New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3494626 | 27 (1.170) | 3 (0.140) | 3/238 | NT | 11.2% | coding (102/483 nt) | PP_3098 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3494655 | 22 (1.000) | coding (73/483 nt) | PP_3098 | hypothetical protein |
GAAGTCCGGCATGCCGTATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATGTGTCATCCCTGTACACAACGGCCTTTCAGCCGCGCGCGCCCTGTGG > NC_002947/3494494‑3494774 | gaAGTCCGGCATGCCGTATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGtgcgctg > 2:39372/1‑150 (MQ=255) aGTCCGGCAGGCCGTATTCAAGGATGGCCCCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGtgcgctgcg < 2:130924/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCATGCCGTATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACAAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGtgcgctgcgc > 1:599624/1‑150 (MQ=255) cGTATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCga < 1:462927‑M2/150‑3 (MQ=255) tATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCggcc < 2:500304‑M2/150‑5 (MQ=255) aaGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGtgcgctgc > 2:570321/1‑130 (MQ=255) aaGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGtgcgctgc < 1:570321/130‑1 (MQ=255) aGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCgagcccgcagcgcagcgcacctgctcgctggccgagtac < 1:83155‑M1/150‑40 (MQ=255) gATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTa < 2:599624/150‑1 (MQ=255) aTGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAg < 1:39372/150‑1 (MQ=255) tGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAgg < 2:60311/150‑1 (MQ=255) ccaccGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGCCGAGCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGa > 1:357397/1‑150 (MQ=255) caccGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCGCGGCCGACTGGTAGGGACGAt > 1:465144/1‑150 (MQ=255) gctgAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGt > 2:559088/1‑102 (MQ=255) gctgAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGt < 1:559088/102‑1 (MQ=255) gctgAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCgg > 1:459045/1‑116 (MQ=255) gctgAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCgg < 2:459045/116‑1 (MQ=255) tgAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAgtc > 1:25530/1‑150 (MQ=255) ggAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTTGTAGGGACGATCGTCCAGCAgtc < 2:161460/149‑1 (MQ=255) gCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGa > 1:600484/1‑122 (MQ=255) gCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGa < 2:600484/122‑1 (MQ=255) ctctTCGGCGACCAGGGACTGGCGAGTCGGCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGa < 1:403116/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCgctgcgctgc > 2:119901/1‑96 (MQ=255) ttCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCgctgcgctgc < 1:119901/96‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCgagcccgcagcgcagcgcacctgctcgctggccga < 1:133211‑M1/92‑36 (MQ=255) tGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCgagcccgcagcgcagcgcacctgctcgctggccga > 2:133211‑M1/1‑57 (MQ=255) ggCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGGCGCGGACGATGCTGGTCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGCCCCGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGt < 2:71811/150‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTa < 1:500304/150‑1 (MQ=255) aCCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATgtgt > 1:315129/1‑150 (MQ=255) ccAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATGTGTc > 1:507074/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATGGTCCAGCCGTCGGTCGAGCAGCGAGGTCAGGAGGCGGGGCTGGTTACTCGTGTGTCATCCCTGTAGACAACGGCCCTTCAGcc > 2:284071/1‑150 (MQ=255) gTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCggccgagtacaaggccagcatcgtccgcgacctcgaagtcctggtgaacacccgccagtccctggtcgccgaagagctcgacggtttcagccagctcggtggttccatcct < 1:83155‑M2/150‑112 (MQ=255) tCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCggccgagtacaaggccagcatcgtccgcgacctcgaagtcctggtgaacacccgcca > 2:133211‑M2/1‑35 (MQ=255) tCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCggccgagtacaaggccagcatcgtccgcgacctcgaagtcctggtgaacacccgcca < 1:133211‑M2/92‑58 (MQ=255) tCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATGTGTCATCCCTGTACACAACGGCCTTTCAGCCGCGCGCGCCCt > 1:470859/1‑150 (MQ=255) ggCCgagcccgcagcgcagcgcacctgctcgctggccgagtacaaggccagcatcgtccgcgacctcgaagtcctggtgaacacccgccagtccctggtcgccgaagagctcgacggtttcagccagctcggtggttccatccttgaata < 2:500304‑M1/150‑147 (MQ=255) ggCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATGTGTCATCCCTGTACACAACGGCCTTTCAGCCGCGCGCGCCCtgt > 2:512414/1‑150 (MQ=255) tcgagcccgcagcgcagcgcacctgctcgctggccgagtacaaggccagcatcgtccgcgacctcgaagtcctggtgaacacccgccagtccctggtcgccgaagagctcgacggtttcagccagctcggtggttccatccttgaatacg < 1:462927‑M1/149‑149 (MQ=255) cAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCAt > 2:214142/1‑102 (MQ=255) cAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCAt < 1:214142/102‑1 (MQ=255) | GAAGTCCGGCATGCCGTATTCAAGGATGGAACCACCGAGCTGGCTGAAACCGTCGAGCTCTTCGGCGACCAGGGACTGGCGGGTGTTCACCAGGACTTCGAGGTCGCGGACGATGCTGGCCTTGTACTCGGCCAGCGAGCAGGTGCGCTGCGCTGCGGGCTCGGCCGACTGGTAGGGACGATCGTCCAGCAGTCGGTCGAGCAGCGAGGGCAGCAGGCGGGCCTGGTTACTCATGTGTCATCCCTGTACACAACGGCCTTTCAGCCGCGCGCGCCCTGTGG > NC_002947/3494494‑3494774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |