New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1434028 | 34 (1.210) | 6 (0.220) | 6/234 | NT | 14.9% | coding (363/1248 nt) | PP_1255 | cis‑4‑hydroxy‑D‑proline oxidase |
? | NC_002947 | = 1434082 | 36 (1.340) | coding (309/1248 nt) | PP_1255 | cis‑4‑hydroxy‑D‑proline oxidase |
TGGCGTGACTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGGCGCTTGAGGATCGACAGGTCGGCAATCGGGA > NC_002947/1433933‑1434218 | tGGCGTGACTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGcc > 2:183019/1‑150 (MQ=255) gTGACTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggc < 1:116913‑M2/150‑5 (MQ=255) aCTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGcc < 2:75075/143‑1 (MQ=255) aCTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGcc > 1:75075/1‑143 (MQ=255) tCAGGCTTCTCGCTCACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGAGCCTGCTGGCGCCACCTGGTTGGTGCCACGCGCCCAGGGTGCCTTCGTTCAGTGTGATGTTGCCCGCCACGTTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAgg < 1:733976/150‑1 (MQ=255) aGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCACCGCCCGATCGAGCCCAACCGCCGTCGCCAGGCGCCCAGACCGCCTTCGTCCCGCGTGCGTCTGCCCCCCACGCTACGCTGCGACGGCGACCGGCGCGGGtt > 2:308640/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGa > 2:453034/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGa > 1:561529/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGa > 1:276082/1‑150 (MQ=255) cTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGag < 2:116913/150‑1 (MQ=255) acacCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGcc > 1:431082/1‑150 (MQ=255) acCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCgg < 2:223393/150‑1 (MQ=255) ctaGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTTCCAGGCGCCCCGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCggg < 1:436000/148‑1 (MQ=255) cAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCATTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGt > 1:544849/1‑150 (MQ=255) gCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTTCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCCGGAGCTGCTCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGtag > 2:436000/1‑148 (MQ=255) aaCGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAAc < 1:453034/150‑1 (MQ=255) tctTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGcc > 2:619308/1‑150 (MQ=255) ttGAAACAACTCGCTGCGCCCCATCGAGCCGAACATCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCtt < 2:43450/150‑1 (MQ=255) acTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGt < 2:36045/150‑1 (MQ=255) cTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTa > 1:244468/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTtc < 2:544849/150‑1 (MQ=255) tCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCAt > 2:120642/1‑121 (MQ=255) tCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCAt < 1:120642/121‑1 (MQ=255) cccAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGc > 2:556148/1‑150 (MQ=255) ccAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGAGCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCg > 1:435492/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGCTGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGa < 2:435492/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggatggttcgttgctggtgttcgagaagcctgag < 2:517979‑M2/150‑89 (MQ=255) ggCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGag < 2:276082/150‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGagca < 1:263803/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAg > 1:512904/1‑106 (MQ=255) ccAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAg < 2:512904/106‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggat > 1:65007‑M2/1‑55 (MQ=255) cAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggat < 2:65007‑M2/113‑59 (MQ=255) gCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggatggttcgttgctggtgttcgagaagcctgagtcacgcca < 2:188731‑M2/148‑97 (MQ=255) gCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggatggttcgttgctggtgttcgagaagcctgagtcacgcca > 1:188731‑M2/1‑52 (MQ=255) ttCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAgg < 2:678405/97‑1 (MQ=255) ttCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAgg > 1:678405/1‑97 (MQ=255) ttCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGTCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGgcgc < 1:308640/150‑1 (MQ=255) gTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGTGTGAACCACGGCATg > 1:52018/1‑75 (MQ=255) gTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATg < 2:52018/75‑1 (MQ=255) cccGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCgggcgcctggcaacggctgttgggctcgatcgggcgcagcgagttgtttcaagaggatggttcgttgctggtgttcgagaagcctgagtcacgccaggcgctggaggcgttgcgcacacgcat > 1:517979‑M2/1‑27 (MQ=255) ccGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTg > 1:351416/1‑71 (MQ=255) ccGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTg < 2:351416/71‑1 (MQ=255) gCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTtcca < 2:622680/83‑1 (MQ=255) gCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTtcca > 1:622680/1‑83 (MQ=255) gCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGGCGCTTGAGGATCGACAGGTCg < 1:297753/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGCGTGAAAAACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGGCGCTTGAGGATCGACAGGTCg < 2:648607/150‑1 (MQ=255) gctgGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGGCGCTTGAGGATCGACAGGTCGGCAATCGGGa < 2:431082/150‑1 (MQ=255) | TGGCGTGACTCAGGCTTCTCGAACACCAGCAACGAACCATCCTCTTGAAACAACTCGCTGCGCCCGATCGAGCCCAACAGCCGTTGCCAGGCGCCCAGGCTGCCTTCGTTCAGCGTGCGGATGCCCGCCACGCTGCGCTGGAACGGCGCCGGGCGCAGGTTGAGCAGCAGCCGGGTGAACCACGGCATGGCCTTGGGCAGGTACTTCCAGTCCAGGCGCAGCGGGCCCATCGGGTCGAGCAGCATGCGAGGCAGGCGCTTGAGGATCGACAGGTCGGCAATCGGGA > NC_002947/1433933‑1434218 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |