New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5200727 | 33 (1.500) | 3 (0.140) | 3/246 | NT | 8.9% | coding (324/774 nt) | yafJ | amidotransferase |
? | NC_002947 | = 5200748 | 30 (1.420) | coding (303/774 nt) | yafJ | amidotransferase |
ACCGGCACCGGTTCGGGGAAGGCGCTGCGGATGCGGTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCTGCACGAGGTTGGCCACTTC > NC_002947/5200602‑5200876 | accggcaccggTTCGGGGAAGGCGCTGCGGATGCGGTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGcgg < 1:364803‑M2/150‑4 (MQ=255) ccgggAAGGCGACGTGGATTCGGTTTAGCAAGTCGCAGAAGGGCGCTTCCCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTccc < 1:280191/148‑1 (MQ=255) cGGATGCGGTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGCAGCACCAGTTGCGGCCCCACAGTTCCCGCAGGAGCgggtgg < 2:364491/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGGTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACgggtgg < 2:323863/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGa > 2:203788/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGAc < 1:133651/150‑1 (MQ=255) aGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAgg < 1:203788/150‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCCCCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGc < 1:181347/150‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGc < 2:435544/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGca > 2:425550/1‑150 (MQ=255) cAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTACCAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGca < 1:546117/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGAc > 1:406699/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACGCTGCCGACGTTGGCCTGAc < 2:382024/150‑1 (MQ=255) tCGCCCACTGGCCGGTAGGAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGa < 2:293072/150‑1 (MQ=255) gCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACgggtgg > 2:15921/1‑103 (MQ=255) gCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACgggtgg < 1:15921/103‑1 (MQ=255) gCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAgg < 2:160870/115‑1 (MQ=255) gCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAgg > 1:160870/1‑115 (MQ=255) aCTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATc > 2:471103/1‑150 (MQ=255) gCCGGTAGAAACGGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCAACATTCCCCGCACGAACGGGTGGGTGGCCGACAGGCACACCCTGCCGACTTTGGCCTGACGGATATGACCGATcaccc < 2:177594/150‑2 (MQ=255) tctcTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACcacttcactt < 1:122281/147‑1 (MQ=255) aaCTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTTCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTg < 1:153601/116‑1 (MQ=255) aaCTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTg > 2:153601/1‑116 (MQ=255) gCCAGGCCCGTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATc < 1:25992/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAgcg > 2:448851/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTg > 1:445538/1‑102 (MQ=255) ttGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTg < 2:445538/102‑1 (MQ=255) tGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGTCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCt < 2:406699/150‑1 (MQ=255) tCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCTGCACg > 2:366943/1‑150 (MQ=255) cccAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGcggccagctgggtgacttcaagggcctggccagtttctaccggccagtgggcgacaccgacagcgaagcgg > 1:176104‑M2/1‑33 (MQ=255) cccAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGcggccagctgggtgacttcaagggcctggccagtttctaccggccagtgggcgacaccgacagcgaagcgg < 2:176104‑M2/104‑72 (MQ=255) ccAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGcggccagctgggtgacttcaagggcctggccagtttctaccggccagtgggcgacaccgacagcgaagcggtcttctacggactccgcaaccgcatccccagcgccttcccggaaccg < 2:429686‑M2/150‑119 (MQ=255) cTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCTGCACGAGGTTGGc < 1:425550/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCTGCACGAGGTTGGCCACTTc < 1:506058/150‑1 (MQ=255) | ACCGGCACCGGTTCGGGGAAGGCGCTGCGGATGCGGTTGAGCAAGTCGCAGAAGGCCGCTTCGCTGTCGGTGTCGCCCACTGGCCGGTAGAAACTGGCCAGGCCCTTGAAGTCACCCAGCTGGCCGTTGTGCGCGAAGCACCAGTTGCGGCCCCACATTTCCCGCACGAACGGGTGGGTGTTGGACAGGCACACCCTGCCGACGTTGGCCTGACGGATATGACCGATCACCACTTCACTTTTGATCGGGTAGCGCTGCACGAGGTTGGCCACTTC > NC_002947/5200602‑5200876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |