New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3978404 | 26 (0.920) | 3 (0.110) | 3/236 | NT | 9.2% | coding (2271/3762 nt) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
? | NC_002947 | = 3978429 | 34 (1.260) | coding (2246/3762 nt) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
TCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAGGCGTAGCCGCC > NC_002947/3978288‑3978570 | tcaggTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCa > 1:751480/4‑150 (MQ=255) tcaggTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCa > 1:751417/4‑150 (MQ=255) cTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCACGGTGGCAGACGAGCggggc > 2:418623/1‑148 (MQ=255) cctgccCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCg > 2:472778/1‑128 (MQ=255) cctgccCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCg < 1:472778/128‑1 (MQ=255) cctgccCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGGCGAGCGGGGCCCAGCCCg > 2:204504/1‑150 (MQ=255) ctgccCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCgg < 2:717018/150‑1 (MQ=255) gccCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCGCAGCCCGGCa > 1:679193/1‑150 (MQ=255) gATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAg > 2:79136/1‑150 (MQ=255) cTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCCGCTCTCAGTAGCAATAGAACGGGACCCAACCACGCACCAGTGGttt > 2:196412/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTg < 1:676213/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGcagcag > 1:467590/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTcc > 2:723650/1‑106 (MQ=255) cTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTcc < 1:723650/106‑1 (MQ=255) gggTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTAc < 2:467590/150‑1 (MQ=255) gCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCGCAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACg > 2:29627/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTg > 1:182507/1‑113 (MQ=255) cacaGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTg < 2:182507/113‑1 (MQ=255) cacaGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGAc < 1:196412/150‑1 (MQ=255) acaGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCa > 2:704155/1‑78 (MQ=255) acaGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCa < 1:704155/78‑1 (MQ=255) cAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCa < 2:36617/68‑1 (MQ=255) cAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCa > 1:36617/1‑68 (MQ=255) ggTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCg > 1:379681/1‑150 (MQ=255) gCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGcaa < 1:79136/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCCACAACGCcaa > 2:617301/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGgctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacccgacc < 2:275199‑M2/150‑120 (MQ=255) cAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCcagcag < 2:670960/150‑1 (MQ=255) aGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGgctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtgg < 1:546540‑M2/67‑40 (MQ=255) aGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGgctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtgg > 2:546540‑M2/1‑28 (MQ=255) tGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTa < 2:379681/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCa > 2:154828/1‑97 (MQ=255) ttCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCa < 1:154828/97‑1 (MQ=255) aGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCGCCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAg < 2:261003/150‑1 (MQ=255) gCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAGGCg > 2:357724/1‑150 (MQ=255) gTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATcc < 2:333726/143‑1 (MQ=255) gTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATcc > 1:333726/1‑143 (MQ=255) cccTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCTCTACCTTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAGGCGTAgccgc < 1:617301/150‑1 (MQ=255) ccTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAGGCGTAgccgcc > 2:491937/1‑150 (MQ=255) | TCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCAGGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCGTATCCAGGCGTAGCCGCC > NC_002947/3978288‑3978570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |