| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4625972 = | NA (NA) | 389 (0.990) | 164/294 | 0.2 | 91.5% | intergenic (+4519/+45) | PP_5654/PP_4091 | phosphotriesterase/transposase |
| ? | NC_002947 | = 4965172 | 36 (0.090) | coding (231/1476 nt) | fleQ | transcriptional regulator FleQ | |||||
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
ATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4626120‑4625972‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTACCGCGAAA < NC_002947/4965172‑4965024 ACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGA < 2:7000928/150‑1 ACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGA < 1:5737077/150‑1 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2:4001890/1‑150 TCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGA < 2:7918266/150‑1 TCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGA < 2:1960948/150‑1 TCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGA < 2:566367/150‑1 CAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTGTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCG > 2:4861162/1‑150 AGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGG > 1:2774777/1‑150 AGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGA > 2:1370748/1‑100 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CACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTG < 1:1422181/150‑1 ACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGG > 1:1763880/1‑150 CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGA > 1:2002333/1‑150 CTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGAC > 2:3738490/1‑150 TGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCCAGCTACAGCCAATTGCTGGACTC > 2:3329241/1‑150 TGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGC < 1:4610041/150‑1 TGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGC < 2:4188709/150‑1 GGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCT > 2:525695/1‑150 gGGGGTTCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCACTTGCTGGACTCGCTGCACCG > 1:8320941/2‑150 TCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCA > 1:7061732/1‑150 TCATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCA > 1:500201/1‑150 CATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAG < 2:5834462/150‑1 ATGGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCCACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGG > 2:43560/1‑150 GGATCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTC > 1:6258291/1‑150 TCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTAC < 1:737938/150‑1 TCGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTAC > 1:4372989/1‑150 CGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTACC < 2:3940118/150‑1 CGGTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTACC < 2:632428/150‑1 GTTACTGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTACCGC > 1:4875684/1‑150 ATACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4626120‑4625972‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAGTTCCTTCCGGTTTTGCTTTTAGGTGAAATTTCTTCCGCCGAGCTGCCGGAAGACCTTCGCCGCCGGGTGCTTTCCAACCTGGAAATGCCGCCAAGCTACAGCCAATTGCTGGACTCGCTGCACCGTGCCCAGGTCTACCGCGAAA < NC_002947/4965172‑4965024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |