New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5695456 = | 53 (1.170) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 7.8% | coding (124/1272 nt) | pyrC' | dihydroorotase‑like protein |
? | NC_002947 | 5695501 = | 43 (0.980) | coding (169/1272 nt) | pyrC' | dihydroorotase‑like protein |
CCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGACACCTCGGC > NC_002947/5695356‑5695643 | ccGGGTGATCGTCCCCAACAGCGCGCTGGACCAGGTCGCCGATCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑Gt < 2:436039/150‑1 (MQ=255) gggTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCg < 1:153738/150‑1 (MQ=255) aTCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGCCGCCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTg < 1:1035725/150‑1 (MQ=255) acaccgccggcaacggcagcgcgggtttcactggcgatgttgcctttgcggctgtaacccggctcgcgcagggacacgcccaggtcgaccagGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTgg > 1:264172‑M1/93‑150 (MQ=255) cGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTggg < 1:1017652/150‑1 (MQ=255) gACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGc < 1:725389/150‑1 (MQ=255) aCCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCg > 1:1028069/1‑150 (MQ=255) ggcaacggcagctcgggtttcactggcgatgttgccttttcggctgtaacccggctcgcgcagggacacgcaccggccggtttcagcGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCgtg > 2:250613‑M1/88‑150 (MQ=255) cccAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCgtg > 1:564265/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTGGCGCGGCCCTGCTCTCCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCgtgt < 2:821940/150‑1 (MQ=255) ccAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCgtgt > 1:1202118/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCgcag < 1:256601/150‑4 (MQ=255) gTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTgc < 2:1202118/150‑1 (MQ=255) ccTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTg > 2:569159/1‑124 (MQ=255) ccTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTg < 1:569159/124‑1 (MQ=255) aCCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCgg < 1:808744/150‑1 (MQ=255) tCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACa < 2:1068019/150‑1 (MQ=255) tCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACa > 2:443080/1‑150 (MQ=255) cactggcgatgttgcctttgcggctgtaacccggctcgcgcagggacacgcccaggtcgaccagGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTc < 1:1096372‑M1/51‑1 (MQ=255) cactggcgatgttgcctttgcggctgtaacccggctcgcgcagggacacgcccaggtcgaccagGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTc > 2:1096372‑M1/65‑115 (MQ=255) aCCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGGCATCGGTGCAGCACCCGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGc < 2:564265/150‑1 (MQ=255) cGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCg > 2:702352/1‑150 (MQ=255) cTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCaaa < 2:607728/150‑1 (MQ=255) tGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAg > 1:415219/1‑150 (MQ=255) ccTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCaa < 2:275527/150‑1 (MQ=255) cTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAAc > 2:715663/1‑150 (MQ=255) ggACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACAt > 1:862064/1‑150 (MQ=255) gcCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTg > 1:162348/1‑150 (MQ=255) ccGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGa > 2:976833/1‑150 (MQ=255) tCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCt < 1:1065285/100‑1 (MQ=255) tCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCt > 2:1065285/1‑100 (MQ=255) gCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCgg > 2:104941/1‑109 (MQ=255) gCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCgg < 1:104941/109‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCTGGTTACAAACACAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTg > 2:316089/1‑150 (MQ=255) ccgcACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCcg > 1:318427/1‑150 (MQ=255) cacgcccaggtcgaccaggccgggcgcagcgaccaggccatcagcctggatcgtgcggctggcgCTGAAACCGGCCGGTGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGAAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGAGCTGCCGTTGcc > 2:250613‑M2/65‑150 (MQ=255) cggccggTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCATTGccattctcc < 2:162348/150‑8 (MQ=255) ccaggtcgaccaggccgggcgcagcgaccaggccatcagcctggatcgtgcggctggcCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGgtgt > 1:264172‑M2/59‑150 (MQ=255) gttCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGAGCCCTCCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCGACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAg > 1:634262/2‑150 (MQ=255) gaccaggccgggcgcagcgaccaggccatcagcctggatcgtgcggctggcCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTg > 2:1096372‑M2/52‑115 (MQ=255) gaccaggccgggcgcagcgaccaggccatcagcctggatcgtgcggctggcCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTg < 1:1096372‑M2/64‑1 (MQ=255) gATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCt > 1:844192/1‑135 (MQ=255) gATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCt < 2:844192/135‑1 (MQ=255) gggCTGCTGGACTGGTCGCTGCGCCGGGCGTG‑‑GTCGACCTGGGCGTTTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCa < 2:862064/149‑1 (MQ=255) gCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGt > 1:1015388/1‑63 (MQ=255) gCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGt < 2:1015388/63‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGGAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCt < 2:415219/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTg > 2:513098/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTg > 1:781070/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTg < 2:95030/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGCCGTGTCCCTCCGCCAGCCCGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTg < 2:1055/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGac > 1:226676/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGac > 1:782385/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGaca > 2:1158329/1‑150 (MQ=255) gcCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGACACCTcggc < 1:1158329/150‑1 (MQ=255) cccGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGAc < 1:266984/125‑1 (MQ=255) cccGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGAc > 2:266984/1‑125 (MQ=255) cTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGa > 1:891087/1‑118 (MQ=255) cTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGa < 2:891087/118‑1 (MQ=255) cTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGa < 2:891504/118‑1 (MQ=255) cTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGa > 1:891504/1‑118 (MQ=255) | CCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGGCGGCCGCATTGTCGCCATCGGCGCCGCACCGGCCGGTTTCAGCGCCAGCCGCACGATCCAGGCTGATGGCCTGGTCGCTGCGCCCGGCCTG‑‑GTCGACCTGGGCGTGTCCCTGCGCGAGCCGGGTTACAGCCGCAAAGGCAACATCGCCAGTGAAACCCGCGCTGCCGTTGCCGGCGGTGTCACCAGCCTGTGCTGCCCGCCACAGACCAAGCCGGTGCTGGACACCTCGGC > NC_002947/5695356‑5695643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |