAga < 2:16547/150‑1 (MQ=255) caGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAgat > 1:139982/1‑150 (MQ=255) ttGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGcc < 2:1016986/150‑1 (MQ=255) cgcaagctggccatcgagcgcttcaagcagggcagctTGCGGTCCTGCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGcc > 2:835128‑M2/38‑150 (MQ=255) gcaagctggccatcgagcgcttcaagcagggcagctTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTc > 2:33449‑M2/37‑80 (MQ=255) gcaagctggccatcgagcgcttcaagcagggcagctTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTc < 1:33449‑M2/44‑1 (MQ=255) gcaagctggccatcgagcgcttcaagcagggcagctTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTc < 1:33331‑M2/44‑1 (MQ=255) gcaagctggccatcgagcgcttcaagcagggcagctTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTc > 2:33331‑M2/37‑80 (MQ=255) GCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGaa > 2:75069‑M1/1‑150 (MQ=255) aGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGAAGGTTTCGTTgg > 2:878774/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTCTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGAAGGTTTCGTTGGc < 2:645841/150‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAgatgat > 1:859131/1‑123 (MQ=255) cTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAgatgat < 2:859131/123‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGAAGGTTTCGTTGGCCAGCaa > 1:952770/1‑150 (MQ=255) | CACACGGTGTACGTACTCGTCACCGCTACGTGGCATGTCGAAGTTGATCACCAGGTCCAGGCCGTCGATATCCAGGCCACGGGCTGCCACGTCGGTCGCCACCAGCACTTTGGAGCTGCCCTGCTTGAAGCGCTCGATGGCCAGCTTGCGGTCCTTCTGGTCCTTTTCGCCATGCAGCACGAAAGCCTTCACGTCCTTGGCCACCAGGTGACCGTAGATGCGGTCGGCCATGGCGCGGGTGTTGGTGAAGATGATCGCCTTGTCGAAGGTTTCGTTGGCCAGCAA > NC_002947/5145809‑5146093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |