New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1657857 = | 31 (1.100) | 4 (0.150) | 4/230 | NT | 13.6% | coding (679/1698 nt) | PP_1450 | TPS family activation/secretion protein |
? | NC_002947 | 1657905 = | 22 (0.840) | coding (631/1698 nt) | PP_1450 | TPS family activation/secretion protein |
GCACCGTGCGGGCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAA > NC_002947/1657710‑1658004 | gCACCGTGCGGGCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGc < 2:214034/150‑1 (MQ=255) ccGTGCGGGCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCg > 1:701580/1‑150 (MQ=255) gggCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCa < 1:83589/150‑1 (MQ=255) ggCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCAc < 1:62525/150‑1 (MQ=255) cAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGAc > 1:620356/1‑150 (MQ=255) tcatTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGc < 2:246399/150‑1 (MQ=255) catTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCa < 2:620356/150‑1 (MQ=255) catTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCa < 2:379018/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTc < 2:615401/150‑1 (MQ=255) gCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGgca < 1:304375/150‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGGGGCCGGTCAGCTCTCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGACGGGCAGCaa < 2:154659/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTg > 1:326013/1‑150 (MQ=255) ttgggcagccactgtacctgcccgaccttgagcaaggcctggaccagctcaaccgccttcgcgcctatgaactgggcgccaccttgcTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCgg > 2:248974‑M1/88‑132 (MQ=255) ttgggcagccactgtacctgcccgaccttgagcaaggcctggaccagctcaaccgccttcgcgcctatgaactgggcgccaccttgcTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCgg < 1:248974‑M1/45‑1 (MQ=255) cGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTg < 2:353991/107‑1 (MQ=255) cGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTg > 1:353991/1‑107 (MQ=255) cGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCAt > 2:70715/1‑150 (MQ=255) gcgGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGc > 2:211430/1‑74 (MQ=255) gcgGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGc < 1:211430/74‑1 (MQ=255) gcggcCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGtt < 1:9489/150‑1 (MQ=255) ggcCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGa > 1:528595/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTg > 2:73357/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCt > 2:399437/1‑150 (MQ=255) cagctcaaccgccttcgcgcctatgaactgggcgccaccttgcTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGgca < 2:17703‑M1/48‑1 (MQ=255) cagctcaaccgccttcgcgcctatgaactgggcgccaccttgcTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGgca > 1:17703‑M1/44‑91 (MQ=255) tCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCg > 1:573821/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCg < 2:528595/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAg < 1:73357/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGTCCAGGTGCAAGCGTGAAACAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGAGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAg > 2:189534/1‑150 (MQ=255) cGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAgg < 1:399437/150‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGc < 2:355990/128‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGc > 1:355990/1‑128 (MQ=255) gCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTa > 2:741897/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGAGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGt < 2:76232/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTg > 1:460627/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGc < 2:573821/150‑1 (MQ=255) gCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAg < 2:431773/131‑1 (MQ=255) gCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAg > 1:431773/1‑131 (MQ=255) tttGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGGCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGaa < 2:742421/149‑1 (MQ=255) | GCACCGTGCGGGCCAACGACAGGCGCAGCTCATCATTGAGGCCAAGCGGGCTGTCCAGGCCAATGCCGAGGTTGACGCGGTGGCGGCCGGTCAGCTCGCTGCCCCGGTTGTCGAAGCGGCTGTCCAGGTGCCAGCGTGAAGCAACCTTGCCCGGCTGCACGACCACGCGGGTGCCGCCCTGCAGTTCGCCGGGCAGCAAGGTGGCGCCCAGTTCATAGGCGCGAAGGCGGTTGAGCTGGTCCAGGCCTTGCTCAAGGTCGGGCAGGTACAGTGGCTGCCCAAGCAGGCCTGGGAA > NC_002947/1657710‑1658004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |